| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 816,152 | 0 | C | A | 38.7% | 322.1 / 259.1 | 242 | intergenic (+108/‑97) | ybhL/ybhM | UPF0005 family inner membrane protein/UPF0005 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (74/74); new base A (35/59); total (109/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.35e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
TGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCA > CP009273/816004‑816300 | tGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTACACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCg < 2:421389/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtt < 2:3622327/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGAGtt < 1:2677125/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |