Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,799,737 | C→A | 39.3% | V123V (GTC→GTA) | proW → | glycine betaine transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,799,737 | 0 | C | A | 39.3% | 334.5 / 272.7 | 255 | V123V (GTC→GTA) | proW | glycine betaine transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (84/70); new base A (47/53); total (131/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TGGGTCGTTACCCATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGATATGGCTGGCGAGAAG > CP009273/2799588‑2799886 | ggTCGTTACCCATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCgg < 1:88884/150‑1 (MQ=255) ggTCGTTACCCATGTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCgg < 1:1863355/150‑1 (MQ=255) gTCGTTACCCATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGa < 1:2550003/150‑1 (MQ=255) gTCGTTACCCATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGa > 1:2381633/1‑150 (MQ=255) gTTACCCATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATg > 1:2085264/1‑150 (MQ=255) gTTACCCATTTCCGTCCCGTCGTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATg < 2:1798653/150‑1 (MQ=255) ttACCCATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATgg > 2:583049/1‑150 (MQ=255) cccATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGgtg < 2:1382601/150‑1 (MQ=255) ccATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGgtgt > 1:464892/1‑150 (MQ=255) cATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGtgtg > 2:283618/1‑150 (MQ=255) cATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGtgtg < 1:3119472/150‑1 (MQ=255) cATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGtgtg < 1:3041831/150‑1 (MQ=255) aTTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTgg > 2:932759/1‑150 (MQ=255) tCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGa < 1:2200472/150‑1 (MQ=255) tCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGa > 1:1174791/1‑150 (MQ=255) cgtcccgtcTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACg < 2:2539399/150‑1 (MQ=255) tcccgtcTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCt > 2:228627/1‑150 (MQ=255) tcccgtcTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCt > 2:2773184/1‑150 (MQ=255) gtcTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGtt < 2:1209311/150‑1 (MQ=255) tcTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGttt < 2:3022866/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTc > 2:2519761/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCg > 2:2556242/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACAGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGc > 2:3724918/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTg < 1:1530340/150‑1 (MQ=255) aGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGa > 1:3539936/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGAtt < 1:29724/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGAtt > 1:2403177/1‑150 (MQ=255) gTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGcc > 1:398005/1‑150 (MQ=255) gTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGATGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGTGGTAGGTATGGGTGTTTCGACGCTTGTTTCGATGATTGcc > 2:384167/1‑150 (MQ=255) cgTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCgg > 1:3828921/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCa > 2:297197/1‑150 (MQ=255) cGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCaa > 2:3957713/1‑150 (MQ=255) ggTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAAt < 1:3100918/150‑1 (MQ=255) ggTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAAt > 2:1170832/1‑150 (MQ=255) gTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATc > 2:2461454/1‑150 (MQ=255) ttGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCg < 2:3432025/150‑1 (MQ=255) ttGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCg < 1:3567644/150‑1 (MQ=255) ttGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCg > 1:1348753/1‑150 (MQ=255) ttGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCg < 2:1339197/150‑1 (MQ=255) gATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGt < 1:695880/150‑1 (MQ=255) gATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGt > 1:1046124/1‑150 (MQ=255) aTTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTg > 2:3960613/1‑150 (MQ=255) atatCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCt < 1:2842445/150‑1 (MQ=255) atatCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCt < 2:2918714/150‑1 (MQ=255) tatCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTg > 1:2506527/1‑150 (MQ=255) tatCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTg > 1:161875/1‑150 (MQ=255) atCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTgg > 1:404009/1‑150 (MQ=255) atCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTgg < 2:484431/150‑1 (MQ=255) atCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTgg < 1:3925863/150‑1 (MQ=255) tCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGt > 2:3309503/1‑150 (MQ=255) cTCAACGGTTTCCAGCAATTGCGGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCg < 2:1411238/150‑1 (MQ=255) tCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGc < 1:1479998/150‑1 (MQ=255) cAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCa < 1:763547/150‑1 (MQ=255) 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tCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCg > 1:1335102/1‑150 (MQ=255) gCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGt > 2:40607/1‑150 (MQ=255) ctctCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGtt < 2:1858335/150‑1 (MQ=255) tctcATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGttt < 1:3419872/150‑1 (MQ=255) tctcATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTAATCGGttt < 2:3660884/150‑1 (MQ=255) ctcATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTg > 2:421271/1‑150 (MQ=255) tcATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGc > 2:3231946/1‑150 (MQ=255) cATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGcc > 1:4015089/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTggg > 2:3703865/1‑150 (MQ=255) tGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTgggg > 2:1125482/1‑150 (MQ=255) ggCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGa > 2:1254203/1‑150 (MQ=255) gCAGATTTCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGat < 2:2603144/150‑1 (MQ=255) aGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGatat > 1:425478/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGATAtggct < 2:3649159/150‑1 (MQ=255) tCCGGGGTAGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGATAtggctg < 1:4074216/150‑1 (MQ=255) 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cGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGATATGGCTGGCGAGAAg > 1:3315767/1‑150 (MQ=255) cGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGATATGGCTGGCGAGAAg < 2:2381633/150‑1 (MQ=255) | TGGGTCGTTACCCATTTCCGTCCCGTCTTCCAGGGCGTGCGCGTTCCGGTTGATTATATCCTCAACGGTTTCCAGCAATTGCTGCTGGGTATGCCCGCACCGGTGGCGATTATCGTTTTCGCTCTCATCGCCTGGCAGATTTCCGGGGTCGGAATGGGTGTGGCGACGCTGGTTTCGCTGATTGCCATCGGCGCAATCGGTGCCTGGTCGCAGGCAATGGTGACTCTGGCGCTGGTGTTAACCGCCCTGCTGTTCTGTATCGTCATCGGTTTGCCGTTGGGGATATGGCTGGCGAGAAG > CP009273/2799588‑2799886 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |