Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,864,752 | C→A | 23.2% | S37R (AGC→AGA) | yeaI → | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,864,752 | 0 | C | A | 23.2% | 657.6 / 155.0 | 259 | S37R (AGC→AGA) | yeaI | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (113/85); new base A (23/37); total (136/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.02e-01 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
ACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACA > CP009273/1864606‑1864901 | cATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTc > 1:3706954/1‑150 (MQ=255) cATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTc > 2:2490871/1‑150 (MQ=255) tAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTcac < 1:645063/150‑1 (MQ=255) aaTTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTcaca > 1:3023683/1‑150 (MQ=255) aaTTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTcaca > 1:1730203/1‑150 (MQ=255) aTTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAATATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACAt < 1:2822061/150‑1 (MQ=255) tttAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACAtt < 2:2585742/150‑1 (MQ=255) tttAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACAtt < 1:787619/150‑1 (MQ=255) aGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGct > 2:3260335/1‑150 (MQ=255) aGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCtt < 2:2729839/150‑1 (MQ=255) aaaCAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACGATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCttttt > 1:1450832/1‑150 (MQ=255) aCAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTAt < 1:2760974/150‑1 (MQ=255) cAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATg < 1:3196940/150‑1 (MQ=255) aaTCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATgg > 2:2890270/1‑150 (MQ=255) aTCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGt > 1:729050/1‑150 (MQ=255) aTCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGt < 2:3626124/150‑1 (MQ=255) aTCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTACCATGGGGTTATTCTATAAATAATTATTATCTTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAAATATATATCTCTGACATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGt > 2:1290842/1‑150 (MQ=255) aTTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTc > 2:2951037/1‑150 (MQ=255) cGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTAt > 2:2855753/1‑150 (MQ=255) cGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTAt < 1:918086/150‑1 (MQ=255) ggAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATg > 1:1929996/1‑150 (MQ=255) aaaaTGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGt > 1:1793483/1‑150 (MQ=255) aTGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTaca < 2:2798854/150‑1 (MQ=255) aGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAAt > 1:2621570/1‑150 (MQ=255) cAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTaa < 1:3413484/150‑1 (MQ=255) acacGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTaaaa > 1:53595/1‑150 (MQ=255) cacGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAg < 1:2157408/150‑1 (MQ=255) cGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCt < 1:2687574/150‑1 (MQ=255) gTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTc > 1:3611604/1‑150 (MQ=255) gTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTc > 2:20551/1‑150 (MQ=255) tttCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCaaa < 2:1597535/150‑1 (MQ=255) tttCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCaaa < 2:4072330/150‑1 (MQ=255) ttCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAg > 1:2039869/1‑150 (MQ=255) tCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGc > 2:3133678/1‑150 (MQ=255) ccATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCt > 2:2243600/1‑150 (MQ=255) cATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCtt > 2:1081605/1‑150 (MQ=255) cATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTGTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGAtt > 1:1617571/1‑150 (MQ=255) tGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCtttt > 1:1093587/1‑150 (MQ=255) ggggTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCttttt > 2:269293/1‑150 (MQ=255) gggTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCtttttt > 1:4097762/1‑150 (MQ=255) ggTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTa > 2:3883029/1‑150 (MQ=255) ggTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTa < 1:3724052/150‑1 (MQ=255) gTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTAt < 1:44670/150‑1 (MQ=255) tATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTAttt < 2:3331847/150‑1 (MQ=255) cTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAg > 1:1539569/1‑150 (MQ=255) tttAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGt < 2:2348703/150‑1 (MQ=255) tAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGttt < 1:111723/150‑1 (MQ=255) tAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGttt < 1:2728346/150‑1 (MQ=255) aaaTATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTa > 2:1503845/1‑150 (MQ=255) aaaTATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTa > 2:666831/1‑150 (MQ=255) atatTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTAtt < 1:4175519/150‑1 (MQ=255) atatTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTAtt < 1:2383190/150‑1 (MQ=255) tatTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTg > 2:193471/1‑150 (MQ=255) tttttATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTg > 2:1707775/1‑150 (MQ=255) ttttATCGTTCCCGAAAATTGATCCTGGTCAAAACGATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGa < 2:2509511/150‑1 (MQ=255) tttATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGAc > 1:839681/1‑150 (MQ=255) ttATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACg > 2:845729/1‑150 (MQ=255) ttATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACg < 1:2462365/150‑1 (MQ=255) ttATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACg > 1:131167/1‑150 (MQ=255) tATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGt > 1:569519/1‑150 (MQ=255) aTCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGtt < 2:3959719/150‑1 (MQ=255) aTCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGtt < 1:2277942/150‑1 (MQ=255) aTCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGACATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGtt > 1:364108/1‑150 (MQ=255) gTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAat > 1:2779741/1‑150 (MQ=255) aCGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAatttta > 1:1144777/1‑150 (MQ=255) cGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAattttat < 2:421224/150‑1 (MQ=255) cGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAattttat > 2:3225100/1‑150 (MQ=255) gAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAattttatt > 2:3771341/1‑150 (MQ=255) gAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAattttatt > 2:3686936/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAattttattt < 2:2100927/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAattttattt < 2:2101092/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAattttattt < 1:3108668/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAattttattt < 1:3971770/150‑1 (MQ=255) gATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCAtt < 2:3026453/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATAGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTAAATTTTATTTTGCATtact > 2:3472864/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATtact > 2:607086/1‑150 (MQ=255) cTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATtacta < 2:421685/150‑1 (MQ=255) cTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATtacta > 2:2453922/1‑150 (MQ=255) tGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATtactac < 2:1990310/150‑1 (MQ=255) gTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCt > 2:3555265/1‑150 (MQ=255) gTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCt < 1:2549818/150‑1 (MQ=255) cAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTta > 1:3335130/1‑150 (MQ=255) aaaaCTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTtat > 2:3541252/1‑150 (MQ=255) aCTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAATTTAAAAGCTCAAAGCGTTTTTATTTTCAGTATATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACATtatata > 1:3569331/1‑150 (MQ=255) cTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATaa > 1:1886019/1‑150 (MQ=255) tatataTCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAAc > 1:2933618/1‑150 (MQ=255) tatataTCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAAc < 2:3748535/150‑1 (MQ=255) tatCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGaaa > 2:332300/1‑150 (MQ=255) tatCTCTGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGaaa < 1:2571504/150‑1 (MQ=255) tctcTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTACATTACTACCTTATATAACGAAAac < 2:1630329/150‑1 (MQ=255) tGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACaa > 2:4157672/1‑150 (MQ=255) tGCCATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACaa < 1:2490871/150‑1 (MQ=255) cATCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATg < 2:2163931/150‑1 (MQ=255) aTCAATAAAATCCAGAACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGt < 2:1765418/150‑1 (MQ=255) cAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTaa < 2:2748293/150‑1 (MQ=255) cAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTaa > 1:3976712/1‑150 (MQ=255) tCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATc > 2:232147/1‑150 (MQ=255) cAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATccc < 1:3440294/150‑1 (MQ=255) aGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCca < 2:30007/150‑1 (MQ=255) aGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCca > 2:1597194/1‑150 (MQ=255) | ACATAATTTAGTTCCAGAAAACAATCATTCGGAAAAATGATTCAGTCAACACGTATTTCCATGGGGTTATTCTTTAAATATTTTTTATCGTTAACGAAAATTGATCCTGGTCAAAACTATATATCTCTGCCATCAATAAAATCCAGCACTCACATTGCTCTCCTTTTTATGGTTTCTATGGGTACACAAAAATTAAAAGCTCAAAGCTTTTTTATTTTCAGTTTATTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACA > CP009273/1864606‑1864901 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |