| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,415,498 | G→T | 37.4% | T104T (ACG→ACT) | yfcH → | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,415,498 | 0 | G | T | 37.4% | 376.9 / 264.8 | 261 | T104T (ACG→ACT) | yfcH | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (95/68); new base T (57/40); total (153/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
AGCAACCTCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGA > CP009273/2415349‑2415647 | aGCAACCTCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACg < 1:4111955/150‑1 (MQ=255) aaCCTCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCa > 2:1586216/1‑150 (MQ=255) aaCCTCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCa > 2:2190391/1‑150 (MQ=255) ccTCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCAcc < 1:1249445/150‑1 (MQ=255) ccTCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCAcc > 1:607713/1‑150 (MQ=255) cTCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCg < 1:2534030/150‑1 (MQ=255) tCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGt > 2:1456044/1‑150 (MQ=255) cAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTc < 2:602372/150‑1 (MQ=255) cAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTc > 1:848525/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCg < 2:1016324/150‑1 (MQ=255) aaCGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCg > 1:3428689/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCg < 2:2786991/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTa > 1:4026369/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTa > 2:3869541/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTa > 1:2414938/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTa > 1:3368558/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAATCTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTc > 1:1003115/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATAGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTc > 1:1099535/1‑150 (MQ=255) aTGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCAttt < 1:2722482/150‑1 (MQ=255) tGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTc < 1:68218/150‑1 (MQ=255) cGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCg > 2:3642142/1‑150 (MQ=255) cGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCg > 1:725309/1‑150 (MQ=255) aaTCAACGTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATACACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGTATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGACAGCGACACTCCACCGTCGGTTCTCATTTCCGGCTc < 2:2451031/150‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCg > 1:254974/1‑150 (MQ=255) aTCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCg > 1:3876466/1‑150 (MQ=255) tCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCgg > 2:4126369/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCa > 1:862435/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAAc > 1:2636257/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAAc < 1:652097/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACg > 1:3840535/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACg > 2:49409/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACgg < 2:2542648/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACgg > 2:4105098/1‑150 (MQ=255) gagaACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCtatt > 2:1521753/1‑150 (MQ=255) gagaACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCtatt < 1:1630090/150‑1 (MQ=255) aaCCGAGTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATg < 2:3203245/150‑1 (MQ=255) ccGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGt > 1:3714683/1‑150 (MQ=255) cGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTg > 2:822614/1‑150 (MQ=255) ttGCTGATACACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCCCCGTCGGTTCTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACt < 2:599318/150‑1 (MQ=255) tGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACtt < 2:3999519/150‑1 (MQ=255) cTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAg < 1:1310288/150‑1 (MQ=255) cTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCAAGCGACACTCCACCGTCGGTACAAATTTACGGCTCGGCAACGGGCGAGTAAGGTGAATTAg > 1:3196890/1‑150 (MQ=255) aaaCGCTGGACTCACGAGCAACAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGaa < 2:849354/150‑1 (MQ=255) aaaCGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATATCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACATAGGTGaa > 1:3290842/1‑150 (MQ=255) aaaCGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGaa > 2:1231826/1‑150 (MQ=255) anCGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTTATTAATGCCAGAGTCACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAAAGGGCTATTATGGTGACTTAGGTTAAg > 2:706787/1‑150 (MQ=255) cTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAgtggt < 1:2224857/150‑1 (MQ=255) tGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAgtggtg < 1:1148513/150‑1 (MQ=255) tGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAgtggtg > 1:3543128/1‑150 (MQ=255) gACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTggtggt < 1:2882646/150‑1 (MQ=255) cTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTa < 2:2774573/150‑1 (MQ=255) cTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTa < 2:4057007/150‑1 (MQ=255) aGCAAACAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAag < 2:553488/150‑1 (MQ=255) cAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAagag > 2:3421384/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAagag < 1:1616014/150‑1 (MQ=255) aaaGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGATACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGaa < 1:1687081/150‑1 (MQ=255) gagCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAAccg > 1:827044/1‑150 (MQ=255) agCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAAccgc > 1:3910954/1‑150 (MQ=255) gCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAAccgcc > 1:3284976/1‑150 (MQ=255) gTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACcgccgc > 1:207751/1‑150 (MQ=255) gTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTACGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACcgccgc > 1:657168/1‑150 (MQ=255) ctctGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCAt > 2:3139772/1‑150 (MQ=255) tctGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATa > 2:3922452/1‑150 (MQ=255) cAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGaa < 1:3431052/150‑1 (MQ=255) aaaGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAAt < 2:142901/150‑1 (MQ=255) aaaGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAAt > 2:3063862/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAAt > 2:1373557/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAAt > 2:3945111/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAAtt > 2:3749704/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAAttt < 1:2765156/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGAATATCACGCAAAATCTGGTCGATTTGATTATTGCCAGCGACTCGCCACCGTCGGTAATCATTTCCGGCTCGGCATCGGGATATTATGGTGACTTTGGTGAAGTGGTGGTTACCGAATAGGAACCGCCGCATAACGAATTTAc < 1:1421868/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTAc < 2:129468/150‑1 (MQ=255) gCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACGTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTAccc > 2:1400755/1‑150 (MQ=255) aaTATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATaaa > 2:2368247/1‑150 (MQ=255) atatCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAAc > 1:74634/1‑150 (MQ=255) atatCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAAc < 2:235223/150‑1 (MQ=255) tatCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAAct < 1:2806789/150‑1 (MQ=255) cACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTg > 2:3263436/1‑150 (MQ=255) aCGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTgc > 2:2918795/1‑150 (MQ=255) aCGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTgc > 2:3194509/1‑150 (MQ=255) cAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGcgct > 1:3004830/1‑150 (MQ=255) cAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGcgct > 2:1673263/1‑150 (MQ=255) aaaaCTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCGCGGAAACGGGATATTATGGTTACTTAGGTTAAGTGGTGGTTACCGAATAGGAACCCCCGCAAAACGAATTTAACCATAAACTATgagcaca > 1:3677493/1‑147 (MQ=255) aaaCTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGcgctcgc > 2:4022148/1‑150 (MQ=255) aaCTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGcgctcgct < 1:1324585/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGcgctcgct < 1:4083436/150‑1 (MQ=255) ggTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTACGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGga > 1:3994287/1‑150 (MQ=255) gTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGgaa > 1:2440822/1‑150 (MQ=255) gATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGgaagaa < 1:970152/150‑1 (MQ=255) tttGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAAt > 1:1172414/1‑150 (MQ=255) ttGATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAAtt > 1:4170821/1‑150 (MQ=255) gATTAATGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATtgc < 2:2054889/150‑1 (MQ=255) aTTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATtgcc > 2:481831/1‑150 (MQ=255) ttAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATtgcct < 2:2240990/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATTGCCTGCCg > 2:3363934/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATTGCCTGCCg < 2:761032/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATTGCCTGCCg < 1:364575/150‑1 (MQ=255) cAGCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATTGCCTGCCGGgc < 1:1962663/150‑1 (MQ=255) gCGACACTCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTCACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATTGCCTGCCGGgcgc > 1:2151315/1‑150 (MQ=255) cGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATTGCCTGCCGGGCGCAAAGTg < 2:1087972/150‑1 (MQ=255) | AGCAACCTCAACGGCGTTGATGCGGTAATCAACCTGGCCGGAGAACCGATTGCTGATAAACGCTGGACTCACGAGCAAAAAGAGCGTCTCTGCCAAAGCCGCTGGAATATCACGCAAAAACTGGTCGATTTGATTAATGCCAGCGACACGCCACCGTCGGTACTCATTTCCGGCTCGGCAACGGGCTATTATGGTGACTTAGGTGAAGTGGTGGTTACCGAAGAGGAACCGCCGCATAACGAATTTACCCATAAACTCTGCGCTCGCTGGGAAGAAATTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGA > CP009273/2415349‑2415647 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |