Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 732,494 | G→T | 56.9% | pseudogene (214/1137 nt) | ybfL → | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 732,494 | 0 | G | T | 56.9% | 44.0 / inf | 260 | pseudogene (214/1137 nt) | ybfL | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/47); new base T (88/60); total (153/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |