| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,197,797 | A→T | 31.9% | intergenic (+29/‑278) | yehK → / → yehL | uncharacterized protein/putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,197,797 | 0 | A | T | 31.9% | 339.0 / 232.8 | 231 | intergenic (+29/‑278) | yehK/yehL | uncharacterized protein/putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (85/72); new base T (39/35); total (124/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
TTGATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCT > CP009273/2197649‑2197946 | ttATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGgc < 1:2154068/150‑1 (MQ=255) ataAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCaa > 1:3645376/1‑150 (MQ=255) taAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAAc < 2:4144332/150‑1 (MQ=255) taAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAAc < 2:1966763/150‑1 (MQ=255) taAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAAc < 2:1968062/150‑1 (MQ=255) agaTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTcc < 1:2356678/150‑1 (MQ=255) agaTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTcc < 1:2356666/150‑1 (MQ=255) gaTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTccc > 1:2471132/1‑150 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCa < 1:2086211/150‑1 (MQ=255) aTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCa < 2:572981/150‑1 (MQ=255) tGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCaa > 1:2381309/1‑150 (MQ=255) tGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCaa < 1:4149752/150‑1 (MQ=255) gAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAAt < 1:2761460/150‑1 (MQ=255) gAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAAt < 1:2163945/150‑1 (MQ=255) gAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAAt < 1:3950235/150‑1 (MQ=255) gAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAAt < 2:3415910/150‑1 (MQ=255) gtgtATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATgg > 1:1399614/1‑150 (MQ=255) gtATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGcc > 2:1166048/1‑150 (MQ=255) tATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCt < 2:3432374/150‑1 (MQ=255) tATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCt > 2:2325454/1‑150 (MQ=255) atgaGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGAtt < 2:1072901/150‑1 (MQ=255) atgaGAGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGAtt < 2:799236/150‑1 (MQ=255) ggAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAAt > 2:3176004/1‑150 (MQ=255) aaaTTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAAtct > 1:2447219/1‑150 (MQ=255) aCGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGACTAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTa > 2:3574656/1‑150 (MQ=255) aGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCt < 1:1148415/150‑1 (MQ=255) ggagAATCACCAGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCtt < 1:993947/147‑1 (MQ=255) ggTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCtt < 1:1840105/150‑1 (MQ=255) gtaTCTCCTGAAAATGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTTCAGAATATATTCATCCACGAAATTGAATAATATACTATAAATAATTCAAATTGGTCCTATCCGGCGCAACGTCCCTATGGCCTGGATTATTAATCTCATTATCTTAAt < 2:855089/148‑1 (MQ=255) taaCCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTCAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACTTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGc > 2:2214599/3‑150 (MQ=255) cACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCa < 2:3871870/150‑1 (MQ=255) tGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACgg > 2:621868/1‑150 (MQ=255) aaaCTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACgggg < 2:3815830/150‑1 (MQ=255) aaaCTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACgggg > 2:3153325/1‑150 (MQ=255) cTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTcc > 1:2920581/1‑150 (MQ=255) gTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTAAAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATAATCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAg > 1:1907695/1‑150 (MQ=255) aTAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCg < 1:1210921/150‑1 (MQ=255) cAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGt > 2:2641856/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGtt < 2:3494509/150‑1 (MQ=255) aTTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTta < 1:174448/150‑1 (MQ=255) tttttAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTtat > 2:3484410/1‑150 (MQ=255) tttttAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTtat > 2:2405828/1‑150 (MQ=255) tttAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATaa > 1:3826600/1‑150 (MQ=255) tatAAACGTGAACTACAGAATATATTCAACAAATAAATAGAATAATATACTATAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGTCGCAAAGTCCCAATGGCCTGTATTATAAATATCATAATAATAATTGCAACGGTGTCAAGCCGTGGATATaa > 2:2398548/3‑150 (MQ=255) tAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAtt < 1:1270291/150‑1 (MQ=255) aTCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcg > 1:3883408/1‑150 (MQ=255) cGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcgtt > 1:3563286/1‑150 (MQ=255) cGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcgtt > 2:3090696/1‑150 (MQ=255) gTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTACGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTAATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCAGTGGTTATAAttcgttc > 1:3695684/1‑150 (MQ=255) gAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATtcgttcgt > 1:2862201/1‑150 (MQ=255) aaCTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTcgttcgtt < 2:2586155/150‑1 (MQ=255) aaCTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTcgttcgtt > 1:3725441/1‑150 (MQ=255) aaCTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTcgttcgtt < 2:2205368/150‑1 (MQ=255) cTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTgg > 2:3789073/1‑150 (MQ=255) tACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGa < 2:2862219/150‑1 (MQ=255) aCAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGaa < 1:2736041/150‑1 (MQ=255) aCAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGaa < 1:1128824/150‑1 (MQ=255) gAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAacac > 1:2742866/1‑150 (MQ=255) atatTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATg > 2:2834181/1‑150 (MQ=255) tatTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGt > 1:3059383/1‑150 (MQ=255) tatTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGt > 2:1909598/1‑150 (MQ=255) tCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGc > 1:924561/1‑150 (MQ=255) aCCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGcaca > 2:905280/1‑150 (MQ=255) ccAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAg > 1:795301/1‑150 (MQ=255) ccAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAg < 2:3639264/150‑1 (MQ=255) cAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAgg < 1:1550986/150‑1 (MQ=255) cAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAgg > 1:3028938/1‑150 (MQ=255) aaGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGc > 1:3975613/1‑150 (MQ=255) aGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCt < 2:1237573/150‑1 (MQ=255) aGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCt > 1:208387/1‑150 (MQ=255) gAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCtg > 1:3311027/1‑150 (MQ=255) gAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCtg > 1:347399/1‑150 (MQ=255) tAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGAAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTgtggt > 1:74632/1‑150 (MQ=255) gAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGgtgt < 1:1529552/150‑1 (MQ=255) gAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGgtgt < 2:1730422/150‑1 (MQ=255) ataataTACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTa > 1:1157175/1‑150 (MQ=255) aataTACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAgg > 1:3617123/1‑150 (MQ=255) atatACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGc < 1:3992363/150‑1 (MQ=255) ataCTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCt < 2:1434721/150‑1 (MQ=255) ataCTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCt > 2:1811895/1‑150 (MQ=255) ctctAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaa > 1:473365/1‑150 (MQ=255) ctctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaa < 2:737151/150‑1 (MQ=255) tctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaaa < 2:2507009/150‑1 (MQ=255) tctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaaa < 1:2229921/150‑1 (MQ=255) ctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaaaa > 1:2347679/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATa < 2:4011884/150‑1 (MQ=255) ttCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaaat < 1:1945204/150‑1 (MQ=255) cAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaaataa < 2:3931345/150‑1 (MQ=255) cAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaaataa > 1:1606542/1‑150 (MQ=255) aaTTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATaaaa > 2:3014614/1‑150 (MQ=255) aTTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAg < 1:258631/150‑1 (MQ=255) ttGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGa < 1:1109771/150‑1 (MQ=255) ttGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGGGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGa > 2:2059744/1‑150 (MQ=255) ttGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGa < 2:2961823/150‑1 (MQ=255) tGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGaa < 1:58482/150‑1 (MQ=255) ggTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTTAATAAAAGAAc < 2:2885348/150‑1 (MQ=255) cGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGc < 2:1399614/150‑1 (MQ=255) cGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGc > 2:167745/1‑150 (MQ=255) gATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGcc > 2:3726182/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCt > 2:2995083/1‑150 (MQ=255) | TTGATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCT > CP009273/2197649‑2197946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |