Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 2,694,843 | G→T | 59.6% | I82I (ATC→ATA) | pdxJ ← | pyridoxine 5'‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,694,843 | 0 | G | T | 59.6% | 82.1 / inf | 273 | I82I (ATC→ATA) | pdxJ | pyridoxine 5'‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (62/48); new base T (91/72); total (153/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.04e-01 |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
GAGAAACCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCGATCGCCAGCATCTCTTCGGTCACCGCCATCTCCAGATTCATGCGGGTATCCAGCGTCTGACGCAGGATGCGCACGTCGCGGTCAGTAATGTGACGGCGATCTTCACGTAAATGCACGGTAATGCCGTCCGCTCCCGCCTGCTCGGCAAT > CP009273/2694695‑2694992 | gagaAACCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCGa < 1:1197550/150‑1 (MQ=255) agaAACCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTAt > 2:3932326/1‑150 (MQ=255) agaAACCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTAt > 1:3688709/1‑150 (MQ=255) agaAACCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCGAt < 2:3947799/150‑1 (MQ=255) gaAACCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATc < 2:1097741/150‑1 (MQ=255) gaAACCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCGCAACGGCGATc > 1:4175395/1‑150 (MQ=255) aaaCCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCGATCg < 2:867926/150‑1 (MQ=255) aCCTGAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGcc < 1:1567808/150‑1 (MQ=255) gAATCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCGATCGCCAGCa > 1:2314004/1‑150 (MQ=255) aaTCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCAt > 1:2842714/1‑150 (MQ=255) aTCCCGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCAtc < 2:2568196/150‑1 (MQ=255) ccGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGGACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATctct < 2:1542591/150‑1 (MQ=255) cGGCATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCtt > 2:1380685/1‑150 (MQ=255) cATCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCTTCgg > 1:2634689/1‑150 (MQ=255) tCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCTTCGGTc > 1:77713/1‑150 (MQ=255) tCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCTTCGGTc > 1:1573824/1‑150 (MQ=255) tCTGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCTTCGGTc < 2:1444366/150‑1 (MQ=255) tGCCAGACGTTTGCAGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTGGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCTTCGGTCAc > 2:1410102/1‑150 (MQ=255) 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aGGCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCGATCGCCAGCATCTCTTCGGTCACCGCCATCTCCAGAt < 2:130694/150‑1 (MQ=255) gCATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCTTCGGTCACCGCCATCTCCAGATTc < 1:338873/150‑1 (MQ=255) cATCGCGCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCTTCGGTCACCGCCATCTCCAGATTCa > 2:3946752/1‑150 (MQ=255) cgcgCATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCTATCGCCAGCATCTCTTCGGTCACCGCCATCTCCAGATTCATGc > 2:1928085/1‑150 (MQ=255) cATTTTGTCACGCTGCCCTGCGACATCCAGGCCGCCTTCGGTTGTTACTTCCTGACGCTTTTCCGGTACCAGGCAGCAAAAATGTGGCTTCGTCTCAACGGCGATCGCCAGCATCTCTTCGGTCACCGCCATCTCCAGATTCATGCGGGt < 2:1054766/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |