| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,457,811 | A→T | 43.5% | T6S (ACT→TCT) | paaX → | transcriptional repressor of phenylacetic acid degradation paa operon, phenylacetyl‑CoA inducer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,457,811 | 0 | A | T | 43.5% | 123.0 / inf | 244 | T6S (ACT→TCT) | paaX | transcriptional repressor of phenylacetic acid degradation paa operon, phenylacetyl‑CoA inducer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (64/74); new base T (56/50); total (120/124) | |||||||||||
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Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
TGTTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGTCTGGCCCTGGTGGGGTAAAGCGCCAGGGCCAGAAGTCGATACGACCTGTGCTATGATTCATAAATCACAACAATAACAACAGACTGAAGCGAATGAGTAAACTTGATACTTTTATCCAACATGCTGTAAACGCTGTTCCGGTCAGTGGCACATCTTTGATCTCCTCTCTGTATGGTGATTCGCTTTCCCATCGTGGTGGTGAAATCTGGTTGGGTAGTCTGGCTGCTTTGCTGGAAGGGCTGGGATTTGGTGAGCGT > CP009273/1457664‑1457960 | gtTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGTCTGGCCCTGGTGGGGTAAAGCGCCAGGGCCAGAAGTCGATACGACCTGTGCTATGATTCATAAATCACAACAATAACAACAGACTGAAGCGAATGAGTAAACTTGATACtt < 1:3359450/150‑1 (MQ=255) gtTTGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGTCTGGCCCTGGTGGGGTAAAGCGCCAGGGCCAGAAGTCGATACGACCTGTGCTATGATTCATAAATCACAACAATAACAACAGACTGAAGCGAATGAGTAAACTTGATAAtt < 1:1197656/150‑1 (MQ=255) tGATCTGCGCAATATTGTTGGTGCCTGACGTATCGTCTGGCCCTGGTGGGGTAAAGCGCCAGGGCCAGAAGTCGATACGACCTGTGCTATGATTCATAAATCACAACAATAACAACAGACTGAAGCGAATGAGTAAACTTGATTCTTTTa < 1:2409002/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |