Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 134,203 | G→T | 8.9% | D212Y (GAT→TAT) | cueO → | multicopper oxidase (laccase) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 134,203 | 0 | G | T | 8.9% | 1125.5 / 55.2 | 302 | D212Y (GAT→TAT) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (169/106); new base T (11/16); total (180/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.14e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.64e-01 |
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
TGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGT > CP009273/134055‑134352 | tGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGa > 2:3009060/1‑150 (MQ=255) aTGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGt > 1:189228/1‑150 (MQ=255) cGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCt > 2:2076115/1‑150 (MQ=255) gagaTCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTg > 1:2386920/1‑150 (MQ=255) gagaTCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTg > 1:1199959/1‑150 (MQ=255) agaTCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGa < 2:780935/150‑1 (MQ=255) tCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCa > 1:2900188/1‑150 (MQ=255) cTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAAc > 1:1795957/1‑150 (MQ=255) tGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACg > 1:771864/1‑150 (MQ=255) gAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCAACgg < 2:2199215/150‑1 (MQ=255) gAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACgg > 2:473036/1‑150 (MQ=255) ttAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCa > 2:721419/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAAt > 1:2490764/1‑150 (MQ=255) ctgcCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTAc > 1:1281451/1‑150 (MQ=255) ctgcCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTAc > 2:2440648/1‑150 (MQ=255) ctgcCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTAc < 2:3515506/150‑1 (MQ=255) gcCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTAccc < 1:1953710/150‑1 (MQ=255) ccAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCg > 1:1096097/1‑150 (MQ=255) cAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGc > 1:2818297/1‑150 (MQ=255) aaCAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAac > 2:1475733/1‑150 (MQ=255) aaCAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAac < 2:3223553/150‑1 (MQ=255) cAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAacac > 1:3613746/1‑150 (MQ=255) aGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACg > 2:3302797/1‑150 (MQ=255) aGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACg < 1:248590/150‑1 (MQ=255) tGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCt < 1:1113929/150‑1 (MQ=255) tGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCt < 1:2341454/150‑1 (MQ=255) tGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCt > 2:1814302/1‑150 (MQ=255) ggTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGcc > 1:279063/1‑150 (MQ=255) tATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGccct < 1:535280/150‑2 (MQ=255) aTCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCcg < 1:1364433/150‑1 (MQ=255) cGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCcgcg < 1:251097/150‑1 (MQ=255) cGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCcgcg < 2:1653700/150‑1 (MQ=255) gatgatGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGt > 1:1529587/1‑150 (MQ=255) atgatgTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTg > 2:3382279/1‑150 (MQ=255) gatgTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGt > 1:2997228/1‑150 (MQ=255) gatgTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGt > 2:2854205/1‑150 (MQ=255) atgTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGtt > 2:2168719/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCt > 2:70037/1‑150 (MQ=255) cGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTgc > 1:1408568/1‑150 (MQ=255) ggTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATAATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTgcg > 2:2723132/1‑150 (MQ=255) gATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCt < 2:2611302/150‑1 (MQ=255) gATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCt < 1:32215/150‑1 (MQ=255) aTCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTg < 1:1631156/150‑1 (MQ=255) cGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCg < 1:3695231/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGt > 1:591015/1‑150 (MQ=255) gTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGt > 1:684054/1‑150 (MQ=255) ttCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGtt > 1:425752/1‑150 (MQ=255) tCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGttt < 2:3650422/150‑1 (MQ=255) cAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTg < 2:1300375/150‑1 (MQ=255) cAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTg < 2:859023/150‑1 (MQ=255) cAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTg > 2:2105072/1‑150 (MQ=255) cAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGATGCCCCGCGAGGATGGCTGCGCCTGCGTTTg > 1:230182/1‑150 (MQ=255) aTAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCa < 2:3945510/150‑1 (MQ=255) tAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCaa > 1:2626565/1‑150 (MQ=255) tAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCaa > 1:1500605/1‑150 (MQ=255) tAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCaa > 2:3885941/1‑150 (MQ=255) tAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCaa > 2:1036413/1‑150 (MQ=255) gAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCTATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATgg < 2:322811/150‑1 (MQ=255) aaaTTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGc > 2:1798170/1‑150 (MQ=255) aaTTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCt > 1:711520/1‑150 (MQ=255) tAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTaa > 1:3782646/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAAt < 1:924134/150‑1 (MQ=255) cgcCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGc < 2:1887216/150‑1 (MQ=255) ccGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGccc > 2:316945/1‑150 (MQ=255) gACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGt > 1:2580111/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTc > 1:3278412/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTc > 1:836423/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTc > 2:1172120/1‑150 (MQ=255) aGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCa > 1:3391805/1‑150 (MQ=255) aGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCa > 2:1414978/1‑150 (MQ=255) aGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCa > 2:298244/1‑150 (MQ=255) gattgattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCaa > 1:1120399/1‑150 (MQ=255) gattgattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCaa > 2:3340204/1‑150 (MQ=255) gattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAAttta < 1:304818/150‑2 (MQ=255) gattATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTc > 2:1337490/1‑150 (MQ=255) attATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTct > 2:2331711/1‑149 (MQ=255) attATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCg > 1:3826739/1‑150 (MQ=255) ttATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGc > 1:209736/1‑150 (MQ=255) aTCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGcca > 1:1459768/1‑150 (MQ=255) cAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGccacc > 2:441550/1‑150 (MQ=255) aaCTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGccacca > 1:69473/1‑150 (MQ=255) cTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGc > 2:2246630/1‑150 (MQ=255) cTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGc > 2:1314769/1‑150 (MQ=255) gATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGAAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTTATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGAc < 1:613655/150‑1 (MQ=255) gtgATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAAt < 2:3909191/150‑1 (MQ=255) tgatgaCCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATc < 2:914611/150‑1 (MQ=255) tgatgaCCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATc < 2:1578771/150‑1 (MQ=255) cgccgccgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCt < 2:3619311/150‑1 (MQ=255) cgccgccgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCt < 2:166181/150‑1 (MQ=255) cgccgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTa > 1:3506483/1‑150 (MQ=255) ccgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTAtg < 1:4114846/150‑1 (MQ=255) ccgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTAtg < 1:1540076/150‑1 (MQ=255) ccgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTAtg < 2:1445649/150‑1 (MQ=255) cgTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTAtgt < 2:2943585/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGAtt > 1:2256768/1‑150 (MQ=255) ggCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGAtt < 2:2401290/150‑1 (MQ=255) gCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTg < 2:3775101/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCGATACGTTGCTGGCCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAg < 1:3749176/150‑1 (MQ=255) ggCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGAc > 2:2915195/1‑150 (MQ=255) ggCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGAc > 1:2138821/1‑150 (MQ=255) | TGAAGATGACGAGATCCTGAAATTAATGCTGCCAAAACAGTGGGGTATCGATGATGTTCCGGTGATCGTTCAGGATAAGAAATTTAGCGCCGACGGGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGT > CP009273/134055‑134352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |