| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,521,126 | G→A | 9.7% | intergenic (+5/‑71) | yncG → / → yncH | glutathione S‑transferase homolog/IPR020099 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,521,126 | 0 | G | A | 9.7% | 832.0 / 55.9 | 248 | intergenic (+5/‑71) | yncG/yncH | glutathione S‑transferase homolog/IPR020099 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (99/125); new base A (13/11); total (112/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAAACTAACTA > CP009273/1520978‑1521275 | gACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGa < 1:1057235/150‑1 (MQ=255) tGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATAc > 2:3996643/1‑150 (MQ=255) gTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATAcc < 2:1206200/150‑1 (MQ=255) ttATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCa < 2:1954431/150‑1 (MQ=255) ttATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCa < 1:2365448/150‑1 (MQ=255) ttATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCa < 1:219391/150‑1 (MQ=255) ttATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCa < 1:219260/150‑1 (MQ=255) tATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCag > 2:2537284/1‑150 (MQ=255) tATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCag < 2:88028/150‑1 (MQ=255) tCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCagaa < 2:3457320/150‑1 (MQ=255) ttGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGAt < 1:608292/150‑1 (MQ=255) tGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGAtt > 1:3718557/1‑150 (MQ=255) cACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTAt > 2:2639907/1‑150 (MQ=255) aCTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATg > 1:3445553/1‑150 (MQ=255) aTGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGtta > 1:1006927/1‑150 (MQ=255) aTGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGtta < 2:3761038/150‑1 (MQ=255) tGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttat > 1:783158/1‑150 (MQ=255) tGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttat > 1:2871693/1‑150 (MQ=255) cgcACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttattt < 1:1748686/150‑1 (MQ=255) gcACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGttattta < 1:3312629/150‑1 (MQ=255) caTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATttatta < 2:2217757/150‑1 (MQ=255) tGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTattatt > 2:3561407/1‑150 (MQ=255) gggggCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTc < 1:669781/150‑1 (MQ=255) gggggCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATGATTc > 1:455715/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGt > 1:4166297/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTaa > 2:2453648/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTaa > 2:2261441/1‑150 (MQ=255) cTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAAc > 1:248564/1‑150 (MQ=255) cTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAAc > 1:2935782/1‑150 (MQ=255) gggCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACtt > 2:2849629/1‑150 (MQ=255) ggCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACttt < 2:2107982/150‑1 (MQ=255) gCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTa < 2:3283172/150‑1 (MQ=255) aaTGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCcac > 1:2701402/1‑150 (MQ=255) aTGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCcaca > 2:2760912/1‑150 (MQ=255) aTGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCcaca > 1:1086601/1‑150 (MQ=255) tGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACaa < 2:2625911/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAatg < 1:1208096/150‑1 (MQ=255) tCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAatgatg < 1:1414048/150‑1 (MQ=255) tCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAatgatg < 1:1657439/150‑1 (MQ=255) aGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATggg < 2:1326257/150‑1 (MQ=255) aGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATggg > 1:55001/1‑150 (MQ=255) aTAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGt > 2:3393488/1‑150 (MQ=255) aaTGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGtaa > 1:744928/1‑150 (MQ=255) aaTGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTAATTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGtaa < 2:2987517/150‑1 (MQ=255) gCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGtaatta > 2:36751/1‑150 (MQ=255) gCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTAGTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGtaatta > 2:670234/1‑150 (MQ=255) cACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGtaattaat > 2:3731463/1‑150 (MQ=255) aCGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTaattaatt < 2:2031300/150‑1 (MQ=255) tgAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAattaatta < 2:2446475/149‑1 (MQ=255) aaTATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTaaa > 1:3910713/1‑150 (MQ=255) atCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTc > 1:2055587/1‑150 (MQ=255) cAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCAt < 2:438664/150‑1 (MQ=255) cAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCAt < 1:2576104/150‑1 (MQ=255) aGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATg > 2:1236997/1‑150 (MQ=255) tGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGt < 2:2699274/150‑1 (MQ=255) gCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTa < 1:2684387/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTAt < 2:555350/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTAt < 1:694365/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTAt > 1:1239175/1‑150 (MQ=255) cGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTAt < 1:109563/150‑1 (MQ=255) gATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATg > 1:534664/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGtttt > 2:1154357/1‑150 (MQ=255) tGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAt > 2:3031430/1‑150 (MQ=255) gCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAtt < 1:3603994/150‑1 (MQ=255) tGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTta > 2:3441636/1‑150 (MQ=255) gTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTtat < 1:3816846/150‑1 (MQ=255) aTGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTatat > 2:3235106/1‑150 (MQ=255) aTGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTatat > 1:2595438/1‑150 (MQ=255) aTGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTatat < 2:749879/150‑1 (MQ=255) gTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCa < 1:2881954/150‑1 (MQ=255) tCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTAATTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCAc < 2:4143462/150‑1 (MQ=255) gTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCActct < 1:3137027/150‑1 (MQ=255) ttACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACtctc > 2:1025437/1‑150 (MQ=255) gAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCtttt < 2:115943/150‑1 (MQ=255) aaaTTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttc < 2:2307538/150‑1 (MQ=255) aaTTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttca < 1:1984781/150‑1 (MQ=255) ttACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttcatt > 2:1523790/1‑150 (MQ=255) tACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttcattc < 1:2117281/150‑1 (MQ=255) aCAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttcattca > 1:1317127/1‑150 (MQ=255) agaagTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCg > 1:1885982/1‑150 (MQ=255) tATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCt < 1:1902720/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTat < 1:979138/150‑1 (MQ=255) tAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatt > 1:3015067/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTattt > 2:1843725/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTattt > 2:1443979/1‑150 (MQ=255) aaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttc > 1:331427/1‑150 (MQ=255) aaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttcat > 1:1302414/1‑150 (MQ=255) gAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttcatttc < 1:1560383/150‑1 (MQ=255) tGAACTTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATGTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATGTCctc < 2:1890205/150‑1 (MQ=255) tGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCctc < 2:1387452/150‑1 (MQ=255) gAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTTTCTATTTCATTTCctat > 1:285288/1‑148 (MQ=255) gAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCctct < 2:3114489/150‑1 (MQ=255) gAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCctct < 2:4103891/150‑1 (MQ=255) gAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCctct < 2:4104257/150‑1 (MQ=255) gAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCctct < 2:1894105/150‑1 (MQ=255) aaaTTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTg > 1:1187447/1‑150 (MQ=255) ttattTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGaaa > 1:3216646/1‑150 (MQ=255) ggATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaactaact < 1:3519584/150‑1 (MQ=255) gATACCAGAAGTTTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTTTGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAAactaacta < 2:3282150/150‑1 (MQ=255) gATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAAactaacta < 1:1781702/150‑1 (MQ=255) | GACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAAACTAACTA > CP009273/1520978‑1521275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |