Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,114,414 | C→A | 5.3% | V208F (GTC→TTC) | wcaJ ← | colanic biosynthesis UDP‑glucose lipid carrier transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,114,414 | 0 | C | A | 5.3% | 951.6 / 18.8 | 243 | V208F (GTC→TTC) | wcaJ | colanic biosynthesis UDP‑glucose lipid carrier transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (137/93); new base A (9/4); total (146/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
TACGCCGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGCTCTCCATCAG > CP009273/2114268‑2114561 | tACGCCGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGtt > 2:3118995/1‑150 (MQ=255) tACGCCGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGtt > 2:3809487/1‑150 (MQ=255) cGCCGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTAt < 2:3972880/150‑1 (MQ=255) ccGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGAAGTTATGa > 1:499758/1‑150 (MQ=255) cGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGCCGTTATGaa < 1:3725211/150‑1 (MQ=255) cGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGaa > 2:3100048/1‑150 (MQ=255) cGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGaa > 2:230277/1‑150 (MQ=255) cGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGaa > 2:2180204/1‑150 (MQ=255) ttCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATc > 1:3351147/1‑150 (MQ=255) ttCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATc < 2:1905532/150‑1 (MQ=255) cATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCTCGCCGTATCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCtt < 1:1080939/150‑1 (MQ=255) aTCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTg < 1:488087/150‑1 (MQ=255) aTCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTg < 2:2593954/150‑1 (MQ=255) ctctTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGcc < 2:2535822/150‑1 (MQ=255) tctTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGccc < 1:1121955/150‑1 (MQ=255) tctTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGccc < 1:1121893/150‑1 (MQ=255) ctTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGCTCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGCTGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATATGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCg > 2:558181/1‑150 (MQ=255) ctTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCg > 2:1974183/1‑150 (MQ=255) gAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCttt < 1:3914390/150‑1 (MQ=255) aGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTc > 2:1322564/1‑150 (MQ=255) gTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGt > 1:792010/1‑150 (MQ=255) tGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTc > 2:1954334/1‑150 (MQ=255) tGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCg > 1:2667106/1‑150 (MQ=255) gagaATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGAc > 1:2164561/1‑150 (MQ=255) gaATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCa < 1:3246247/150‑1 (MQ=255) tGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCt > 1:1905125/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGAAGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGt > 1:1665989/1‑150 (MQ=255) aaGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGACTCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGc > 2:2670024/1‑150 (MQ=255) aGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCa > 1:1843914/1‑150 (MQ=255) gACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTAcc > 1:2534262/1‑150 (MQ=255) aCGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTAccc < 1:1506253/150‑1 (MQ=255) aCGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGAAGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTAccc < 2:3070412/150‑1 (MQ=255) gATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTc < 1:4011039/150‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCg < 1:862249/150‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCg < 2:3551922/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGAAGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGt > 1:3533719/1‑150 (MQ=255) agcagcACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTa < 1:2603394/150‑1 (MQ=255) agcagcACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTa > 2:3277167/1‑150 (MQ=255) agcagcACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTa > 2:137942/1‑150 (MQ=255) gcagcaCCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAg < 1:3381026/150‑1 (MQ=255) cagcaCCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTTCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGa < 1:442008/150‑1 (MQ=255) gcaCCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGaaa < 1:471083/150‑1 (MQ=255) gcaCCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGaaa > 1:2365136/1‑150 (MQ=255) gcaCCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGaaa > 1:1066607/1‑150 (MQ=255) gcaCCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGATAGaaa > 2:3963887/1‑150 (MQ=255) caCCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAAc < 2:2042082/150‑1 (MQ=255) cGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAAcgcc > 1:2743875/1‑150 (MQ=255) cGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGAAGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTATAAAcgcc > 2:2924258/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAAcgccgc > 1:1949249/1‑150 (MQ=255) aGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCg > 1:2703369/1‑150 (MQ=255) ggtggtGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCgg < 1:3040187/150‑1 (MQ=255) gtggtgTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGt < 2:2066906/150‑1 (MQ=255) ggtgTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGttt > 2:1080170/1‑150 (MQ=255) ggtgTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGAAGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGttt > 2:1753690/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGt < 1:1026751/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGt > 2:2631315/1‑150 (MQ=255) cGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTc > 2:461331/1‑150 (MQ=255) gTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGt > 1:1981629/1‑150 (MQ=255) ttGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCTCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTa < 2:3749442/150‑1 (MQ=255) ttGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGCATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTa < 2:3560667/150‑1 (MQ=255) ttGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTa > 2:2927334/1‑150 (MQ=255) ttGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTa < 1:895338/150‑1 (MQ=255) gACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCTGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGcc < 1:3143458/150‑1 (MQ=255) cAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCccac < 2:2890489/150‑1 (MQ=255) aGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCccacc < 1:1552639/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCccacca > 2:154785/1‑150 (MQ=255) gTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCccacca > 2:414132/1‑150 (MQ=255) tttCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTc > 1:1597406/1‑150 (MQ=255) tttCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTc < 1:709125/150‑1 (MQ=255) tttCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGGTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTc < 2:130603/150‑1 (MQ=255) tCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCaa > 1:1250556/1‑150 (MQ=255) cACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCaaa > 2:1256026/1‑150 (MQ=255) cACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCaaa < 1:4128033/150‑1 (MQ=255) aCTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAAc > 2:1853505/1‑150 (MQ=255) tCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAAccc > 2:100002/1‑150 (MQ=255) cgcgcgCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCt < 1:629632/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAAc < 1:245240/150‑1 (MQ=255) gcCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCa > 2:2176891/1‑150 (MQ=255) cGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACg > 2:695059/1‑150 (MQ=255) gTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACgg < 1:2961619/150‑1 (MQ=255) gTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACgg > 2:3691196/1‑150 (MQ=255) gTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACgg < 1:827986/150‑1 (MQ=255) gTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACgg > 2:3538152/1‑150 (MQ=255) gCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTg > 1:3321342/1‑150 (MQ=255) gCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTg > 1:2843249/1‑150 (MQ=255) gCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTg > 1:3321385/1‑150 (MQ=255) gCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTg > 1:545786/1‑150 (MQ=255) acaTTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGt > 1:3023440/1‑150 (MQ=255) acaTTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGt > 1:2780057/1‑150 (MQ=255) aTTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTa > 2:78151/1‑150 (MQ=255) ttGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACg > 2:4094200/1‑150 (MQ=255) tGCATCGCGATATAGAAGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACgg > 2:1476642/1‑150 (MQ=255) aTCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAg > 2:2151286/1‑150 (MQ=255) tCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGc < 2:2021688/150‑1 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGctc < 1:913811/150‑1 (MQ=255) gcgATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGctc > 2:4072446/1‑150 (MQ=255) gATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGCtctc > 2:1941204/1‑150 (MQ=255) ataGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGCTCTCCAt < 1:2309790/150‑1 (MQ=255) ataGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGCTCTCCAt > 2:3799173/1‑150 (MQ=255) aGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGCTCTCCATCa > 1:3182538/1‑150 (MQ=255) | TACGCCGTTCATCTCTTCGAGGCGTGAATGGAGAATGTTGAAGGTAAAGACGTCGGGGATCAGCAGCACCGAACAGGTGGTGTCCGCCAGTTGATGGACCAGTTTTTTCACTCGCGCGCCGTCGCACATTTGCATCGCGATATAGACGTTATGAATCTTGCCCGCTTTCGCGTCCTCGACCAGCTGTTGCAGGTTACCCGCCCAGTCGTTAGAAACGCCGCCCGGTTTCGGGTCGTGGTAAACGCCCACCACTTCAAACCCTAACCACGGCTGGTTACGGAAGCTCTCCATCAG > CP009273/2114268‑2114561 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |