Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 725,650 | G→T | 30.4% | P204P (CCG→CCT) | rhsC → | Rhs family putative polymorphic toxin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 725,650 | 0 | G | T | 30.4% | 405.4 / 187.9 | 233 | P204P (CCG→CCT) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (92/70); new base T (32/39); total (124/109) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.17e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
CTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAGGCGCA > CP009273/725501‑725799 | cTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTgccg > 1:2707166/1‑150 (MQ=32) ggCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTgccgcc < 1:2206353/150‑1 (MQ=32) cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTa > 1:3564135/1‑150 (MQ=32) gCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTAc > 1:3783092/1‑150 (MQ=32) cACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTAcc < 1:3835420/150‑1 (MQ=17) aCTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCg < 1:1236541/150‑1 (MQ=32) ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTAc > 2:3169658/1‑150 (MQ=32) ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTAc > 2:284045/1‑150 (MQ=32) gCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACt < 1:1074387/150‑1 (MQ=17) aGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGa < 2:766760/150‑1 (MQ=32) gcgcTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGAcc < 1:3380928/150‑1 (MQ=32) cTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCggg < 2:604393/150‑1 (MQ=17) cTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCggg < 2:1687607/150‑1 (MQ=17) ccGGAATAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtg > 2:1434855/1‑150 (MQ=17) ggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggt > 2:2942314/1‑150 (MQ=32) gaagaaCTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtg > 1:1990019/1‑150 (MQ=32) aagaaCTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtgg > 2:253914/1‑150 (MQ=32) aaCTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAcc < 1:2373478/150‑1 (MQ=32) aaCTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAcc < 2:3571265/150‑1 (MQ=32) ccGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCtt > 2:2730450/1‑150 (MQ=32) gCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCg > 1:4111067/1‑150 (MQ=17) gCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCg > 1:1900440/1‑150 (MQ=32) cTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCgg > 1:2244381/1‑150 (MQ=17) cTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCgg > 1:3584868/1‑150 (MQ=17) cTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCgg > 1:3077374/1‑150 (MQ=32) tAAGTCCGCATCGTTATCTTGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGgc > 2:3853275/1‑150 (MQ=17) aaGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGgcg > 1:1471018/1‑150 (MQ=32) gTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGca < 1:1412696/150‑1 (MQ=17) ccGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcaca > 1:67994/1‑150 (MQ=32) cGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcgcac > 1:3702540/1‑150 (MQ=17) cGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcacac < 1:311842/150‑1 (MQ=17) gCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcacaca < 2:2099859/150‑1 (MQ=17) gCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcacaca > 2:1119426/1‑150 (MQ=32) gCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcacaca < 1:588069/150‑1 (MQ=32) gCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcacaca < 2:3962942/150‑1 (MQ=32) cATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAg > 2:3844799/1‑150 (MQ=32) aTCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGTCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACAGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGa > 2:3624161/1‑150 (MQ=17) aTCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGa > 1:2410069/1‑150 (MQ=32) aTCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGa > 1:3317156/1‑150 (MQ=32) aTCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGa < 1:3144578/150‑1 (MQ=32) tCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCa < 2:2348638/150‑1 (MQ=17) cTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGACGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCAc > 1:2025392/1‑150 (MQ=17) ggCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACcg > 1:1680845/1‑150 (MQ=32) 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aaCAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAgcc < 2:3356997/150‑1 (MQ=32) aCAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAgccg < 1:137900/150‑1 (MQ=32) gTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGccgccg > 2:2357092/1‑150 (MQ=32) tCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCgg > 1:2788938/1‑150 (MQ=32) tCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCgg > 1:3417565/1‑150 (MQ=32) 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cGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAgcg < 1:392241/150‑1 (MQ=17) gtggtgGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCTGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAgcgg > 2:328509/1‑150 (MQ=17) ggtggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAgcggcg > 1:1544546/1‑150 (MQ=17) ggtggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAgcggcg < 2:925411/150‑1 (MQ=32) tggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGaa > 2:4059943/1‑150 (MQ=17) ggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGaaa > 1:730430/1‑150 (MQ=32) gctgctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAAt < 2:205334/150‑1 (MQ=17) tgctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCa < 2:714731/150‑1 (MQ=32) cGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCTCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCgg > 2:1236151/1‑150 (MQ=17) cGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCgg > 2:3432965/1‑150 (MQ=32) 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ccgccgTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAGgcg < 1:1253613/150‑1 (MQ=32) gccgTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAGGCGCa > 2:2664012/1‑150 (MQ=32) | CTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAGGCGCA > CP009273/725501‑725799 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |