Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,264,143 | G→A | 100% | intergenic (+119/‑62) | mepS → / → rtn | murein DD‑endopeptidase, space‑maker hydrolase, mutational suppressor of prc thermosensitivity, outer membrane lipoprotein/resistance protein for phages lambda and N4, putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,264,143 | 0 | G | A | 99.1% | 802.9 / ‑2.3 | 226 | intergenic (+119/‑62) | mepS/rtn | murein DD‑endopeptidase, space‑maker hydrolase, mutational suppressor of prc thermosensitivity, outer membrane lipoprotein/resistance protein for phages lambda and N4, putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (117/107); total (119/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
AAGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTGCC > CP009273/2263996‑2264292 | aaGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACt < 1:166925/150‑1 (MQ=255) aaGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACt < 2:2964633/150‑1 (MQ=255) aGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACta > 2:3424714/1‑150 (MQ=255) cACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACtata > 1:2795036/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAg > 1:1368379/1‑150 (MQ=255) gCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTc > 2:306087/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTcc > 1:2457787/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTcc < 2:3277446/150‑1 (MQ=255) ccGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTcc < 1:2629218/150‑1 (MQ=255) cGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCg < 2:1416470/150‑1 (MQ=255) gTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTc > 1:885907/1‑150 (MQ=255) ctcAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCAtt < 2:2940795/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTAt > 1:3746486/1‑150 (MQ=255) aGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCttt < 1:276721/150‑1 (MQ=255) gCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCtttt > 2:2920950/1‑150 (MQ=255) cTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTa > 1:3207994/1‑150 (MQ=255) taataaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTaa > 2:1331997/1‑150 (MQ=255) ataaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAt > 1:1836028/1‑150 (MQ=255) taaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAtg > 1:240108/1‑150 (MQ=255) aaaCCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAtgt < 2:3613672/150‑1 (MQ=255) aCCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAtgttg < 1:2383490/150‑1 (MQ=255) ccGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAtgttgt < 1:3766366/150‑1 (MQ=255) cGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACGGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTc < 2:3006305/150‑1 (MQ=255) gTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCg > 1:3490947/1‑150 (MQ=255) tttGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGt < 2:3393944/150‑1 (MQ=255) tGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTaa < 1:1273409/150‑1 (MQ=255) ggATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCCGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAAt > 2:2898758/1‑150 (MQ=255) ggATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAAt < 1:3505616/150‑1 (MQ=255) aTGCAATCACTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAAttt < 1:223295/150‑1 (MQ=255) cAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAg > 1:2950404/1‑150 (MQ=255) aTCCCTTGGCTATCCTTACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGa < 1:3531518/150‑1 (MQ=255) aTCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGa > 1:241668/1‑150 (MQ=255) tCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGaa < 1:2021225/150‑1 (MQ=255) cccTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGaaa > 1:801384/1‑150 (MQ=255) tGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTaa > 1:3305594/1‑150 (MQ=255) gCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACg > 1:2888239/1‑150 (MQ=255) cTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACgg > 1:467232/1‑150 (MQ=255) tATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGa > 2:1115252/1‑150 (MQ=255) aTCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATTTTTCCGCGTCTTGATACAGACTATAGTCCTGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAAAGGaa > 2:2142097/1‑150 (MQ=255) aTCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTATTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCATGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTATTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGTaa > 1:36229/1‑150 (MQ=255) tGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCAt > 2:3427411/1‑150 (MQ=255) gACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCTTGAAATTAACGGAATCATg > 2:2243022/1‑150 (MQ=255) aCGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGt < 2:2023423/150‑1 (MQ=255) gAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTc < 2:1019687/150‑1 (MQ=255) aGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCa > 1:3840175/1‑150 (MQ=255) aGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCa > 2:425801/1‑150 (MQ=255) tAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATAc > 1:1075713/1‑150 (MQ=255) tAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATAc > 1:48747/1‑150 (MQ=255) tGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGTAATTAACTGAATCATGTTCATACgcgc > 2:3742255/1‑150 (MQ=255) tGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACgcgc > 2:2521826/1‑150 (MQ=255) tGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACgcgc > 2:1267920/1‑150 (MQ=255) gAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCt < 2:2978549/150‑1 (MQ=255) cTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTg < 2:1483381/150‑1 (MQ=255) aGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGAc < 2:953653/150‑1 (MQ=255) cAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTa < 1:2272466/150‑1 (MQ=255) cAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTa > 1:317258/1‑150 (MQ=255) cAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTa > 2:1808471/1‑150 (MQ=255) aGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTaa > 1:3109503/1‑150 (MQ=255) aGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTaa > 1:4007336/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGc < 2:2132098/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCt < 1:1090637/150‑1 (MQ=255) cTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTc > 1:3897892/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTc > 1:699679/1‑150 (MQ=255) ttttttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTcc < 2:2363480/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCt > 2:1296222/1‑150 (MQ=255) ttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCt > 1:436684/1‑150 (MQ=255) ttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCt > 1:656063/1‑150 (MQ=255) cattcatCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGc > 1:3560868/1‑150 (MQ=255) ttcatCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCAt > 2:2737942/1‑150 (MQ=255) tcatcaGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCAtt > 2:477971/1‑150 (MQ=255) tcatcaGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCAtt < 2:2204426/150‑1 (MQ=255) caGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCAttgttg > 2:2646717/1‑150 (MQ=255) caGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCAttgttg > 1:2060170/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |