| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,204,620 | C→A | 8.1% | pseudogene (456/501 nt) | stfE ← | pseudogene, e14 prophage; side tail fiber protein fragment family;Phage or Prophage Related |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,204,620 | 0 | C | A | 8.1% | 493.4 / 16.6 | 130 | pseudogene (456/501 nt) | stfE | pseudogene, e14 prophage; side tail fiber protein fragment family;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/62); new base A (7/4); total (64/66) | |||||||||||
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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
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tatTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATAttt < 2:1195102/150‑1 (MQ=255) tatTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATAttt < 2:1878615/150‑1 (MQ=255) aatTACGCGGACGCGTTTCTGAGGATGCGGCACCTAAACCATCAACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATAttt > 2:269613/2‑150 (MQ=255) atTACGCGGACGCGTGTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATACTGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtc < 2:3834694/150‑1 (MQ=255) ttACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtca > 1:939172/1‑150 (MQ=255) tACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtcat < 1:680749/150‑1 (MQ=255) cgGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCaaa > 2:2258037/1‑150 (MQ=255) cgGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGATTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCaaa > 2:2258136/1‑150 (MQ=255) aCGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAATa < 1:3058587/150‑1 (MQ=255) aCGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAATa < 1:3058557/150‑1 (MQ=255) cgcgTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAATAg < 2:868558/150‑1 (MQ=255) cgTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAATAGaa < 1:378557/150‑1 (MQ=255) | TTTGAAGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAATAGAA > CP009273/1204472‑1204769 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |