| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,813,497 | C→A | 11.2% | D70Y (GAT→TAT) | chbR ← | repressor of chb operon for N,N'‑diacetylchitobiose utilization |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,813,497 | 0 | C | A | 11.2% | 780.8 / 48.9 | 220 | D70Y (GAT→TAT) | chbR | repressor of chb operon for N,N'‑diacetylchitobiose utilization |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (112/83); new base A (9/16); total (121/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.44e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
GTATACCTGCGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGTTTTTGCCATTA > CP009273/1813348‑1813645 | taCCTGCGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGcc > 2:3867353/1‑150 (MQ=255) ccTGCGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGcccc < 1:3730791/150‑1 (MQ=255) ccTGCGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGcccc < 1:674626/150‑1 (MQ=255) cTGCGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCg > 2:2192931/1‑150 (MQ=255) cTGCGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCg > 2:1750876/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATAGCCCCGTTc < 1:1585412/150‑1 (MQ=255) cGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATAGCCCCGTTc < 1:1585507/150‑1 (MQ=255) gAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTcc < 1:3493724/150‑1 (MQ=255) gAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTcc < 1:2299250/150‑1 (MQ=255) aaGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATTCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCgaacca > 1:1027252/1‑145 (MQ=255) aaGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCa < 2:2504841/150‑1 (MQ=255) aGCGACAAAGCAATAAGTCAACAATGGCAGGTAATTCTGCTCAAAAAAGAGAATACAGATCCCAAATTTCAATATGCGCGTGGCAACAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGAGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCTCCCCGTACCAg > 2:1327072/1‑150 (MQ=255) aGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAg > 1:1211443/1‑150 (MQ=255) gCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGt < 1:1311179/150‑1 (MQ=255) cGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTa > 1:2037598/1‑150 (MQ=255) aCAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAac > 2:1801221/1‑150 (MQ=255) aCAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAac > 2:2200836/1‑150 (MQ=255) aCAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAac > 2:1108694/1‑150 (MQ=255) cAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAaca > 2:1400546/1‑150 (MQ=255) cAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAaca > 2:1400660/1‑150 (MQ=255) aGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACAcgc > 1:829465/1‑150 (MQ=255) cAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACgcgc > 1:1095300/1‑150 (MQ=255) aaTAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCt > 1:3980688/1‑150 (MQ=255) aaGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTAc > 2:2525092/1‑150 (MQ=255) aGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCACTATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTAcc < 2:2393349/150‑1 (MQ=255) aGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTAcc > 1:3443949/1‑150 (MQ=255) caacaaTGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGtt > 1:2053632/1‑150 (MQ=255) aacaaTGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTa < 2:2650565/150‑1 (MQ=255) caaTGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAAt < 1:3361266/150‑1 (MQ=255) aaTGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAAtc > 2:2906808/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAAtct < 1:3141735/150‑1 (MQ=255) ggCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTcc < 1:2742366/150‑1 (MQ=255) cAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTg < 2:3459570/150‑1 (MQ=255) cAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATAGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTg > 1:2650357/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAAt > 2:2947815/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATa < 1:3938976/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATa > 2:636555/1‑150 (MQ=255) tgctgcTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGACATaa > 1:1698420/1‑150 (MQ=255) tgctgcTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATaa > 1:2408770/1‑150 (MQ=255) gctgctCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAAc > 1:1072125/1‑150 (MQ=255) ctgctCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACg < 2:1348859/150‑1 (MQ=255) gctCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGcc > 2:2350308/1‑150 (MQ=255) ctCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGccc < 2:195523/150‑1 (MQ=255) ctCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGccc < 2:195542/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATAGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGt > 2:707371/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTa > 2:2462356/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTa > 2:1773152/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGTTTACTGATCCAAACTTTCAATAGGCGCGTGGAACCAAACTCTTAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTa < 1:2971528/150‑1 (MQ=255) aGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATAGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATa < 1:2381726/150‑1 (MQ=255) gTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCa > 1:1153875/1‑150 (MQ=255) tttACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCag < 1:2764241/150‑1 (MQ=255) tCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGTGTAAAtt < 1:191039/150‑1 (MQ=255) tCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAAtt > 1:672891/1‑150 (MQ=255) ccAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCa > 2:1269708/1‑150 (MQ=255) cAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCat > 1:749149/1‑150 (MQ=255) aaCGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGACATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCata > 2:313574/1‑150 (MQ=255) gTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCataata > 1:591102/1‑150 (MQ=255) gTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCataata > 2:2454557/1‑150 (MQ=255) tCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGt < 2:3863220/150‑1 (MQ=255) cAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATAGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTc > 2:2625618/1‑150 (MQ=255) aaTATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCg > 1:120191/1‑150 (MQ=255) tatGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTg > 2:734718/1‑150 (MQ=255) atGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGc > 2:800825/1‑150 (MQ=255) tGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCt > 1:1780632/1‑150 (MQ=255) gcgTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGAt < 2:4142896/150‑1 (MQ=255) cgTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATg > 1:3913288/1‑150 (MQ=255) tGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCa > 1:1822763/1‑150 (MQ=255) ggCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAg > 1:3810374/1‑150 (MQ=255) ggCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAg < 1:3176871/150‑1 (MQ=255) cACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTc > 1:1730480/1‑150 (MQ=255) aCCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTcc > 1:2516608/1‑150 (MQ=255) ccAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCg < 2:1158414/150‑1 (MQ=255) cAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGc > 2:3573732/1‑150 (MQ=255) aaaCTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCt > 2:626498/1‑150 (MQ=255) aaaCTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCt > 1:294067/1‑150 (MQ=255) cTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGAt < 2:1998277/150‑1 (MQ=255) cTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGAt < 2:74173/150‑1 (MQ=255) tCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATa > 2:1717915/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATActct > 2:1243987/1‑150 (MQ=255) ttGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGtttt < 2:1914638/150‑1 (MQ=255) ttGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGtttt < 2:4013312/150‑1 (MQ=255) tGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTg < 1:3257581/150‑1 (MQ=255) gATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGt > 2:1042211/1‑150 (MQ=255) aTGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTAGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGtt < 1:3116222/150‑1 (MQ=255) tGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATAGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAg > 1:1446990/1‑150 (MQ=255) gAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATa < 1:1915773/150‑1 (MQ=255) gAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATa > 2:2863479/1‑150 (MQ=255) aaCCTAACGGAATAAAAACAAAATAGCCCCGGTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATaa < 1:2372079/150‑1 (MQ=255) aCCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATaaa < 1:3344576/150‑1 (MQ=255) cttAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAac < 1:3647695/148‑1 (MQ=255) cTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAaca > 1:3811397/1‑150 (MQ=255) tAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAacac > 2:1169931/1‑150 (MQ=255) aTAAAAACAAAATCGCNCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTNCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAg > 2:3899332/1‑150 (MQ=255) aTAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAg > 1:940441/1‑150 (MQ=255) aaaaCAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGttt < 2:3761212/150‑1 (MQ=255) aaaCAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGtttt < 2:2093156/150‑1 (MQ=255) aaCAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGttttt < 2:3252333/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGTTTTTGcc > 2:824742/1‑150 (MQ=255) tCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGTTTTTGCCATTa > 1:4048464/1‑150 (MQ=255) tCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGTTTTTGCCATTa < 1:2093786/150‑1 (MQ=255) | GTATACCTGCGAAGCGACAAAGCAATAAGGCAACAATGGCAGGTAATGCTGCTCAAAAAAGCGTTTACTGATCCCAACGTTCAATATGCGCGTGGCACCAAACTCATAAAAACTTTGATGGTGCGAACCTAACGGAATAAAAACAAAATCGCCCCGTTCCAGTAACACGCGCTTACCGTTAATCTCCTGGAAATAACGCCCGGTTAATACCAGAGTAAATTCATAATAGTCGTGCTGATGCAGTCCGCTGATACTCTCAGTTTTGTTATAGATAAACACATGGAAGTTTTTGCCATTA > CP009273/1813348‑1813645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |