Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,646,993 | C→T | 46.8% | intergenic (+28/+19) | intQ → / ← ydfJ | pseudogene, Qin prophage; phage integrase family;Phage or Prophage Related/pseudogene, MFS transporter family; interrupted by Qin prophage;Phage or Prophage Related; putative transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,646,993 | 0 | C | T | 46.8% | 76.5 / inf | 233 | intergenic (+28/+19) | intQ/ydfJ | pseudogene, Qin prophage; phage integrase family;Phage or Prophage Related/pseudogene, MFS transporter family; interrupted by Qin prophage;Phage or Prophage Related; putative transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (62/62); new base T (71/38); total (133/100) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.42e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTACTTACTC > CP009273/1646845‑1647139 | ggTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCa < 1:2743990/150‑1 (MQ=255) gTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATACTGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCAt < 2:1578839/150‑1 (MQ=255) tATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATg > 1:3329499/1‑150 (MQ=255) tATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATg < 1:457119/150‑1 (MQ=255) tATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATg < 1:2470557/150‑1 (MQ=255) aTTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGa < 2:3344287/150‑1 (MQ=255) tataCGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGaa > 2:3231474/1‑150 (MQ=255) taCGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAAt < 1:1226175/150‑1 (MQ=255) ggAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCa > 2:943479/1‑150 (MQ=255) gAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCAt > 1:28574/1‑150 (MQ=255) aaaaTGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATa < 1:1677193/150‑1 (MQ=255) aTGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAAt > 2:3122603/1‑150 (MQ=255) aTGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAAt > 1:1760995/1‑150 (MQ=255) tGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAAtt < 2:1263972/150‑1 (MQ=255) tGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAAtt < 1:806936/150‑1 (MQ=255) ggATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATATTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCCAAAATTc > 1:214125/1‑150 (MQ=255) gTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAgc < 1:3705447/150‑1 (MQ=255) tCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAgcg < 1:33600/150‑1 (MQ=255) aaaCAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTg > 1:1069954/1‑150 (MQ=255) aataatGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCa > 2:568717/1‑150 (MQ=255) aataatGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCa < 1:2935794/150‑1 (MQ=255) ataatGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAg > 2:1357788/1‑150 (MQ=255) aatGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGcc < 2:3512453/150‑1 (MQ=255) tGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCAt < 2:1948570/150‑1 (MQ=255) gCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATc < 2:1116029/150‑1 (MQ=255) gCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATc < 1:903160/150‑1 (MQ=255) caGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCg < 1:1973411/150‑1 (MQ=255) caGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCg < 1:3181931/150‑1 (MQ=255) gTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATa > 2:2949045/1‑150 (MQ=255) gTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATa > 1:1501542/1‑150 (MQ=255) tAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATAc > 1:663066/1‑150 (MQ=255) aGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATAct < 1:218392/150‑1 (MQ=255) aGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATAct > 1:3873378/1‑150 (MQ=255) ttGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATActgctg < 2:278301/150‑1 (MQ=255) gTTAAATACAAAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAATCAATGAAAAATTAATTTAATAAATATCAAATAGTTAACACGCATGACTATTTAAATCCAAAAATTCAAGCCCAGAGCCCAGCCATCCCGATACTgctgct > 2:1834168/1‑150 (MQ=255) ttAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCtt > 2:2622261/1‑150 (MQ=255) tAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATACAAGCGCAGTGCCCCGCCATCCCGATACTGCTGCttt > 2:342609/1‑150 (MQ=255) tAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCttt < 2:1641680/150‑1 (MQ=255) aaaTACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTc > 1:413118/1‑150 (MQ=255) aaTACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCa > 2:3384456/1‑150 (MQ=255) aaTACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCa < 1:3247457/150‑1 (MQ=255) gTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATcc < 1:2798960/150‑1 (MQ=255) gTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATcc < 1:1806259/150‑1 (MQ=255) ttAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCt < 2:2939340/150‑1 (MQ=255) aaGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTa > 2:1784215/1‑150 (MQ=255) aaGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTa > 2:3189196/1‑150 (MQ=255) aaGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTa > 2:974850/1‑150 (MQ=255) tttGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGcttc > 1:600530/1‑150 (MQ=255) ttGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGcttct < 1:1035002/150‑1 (MQ=255) gCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCttt > 1:2631878/1‑150 (MQ=255) cccAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCg < 2:3802595/150‑1 (MQ=255) cAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCgtg > 2:3152880/1‑150 (MQ=255) aCCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGtt > 1:3598433/1‑150 (MQ=255) aCCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGtt > 2:1735729/1‑150 (MQ=255) cccATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTAt < 2:2162111/150‑1 (MQ=255) ccATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTAtt > 1:2536725/1‑150 (MQ=255) cATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTg > 1:1618482/1‑150 (MQ=255) aTAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGt < 2:1801229/150‑1 (MQ=255) tAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTc > 1:2471103/1‑150 (MQ=255) tAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTc < 1:1932459/150‑1 (MQ=255) aaCGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCa > 1:2166392/1‑150 (MQ=255) aCGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCAt < 1:3401843/150‑1 (MQ=255) cGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAACTCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATa > 2:1672476/1‑150 (MQ=255) cGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATa > 2:1672544/1‑150 (MQ=255) cGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATa < 2:3645185/150‑1 (MQ=255) gAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATaa > 1:2023682/1‑150 (MQ=255) gAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATaa < 2:1395694/150‑1 (MQ=255) gAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGAGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATaa > 1:2828298/1‑150 (MQ=255) aaGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAAt > 2:1634981/1‑150 (MQ=255) aGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATg < 2:654823/150‑1 (MQ=255) cAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGt < 2:680072/150‑1 (MQ=255) aaTGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGtt > 2:1114235/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAt > 1:3641870/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAt > 2:460425/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAt > 1:3842176/1‑150 (MQ=255) gAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtc > 1:960886/1‑150 (MQ=255) gAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtc > 2:1434206/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtct < 1:69038/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtct > 2:1810978/1‑150 (MQ=255) aaaaTTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtctc > 1:3658180/1‑150 (MQ=255) aaaTTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATctct > 2:874436/1‑150 (MQ=255) aattaattTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTa > 1:633446/1‑150 (MQ=255) aattaattTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTa < 1:3687137/150‑1 (MQ=255) aattaattTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTa < 2:4079616/150‑1 (MQ=255) attaattTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTaa < 2:1156211/150‑1 (MQ=255) aatttaatATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTaaaaa > 2:3250214/1‑150 (MQ=255) taatATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAagag < 1:2787089/150‑1 (MQ=255) taatATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAagag > 2:3826282/1‑150 (MQ=255) aTCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATg < 1:2895127/150‑1 (MQ=255) aTCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATg > 2:671981/1‑150 (MQ=255) tCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCCTAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGc > 1:3483374/1‑150 (MQ=255) tCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGc < 2:435556/150‑1 (MQ=255) aaaTAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGt < 1:2237752/150‑1 (MQ=255) aaaTAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGt > 1:1868143/1‑150 (MQ=255) aaTAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCCAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGta > 2:2864770/1‑150 (MQ=255) aaTAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGta > 1:3423881/1‑150 (MQ=255) aTAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGtac < 1:1304145/150‑1 (MQ=255) tAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGtact < 1:3572965/150‑1 (MQ=255) gTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGtactac > 1:3787190/1‑150 (MQ=255) tAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACtactt > 1:476864/1‑150 (MQ=255) | GGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTACTTACTC > CP009273/1646845‑1647139 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |