| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,596,912 | C→A | 10.4% | S579* (TCA→TAA) | hyfB → | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,596,912 | 0 | C | A | 10.4% | 804.8 / 46.9 | 220 | S579* (TCA→TAA) | hyfB | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (115/82); new base A (18/5); total (133/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.40e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
ACCCCCTCATTACTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGATGAGCGGG > CP009273/2596764‑2597061 | cccccTCATTACTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAg < 2:890485/150‑1 (MQ=255) cccccTCATTACTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAg < 2:2616889/150‑1 (MQ=255) cccccTCATTACTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAg > 2:1736539/1‑150 (MQ=255) ccccTCATTACTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAgg > 2:2796462/1‑150 (MQ=255) ccccTCATTACTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAgg > 2:1168385/1‑150 (MQ=255) cactACTGTTGATGGTACCACTGGCGATGCCTTTGCGGCCTGGGATTTACTGTCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATg < 2:3868443/147‑1 (MQ=255) cATTACTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACGGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATg < 1:3423694/150‑1 (MQ=255) cTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTg < 2:2563029/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGc > 2:1658470/1‑150 (MQ=255) gCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCa < 1:1105490/150‑1 (MQ=255) nctactGGNGATGCCTNTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGANAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCt > 2:3304636/2‑150 (MQ=255) actactGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCt > 2:1211619/1‑150 (MQ=255) ctactGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTg > 1:2950666/1‑150 (MQ=255) ctactGGCGATGCCTTTGCAGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTg > 2:1150716/1‑150 (MQ=255) actGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCg > 1:2232956/1‑150 (MQ=255) tGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCgtg > 2:216909/1‑150 (MQ=255) gCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGtgtg < 1:1933133/150‑1 (MQ=255) gCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGtgtg < 1:2197816/150‑1 (MQ=255) cGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTgg > 1:1124259/1‑150 (MQ=255) aTGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTc < 1:321370/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTc > 1:2556307/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCtt < 2:2147705/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCt < 1:1976222/150‑1 (MQ=255) ctgcCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTgcg < 1:607264/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTa < 1:1491028/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTa < 2:1568665/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTa > 1:1784936/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTa > 1:3495043/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTAtt < 1:1207506/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTAtt > 1:1053423/1‑150 (MQ=255) gCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTc < 1:2661078/150‑1 (MQ=255) ccTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCg > 2:3825762/1‑150 (MQ=255) ccTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCg > 2:1367086/1‑150 (MQ=255) ccTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCg > 1:2890591/1‑150 (MQ=255) tttACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTc < 1:104185/150‑1 (MQ=255) tttACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTc < 1:2018613/150‑1 (MQ=255) ttACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCt < 1:222324/150‑1 (MQ=255) ttACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCt > 2:1875547/1‑150 (MQ=255) gtgtCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCt < 2:3541200/150‑1 (MQ=255) tgtCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTc < 1:3862521/150‑1 (MQ=255) tgtCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTc < 1:1772104/150‑1 (MQ=255) gtCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCg > 2:2881921/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGa > 2:1464415/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGa > 2:1464366/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGa > 1:3019752/1‑150 (MQ=255) gTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGAcc > 2:3769954/1‑150 (MQ=255) gTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGAcc > 1:1282303/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCt > 2:194902/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCt > 1:2202439/1‑150 (MQ=255) gccgcgcAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGc > 1:1820993/1‑150 (MQ=255) cgcgcAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTg > 1:1067242/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGa > 2:2453523/1‑150 (MQ=255) cgcAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAg < 1:3352511/150‑1 (MQ=255) cgcAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAg > 1:745751/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGc > 2:3999120/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCt > 2:2881003/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCt > 2:68124/1‑150 (MQ=255) cGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCtaa < 1:4177816/150‑1 (MQ=255) tttCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCtaaat < 2:1333756/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCtaaata > 2:3797088/1‑150 (MQ=255) cgCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGt > 2:2508537/1‑150 (MQ=255) gCACAGGAGATGCCTGGGCACGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTc > 1:2081953/1‑150 (MQ=255) acaGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCtt > 2:2040969/1‑150 (MQ=255) caGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTg > 2:2230437/1‑150 (MQ=255) ggAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTgcg > 1:2416089/1‑150 (MQ=255) gaTGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCAc < 2:409554/150‑1 (MQ=255) tGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGt > 1:2391218/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTc < 1:849981/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTc > 2:1760269/1‑150 (MQ=255) cTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCAc > 1:516016/1‑150 (MQ=255) cTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCAc > 2:3617957/1‑150 (MQ=255) tGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCAcc > 2:1703936/1‑150 (MQ=255) gggCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCg > 1:3995496/1‑150 (MQ=255) ggCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGc > 2:1165538/1‑150 (MQ=255) gCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGcc < 2:2367839/150‑1 (MQ=255) cATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCa > 1:3134742/1‑150 (MQ=255) aTGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAg > 2:1089325/1‑150 (MQ=255) tGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAgg > 1:2524844/1‑150 (MQ=255) ggCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCt > 2:241536/1‑150 (MQ=255) ggCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCt > 2:622616/1‑150 (MQ=255) gCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTc < 2:3282817/150‑1 (MQ=255) gCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTc > 1:1369313/1‑150 (MQ=255) gCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTc > 2:3677325/1‑150 (MQ=255) cTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCa > 2:480184/1‑150 (MQ=255) cGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCagag < 2:3412857/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGc > 2:837406/1‑150 (MQ=255) ggAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGa > 1:904462/1‑150 (MQ=255) tGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCtt < 1:3321880/150‑1 (MQ=255) tGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCtt < 1:371618/150‑1 (MQ=255) gCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTc < 1:2663587/150‑1 (MQ=255) cGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCt > 2:2160053/1‑150 (MQ=255) gATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTg > 1:483690/1‑150 (MQ=255) tGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTggg > 2:4089599/1‑150 (MQ=255) gCCCCGTAAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGAt > 2:2321190/1‑150 (MQ=255) ccccGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGATg > 2:1782875/1‑150 (MQ=255) ccccGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGATg < 2:3970698/150‑1 (MQ=255) ccccGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGATg < 1:2599312/150‑1 (MQ=255) cccGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGATGa < 1:2393600/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGATGAg > 1:1447047/1‑150 (MQ=255) tCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGATGAGCgg < 1:3605898/150‑1 (MQ=255) | ACCCCCTCATTACTGTTGCTGTTACTACTGGCGATGCCTTTGCTGCCTGGCCTTTACTGGCTGTGGTGTCGTTCGCGCCGCGCAGCGTTTCGTCGCACAGGAGATGCCTGGGCATGCGGCTACGGCTGGGAAAATGCGATGGCCCCGTCAGGCAATGGCGTGATGCAGCCGCTGCGTGTGGTCTTTTCTGCGCTATTTCGTCTACGACAACAGCTCGACCCTACGCTGAGGCTAAATAAAGGTCTTGCGCACGTCACCGCCAGGGCTCAGAGCACAGAACCCTTCTGGGATGAGCGGG > CP009273/2596764‑2597061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |