| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,985,884 | C→T | 55.6% | I144I (ATC→ATT) | ygeH → | putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,985,884 | 0 | C | T | 55.6% | 82.4 / inf | 250 | I144I (ATC→ATT) | ygeH | putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (56/55); new base T (61/78); total (117/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |