Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,204,284 | C→A | 89.9% | D98Y (GAT→TAT) | tfaE ← | e14 prophage; putative tail fiber assembly protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,204,284 | 0 | C | A | 89.9% | 321.8 / 33.1 | 119 | D98Y (GAT→TAT) | tfaE | e14 prophage; putative tail fiber assembly protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/5); new base A (51/56); total (58/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01 |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TTGCAGCATCAATCAGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATCTAAAC > CP009273/1204137‑1204430 | ttGCAGCATCAATCAGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAAc < 2:2920600/150‑1 (MQ=255) tGCAGCATCAATCAGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAAcc > 1:4039909/1‑150 (MQ=255) cagcaTCAATCAGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCg > 2:2977081/1‑150 (MQ=255) atcaatcaGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGc < 1:286244/150‑1 (MQ=255) atcaatcaGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGGATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGc > 2:3965498/1‑150 (MQ=255) caatcaGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCtt > 1:2509508/1‑150 (MQ=255) aatcaGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCttt < 1:2362467/150‑1 (MQ=255) aatcaGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCttt < 2:1079767/150‑1 (MQ=255) aatcaGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCttt < 2:2880409/150‑1 (MQ=255) aatcaGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCttt < 2:3493959/150‑1 (MQ=255) atcaGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGGTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTg > 2:2015961/1‑150 (MQ=255) aGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGAtt > 1:734425/1‑150 (MQ=255) aGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGAtt < 2:3456196/150‑1 (MQ=255) aGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGAtt < 2:3456000/150‑1 (MQ=255) aGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGAtt > 1:3489602/1‑150 (MQ=255) tGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTc > 2:1370190/1‑150 (MQ=255) gACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCt > 1:3114156/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGCTGTGCTTGTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAATGGGGCTATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCtt < 1:3230106/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATACAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCTGAGCTTTGATTTCtt > 2:2803618/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCtt < 1:2856708/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCttt < 2:2813398/150‑1 (MQ=255) cgcTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGAt < 1:1934547/150‑1 (MQ=255) cTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAg < 2:2963001/150‑1 (MQ=255) cTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAg > 1:456584/1‑150 (MQ=255) cTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAg > 1:1079288/1‑150 (MQ=255) cTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAg > 1:1450434/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGttt > 1:173664/1‑150 (MQ=255) gCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTg < 2:2155422/150‑1 (MQ=255) gCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTg < 2:2155485/150‑1 (MQ=255) ccGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTgg > 1:2833025/1‑150 (MQ=255) acgagTCTACTGCGGCGAAAAGCTGTGCTTCAGAATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAAGGGCGATAGTGGTATTATTTTCAGGGTAATAACCCGTAGCATTGATTACATTTGATTCTCAAGTTTTgg > 2:1490090/5‑150 (MQ=25) gcgTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGATTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGTGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTg < 1:430977/150‑1 (MQ=255) tACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCtata < 2:2577898/150‑1 (MQ=255) tACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCtata > 1:490182/1‑150 (MQ=255) tACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCtata > 1:3939708/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGAc < 2:887544/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGAc > 1:2626349/1‑150 (MQ=255) gcTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTc > 1:1492800/1‑150 (MQ=255) cTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGt < 2:1461668/150‑1 (MQ=255) cTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGt < 2:1461955/150‑1 (MQ=255) ttCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTc < 2:1740868/150‑1 (MQ=255) tCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCt < 1:4156145/150‑1 (MQ=255) tCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCt < 1:4156215/150‑1 (MQ=255) aGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTgg < 1:2682643/150‑1 (MQ=255) tATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGAGTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGca > 2:1223310/1‑150 (MQ=255) aTCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGcac < 2:1725623/150‑1 (MQ=255) tCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGcaca > 1:1587942/1‑150 (MQ=255) cGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACat > 1:1805297/1‑150 (MQ=255) cGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACat > 1:1804925/1‑150 (MQ=255) cGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTGGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGGTTCACCGCGATGGTCTGGcacct > 2:2840837/1‑148 (MQ=255) ggTCACCCATTTCTCACAATCCCAATTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATTGACCGTTTCACAGCGATGGTCTGGCACata > 2:3551468/1‑150 (MQ=255) gTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGTTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACatat < 2:2009130/150‑1 (MQ=255) tCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCGCATAtt > 1:2429618/1‑150 (MQ=255) ctcACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGtt < 2:2245202/150‑1 (MQ=255) ctcACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGtt < 2:2245194/150‑1 (MQ=255) ctcACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGtt < 2:2245196/150‑1 (MQ=255) tcACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTa > 2:1114967/1‑150 (MQ=255) cATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAAt < 1:2473495/150‑1 (MQ=255) aTCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATc < 1:3959671/150‑1 (MQ=255) aTCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATc < 1:3959816/150‑1 (MQ=255) tCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCt < 2:3467903/150‑1 (MQ=255) tCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCt < 2:3467892/150‑1 (MQ=255) ccATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGc < 1:1302748/150‑1 (MQ=255) cATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCa > 2:2127534/1‑150 (MQ=255) cATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCa > 2:2219134/1‑150 (MQ=255) tttATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGa < 1:3038726/150‑1 (MQ=255) cGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGc > 1:163708/1‑150 (MQ=255) ggAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGAtt > 1:2054212/1‑150 (MQ=255) aTAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCAt < 1:213425/150‑1 (MQ=255) aTAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCAt < 1:213452/150‑1 (MQ=255) aaaGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATaa > 2:809421/1‑150 (MQ=255) aaaGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATaa > 2:1849163/1‑150 (MQ=255) aGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAAcc < 2:826915/150‑1 (MQ=255) gggCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAg > 2:3150326/1‑150 (MQ=255) gggCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAg > 2:3150314/1‑150 (MQ=255) ggCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGc > 1:710680/1‑150 (MQ=255) gCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGcc > 1:3270379/1‑150 (MQ=255) taTAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCtt < 2:1667503/149‑1 (MQ=255) gATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCtt > 1:2155424/1‑150 (MQ=255) gATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCtt > 2:1790463/1‑150 (MQ=255) gATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCtt > 2:1790394/1‑150 (MQ=255) tAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTAt < 1:2268497/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTAtgt < 1:3726442/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTAtgt > 2:4003375/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTAtgt < 1:3726463/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTAtgt > 2:3551823/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTAtgt < 1:3726459/150‑1 (MQ=255) gTTGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAAACAGCCTTATGTGTa > 1:2148279/1‑150 (MQ=255) tGTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTAcc < 2:382696/150‑1 (MQ=255) gTATTTTCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCAGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCa > 2:2958049/1‑150 (MQ=255) ttttCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAggg < 1:3381132/150‑1 (MQ=255) tCAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCa < 1:3086838/150‑1 (MQ=255) cAGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCAt > 2:2989417/1‑150 (MQ=255) aGGGTAATCACCCGGAGCTGTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTACCATGAGTTAAAATCTGCAGAATGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATc > 2:1476022/1‑150 (MQ=255) aGGGTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATc > 2:1468094/1‑150 (MQ=255) gggTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATCt < 2:4063094/150‑1 (MQ=255) gggTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATCt < 2:557746/150‑1 (MQ=255) ggTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATCTa < 1:2990435/150‑1 (MQ=255) ggTAATAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATCTa < 1:2990431/150‑1 (MQ=255) aaTAACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATCTAAAc < 1:918957/150‑1 (MQ=255) | TTGCAGCATCAATCAGTGACTGGCGCTGTGCTTCTGCCGCGTCTACTGCGGCGCTATGCTGTGCTTCAGTATCGGTCACCCATTTCTCACCATCCCATTTATCGTATGGAGATAAAGGGGCGATAGTGGTTGTATTTTCAGGGTAATCACCCGGAGCTTTGATTTCTTTTGATTCTCCAGTTTTGGTGCTATAGACCGTTTCACCGCGATGGTCTGGCACATATTCCCATGAGTTAAAATCTGCAGAACGGCAGATTGCATAACCAGCCTTATGTGTACCAGGGGCATCTAAAC > CP009273/1204137‑1204430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |