| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,593,900 | G→T | 27.0% | N189K (AAC→AAA) | lsrK ← | autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,593,900 | 0 | G | T | 27.0% | 599.2 / 180.4 | 259 | N189K (AAC→AAA) | lsrK | autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (89/100); new base T (30/40); total (119/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
CAGAGTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTGTCC > CP009273/1593751‑1594049 | cAGAGTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCg < 2:2989763/150‑1 (MQ=255) gagTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCttt > 2:944779/1‑150 (MQ=255) agTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTa > 1:4063026/1‑150 (MQ=255) agTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTa > 1:3152466/1‑150 (MQ=255) agTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTa < 2:1103587/150‑1 (MQ=255) tCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTagag > 1:3764601/1‑150 (MQ=255) cgccgcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAggg > 1:3716925/1‑150 (MQ=255) gccgcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGa < 1:1906620/150‑1 (MQ=255) gcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATcc > 2:624820/1‑150 (MQ=255) gcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATcc > 1:366169/1‑150 (MQ=255) gtgAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCg > 2:3976370/1‑150 (MQ=255) tACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTc < 1:1789451/150‑1 (MQ=255) tACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTc < 2:3198590/150‑1 (MQ=255) tACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTc < 1:1463508/150‑1 (MQ=255) tACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTc < 2:3063413/150‑1 (MQ=255) cACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTcgcc < 2:309029/150‑1 (MQ=255) aaTGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCata > 1:3200917/1‑150 (MQ=255) aTGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCatat < 1:690463/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCAtata > 2:2327259/1‑150 (MQ=255) gtgCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAg < 2:1845299/150‑1 (MQ=255) tgCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAgg > 1:237635/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgcc > 2:3915828/1‑150 (MQ=255) ggTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccag > 2:744903/1‑150 (MQ=255) gTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagc > 1:2439853/1‑150 (MQ=255) gTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagc < 2:2940800/150‑1 (MQ=255) tttCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagcc > 1:1768335/1‑150 (MQ=255) tttCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagcc > 1:1675153/1‑150 (MQ=255) tttGACAGGTGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGTAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGATCATATAGGCCAGCCAGTc < 2:1620380/150‑1 (MQ=255) tGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGc > 2:4125988/1‑150 (MQ=255) tGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGc > 2:2731443/1‑150 (MQ=255) aCAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTg > 2:3372345/1‑150 (MQ=255) aGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGAt > 2:2661845/1‑150 (MQ=255) ggAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATc < 2:34281/150‑1 (MQ=255) ggAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATc < 1:204912/150‑1 (MQ=255) aaagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATgg < 1:9754/150‑1 (MQ=255) aagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGt < 1:885760/150‑1 (MQ=255) aagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGt > 2:833751/1‑150 (MQ=255) gaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGa > 2:142318/1‑150 (MQ=255) tCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGtt < 1:634392/150‑1 (MQ=255) ggCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGa < 2:3429811/150‑1 (MQ=255) ggCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGa > 2:2648584/1‑150 (MQ=255) ggCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGa > 1:3647605/1‑150 (MQ=255) ggCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGa > 1:3369687/1‑150 (MQ=255) cACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGGTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATg < 2:3508024/150‑1 (MQ=255) cGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGcc > 1:3793087/1‑150 (MQ=255) gTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATTTAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCt < 2:1066068/150‑1 (MQ=255) gTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTGAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCt > 2:1981542/1‑150 (MQ=255) tAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTg < 2:2843094/150‑1 (MQ=255) tAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTg < 2:1819672/150‑1 (MQ=255) tAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTg > 2:3629289/1‑150 (MQ=255) aGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGa > 2:367082/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGAc < 1:1063028/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGAc < 1:1231068/150‑1 (MQ=255) atatCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAata < 1:2291094/150‑1 (MQ=255) atCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAGGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATc < 1:2877292/150‑1 (MQ=255) ccAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGCTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCgg < 1:2141092/150‑1 (MQ=255) ccAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCgg < 1:2791644/150‑1 (MQ=255) aGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGaa > 1:631809/1‑150 (MQ=255) gCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAAc < 1:3126996/150‑1 (MQ=255) gCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAAc < 1:1489501/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGAt > 2:331834/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATg < 2:1834283/150‑1 (MQ=255) gCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATgg < 1:2674563/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGt > 2:568122/1‑150 (MQ=255) aGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTg < 2:168161/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTgc < 2:2152075/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTgc < 2:3798516/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTgc < 1:829552/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTgc < 1:829526/150‑1 (MQ=255) tCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgcca < 1:4109966/150‑1 (MQ=255) gTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgccagcca < 1:1113681/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGt < 2:2753391/150‑1 (MQ=255) gtggtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAAt < 1:532373/150‑1 (MQ=255) ggtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCt > 1:3913330/1‑150 (MQ=255) ggtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCt < 2:1302817/150‑1 (MQ=255) gtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTg < 1:2073691/150‑1 (MQ=255) gtTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTg > 1:3170487/1‑150 (MQ=255) ttAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTgg < 1:1707455/150‑1 (MQ=255) tAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTggg > 1:1442630/1‑150 (MQ=255) tAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTggg > 1:2010048/1‑150 (MQ=255) aGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTgggg < 1:2779105/150‑1 (MQ=255) aGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTgggg > 2:3840656/1‑150 (MQ=255) aTCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGAt < 2:1372172/150‑1 (MQ=255) aTCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGAt < 1:1243942/150‑1 (MQ=255) tCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATg < 1:524076/150‑1 (MQ=255) tCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATg < 1:4137377/150‑1 (MQ=255) aagaagTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATTGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATTGc < 1:2919196/150‑1 (MQ=255) aagaagTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGc > 1:2619192/1‑150 (MQ=255) aagTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACt < 2:487899/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGc < 2:1582360/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGc > 2:18701/1‑150 (MQ=255) tggtgCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCa > 2:1565697/1‑150 (MQ=255) gtgCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAgt < 2:2529730/150‑1 (MQ=255) gtgCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAgt < 2:2611699/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGtt > 1:922593/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGtt > 1:4014441/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGtt < 1:3094383/150‑1 (MQ=255) cAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGttt > 1:3925935/1‑150 (MQ=255) aGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTg > 2:3989602/1‑150 (MQ=255) gTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTGTcc < 1:1284458/150‑1 (MQ=255) | CAGAGTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTGTCC > CP009273/1593751‑1594049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |