| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,847,161 | C→A | 7.3% | I183I (ATC→ATA) | hypE → | carbamoyl dehydratase, hydrogenases 1,2,3 maturation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,847,161 | 0 | C | A | 7.3% | 899.3 / 31.6 | 234 | I183I (ATC→ATA) | hypE | carbamoyl dehydratase, hydrogenases 1,2,3 maturation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (109/108); new base A (9/8); total (118/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
TGGTGCAGCGCGGCGCGGTAGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAACGCGGTGGTTCAT > CP009273/2847013‑2847308 | gCAGCGCGGCGCGGTAGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATACTTaa > 1:1135476/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGGCGCGGTAGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAAc > 2:1371489/1‑150 (MQ=255) cgcggTAGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGa > 2:3649994/1‑150 (MQ=255) 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tAGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCAACTATCCTTAACCTGCGTGagcagc > 2:496533/1‑150 (MQ=255) aGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCt < 1:2181998/150‑1 (MQ=255) aGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCt < 2:3486596/150‑1 (MQ=255) aGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCt < 2:371948/150‑1 (MQ=255) tAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTggg < 2:724937/150‑1 (MQ=255) 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tACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATACTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCg > 1:3835896/1‑150 (MQ=255) acTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCgtgg > 2:361664/1‑150 (MQ=255) ggCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAACGCGCTGCGTGATGCCACCCgtggtggt > 2:2272539/1‑150 (MQ=255) ggCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCgtggtggt < 1:3809729/150‑1 (MQ=255) cGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAAcgc > 2:132138/1‑150 (MQ=255) ggggCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAAcgcg > 2:1875980/1‑150 (MQ=255) gggCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAACGCgg < 2:2322327/150‑1 (MQ=255) ggCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGGAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAACGCggt < 2:3557163/150‑1 (MQ=255) gCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAACGCggtg < 1:160206/150‑1 (MQ=255) gCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAACGCggtg < 1:159709/150‑1 (MQ=255) gACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAACGCggtggt < 2:3266519/150‑1 (MQ=255) aTCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAACGCGGTGGTTCAt > 2:1250024/1‑150 (MQ=255) | TGGTGCAGCGCGGCGCGGTAGATAAACTGTTTATCAACACCGCTGGCATGGGCGCAATTCCGGCGAATATTCACTGGGGCGCACAGACGCTAACCGCAGGCGATGTATTGCTGGTGAGCGGTACACTCGGCGACCACGGGGCGACTATCCTTAACCTGCGTGAGCAGCTGGGGCTGGATGGCGAACTGGTCAGCGACTGCGCGGTGCTGACGCCGCTTATTCAGACGCTGCGTGACATTCCCGGCGTGAAAGCGCTGCGTGATGCCACCCGTGGTGGTGTAAACGCGGTGGTTCAT > CP009273/2847013‑2847308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |