| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,575,339 | G→T | 100% | F481L (TTC→TTA) | ydeN ← | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,575,339 | 0 | G | T | 97.3% | 742.1 / 10.1 | 222 | F481L (TTC→TTA) | ydeN | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/1); new base T (106/109); total (112/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
ACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGTGG > CP009273/1575193‑1575485 | aCCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAAt > 1:1227624/1‑150 (MQ=255) cACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTg < 2:210690/150‑1 (MQ=255) cACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTg < 2:4019844/150‑1 (MQ=255) aCGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTgg > 2:149175/1‑150 (MQ=255) aCGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTgg < 1:1610825/150‑1 (MQ=255) cGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGc < 2:290458/150‑1 (MQ=255) ccTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCtt < 2:1867036/150‑1 (MQ=255) ccTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCtt < 2:4138450/150‑1 (MQ=255) cTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTa < 2:2372295/150‑1 (MQ=255) ttGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTaa < 1:3486267/150‑1 (MQ=255) tGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAg < 1:3182765/150‑1 (MQ=255) gCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGt < 1:3807834/150‑1 (MQ=255) cATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTc > 2:4047184/1‑150 (MQ=255) tctcTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCt < 2:3406151/150‑1 (MQ=255) tctcTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCt < 2:3469902/150‑1 (MQ=255) tctatcaCGACCTGCGGTTTGGCGGCGGCAATGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCa < 1:2031451/144‑1 (MQ=255) tctTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTTTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCa < 2:1789226/150‑1 (MQ=255) tAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAgtgt > 2:3021438/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGt > 1:3061209/1‑150 (MQ=255) cTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGtt > 1:3892625/1‑150 (MQ=255) ggATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGc < 2:1895051/150‑1 (MQ=255) aTTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCgg > 2:3978504/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGt < 1:2158113/150‑1 (MQ=255) gcggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCg < 1:1322320/150‑1 (MQ=255) aggcAAGGTTATCATTTAGCTGTATATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGAAATCTACTGTCTAGACAAGCGAATAATCTTTATTTATCACCGTAAAAGATAATTGGCAAACGACCTCCGTGTGGGGGTTAAGCGGGTAAACGt > 2:2769687/2‑150 (MQ=255) ggcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTc > 1:628070/1‑150 (MQ=255) gcAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTct < 2:3891565/150‑1 (MQ=255) cAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTctg > 1:1284403/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATg < 1:924965/150‑1 (MQ=255) aTCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATg < 1:3575150/150‑1 (MQ=255) aTCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATg < 1:3477794/150‑1 (MQ=255) tttttGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCg < 2:3944100/150‑1 (MQ=255) tGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACa > 1:4018522/1‑150 (MQ=255) tGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAAt < 2:2651103/150‑1 (MQ=255) tGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAAt < 2:427949/150‑1 (MQ=255) aGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg > 1:3326110/1‑150 (MQ=255) gATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtgt < 1:3104350/150‑1 (MQ=255) tCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTgg > 2:1616861/1‑150 (MQ=255) ccGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGt < 1:2948926/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGt < 1:2949422/150‑1 (MQ=255) cGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAGGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTa > 1:3211516/1‑150 (MQ=255) cGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTa < 1:197436/150‑1 (MQ=255) cGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTa > 1:2889841/1‑150 (MQ=255) gTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGACCAAATTTGTGGTaa > 2:1402608/1‑150 (MQ=255) gTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTaa < 1:4119337/150‑1 (MQ=255) tCAGTTTGTAGAGACCTATCTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAAt < 2:53929/150‑1 (MQ=255) tCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAAt < 1:1814289/150‑1 (MQ=255) aGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTa < 2:2848129/150‑1 (MQ=255) aGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTa < 1:3750515/150‑1 (MQ=255) tttGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATc < 2:2498949/150‑1 (MQ=255) tGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATccc < 2:275512/150‑1 (MQ=255) agagACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGa > 1:50500/1‑150 (MQ=255) agagACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGa > 1:1769504/1‑150 (MQ=255) agaCCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAAt > 1:1430269/1‑150 (MQ=255) gaCCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATg < 1:1013808/150‑1 (MQ=255) gaCCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATg > 1:2241187/1‑150 (MQ=255) aaCTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCTGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAata > 1:3492728/1‑150 (MQ=255) aCTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAatat > 2:2253793/1‑150 (MQ=255) cTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATAtt > 2:739941/1‑150 (MQ=255) tGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATAttt < 2:1400875/150‑1 (MQ=255) gATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATAtttt < 1:502521/150‑1 (MQ=255) gATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATAtttt > 1:2767786/1‑150 (MQ=255) gATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATAtttt > 2:880559/1‑150 (MQ=255) gATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATAtttt > 2:880793/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTc < 2:1933462/150‑1 (MQ=255) tGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCt < 1:1986785/150‑1 (MQ=255) gTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTc > 1:2375945/1‑150 (MQ=255) gTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTc > 1:2707308/1‑150 (MQ=255) tttCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGt > 1:892161/1‑150 (MQ=255) tttCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGt > 2:1192811/1‑150 (MQ=255) tCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCa > 1:3371272/1‑150 (MQ=255) cTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAAcc < 2:1702859/150‑1 (MQ=255) tGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCa > 1:785059/1‑150 (MQ=255) tGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCa > 1:300298/1‑150 (MQ=255) gTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAg > 2:3715551/1‑150 (MQ=255) ataGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATACTTTCCTCGTCAAACCAGTg < 2:1006914/150‑1 (MQ=255) taGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTga > 2:2300491/1‑150 (MQ=255) taGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTga < 1:1327744/150‑1 (MQ=255) aaGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATa > 2:2405949/1‑150 (MQ=255) aaGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATa > 2:1858342/1‑150 (MQ=255) aaGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATa > 1:2095564/1‑150 (MQ=255) aataatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAgg < 1:1692716/150‑1 (MQ=255) aataatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAgg > 2:3227890/1‑150 (MQ=255) ataatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGt < 1:1167879/150‑1 (MQ=255) taatCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGtt < 1:1287740/150‑1 (MQ=255) aatTGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTa > 1:2345143/1‑150 (MQ=255) atCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTAt < 1:3176177/150‑1 (MQ=255) atCGTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTAt > 1:2476951/1‑150 (MQ=255) gTTATTTCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCa < 2:1952820/150‑1 (MQ=255) tttCTCACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTc > 2:793926/1‑150 (MQ=255) ctcACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGa < 2:2770187/150‑1 (MQ=255) ctcACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTGGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGa < 2:63086/150‑1 (MQ=255) tcACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGAt > 2:1350105/1‑150 (MQ=255) cACCGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGAtt < 1:3441310/150‑1 (MQ=255) cGTATAAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGAttttt > 2:2037961/1‑150 (MQ=255) cGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGAttttt > 2:3829399/1‑150 (MQ=255) ataAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTAtg < 2:3934642/150‑1 (MQ=255) taAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTAtgt > 1:3062360/1‑150 (MQ=255) taAGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTAtgt < 2:3302940/150‑1 (MQ=255) aaGATAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTAtgtg > 1:1797296/1‑150 (MQ=255) | ACCACGCCTTGCATCTCTTTAACGACCTGCGGATTGGCGGCGGCAAGGTTATCTTTTTGCTGTAGATCCGTCAGTTTGTAGAGACCTAACTGATTGTTTTCTACTGTATAGACAAGCGAATAATCGTTATTTCTCACCGTATAAGAGAATTGGCTTAAGTCCTCAGTGTTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTGTGGTAATTATCCCAGAATGGAATATTTTCCTCGTCAAACCAGTGAGAATAAGAGGTTATCCAGGTCAGATTTTTATGTGG > CP009273/1575193‑1575485 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |