| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,340,901 | 0 | A | T | 38.1% | 214.5 / 280.6 | 223 | S33S (TCT→TCA) | gmr | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase; csgD regulator; modulator of Rnase II stability |
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Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TTTCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACA > CP009273/1340752‑1341050 | tCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGa < 2:3193361/150‑1 (MQ=255) tCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGa > 2:1224180/1‑150 (MQ=255) cGTCCTACCAGATGCACAGACAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGAGGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCACTGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGaa > 2:2883010/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |