| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,051,943 | A→G | 5.7% | intergenic (‑174/+82) | serA ← / ← rpiA | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,051,943 | 0 | A | G | 5.7% | 853.6 / 30.1 | 247 | intergenic (‑174/+82) | serA/rpiA | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (120/112); new base G (7/7); total (128/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
GTTGTGTGCGGATTTGCATCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAA > CP009273/3051794‑3052092 | gtgCGGATTTGCATCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAGTATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAAtt < 2:2414707/150‑1 (MQ=255) gtgCGGATTTGCATCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAAtt > 2:1753953/1‑150 (MQ=255) tgCGGATTTGCATCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTg < 2:1793107/150‑1 (MQ=255) ggATTTGCATCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGGCAATTGCCt > 1:1512702/1‑150 (MQ=255) aTTTGCATCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTgg > 1:2100661/1‑150 (MQ=255) ttGCATCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTa > 1:2110962/1‑150 (MQ=255) aTCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAg < 1:854779/150‑1 (MQ=255) tCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCTATGTTGAGGAAATATAACGCAAAGGTAATTATTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGTTAAAAGc < 2:1165804/150‑1 (MQ=255) tCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGc < 2:1165768/150‑1 (MQ=255) ccGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCg < 1:2274599/150‑1 (MQ=255) ccGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCg < 2:3730294/150‑1 (MQ=255) gCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTg < 1:524561/150‑1 (MQ=255) ccTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGa > 1:3408526/1‑150 (MQ=255) cTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGac > 2:4114120/1‑150 (MQ=255) ttCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGacac > 2:3174712/1‑150 (MQ=255) tCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGAcaca > 2:169057/1‑150 (MQ=255) aCATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGt > 1:1957129/1‑150 (MQ=255) aCATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCGGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGt > 2:1913658/1‑150 (MQ=255) tatCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCAc > 2:3874472/1‑150 (MQ=255) tCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCa > 1:1852408/1‑150 (MQ=255) cAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCaa > 2:2974840/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCaaa > 1:2451404/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCaaa > 1:1135160/1‑150 (MQ=255) aaaaTAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAAtt < 2:379940/150‑1 (MQ=255) aataatATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTa < 2:1030392/150‑1 (MQ=255) aataatATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTa < 2:2322712/150‑1 (MQ=255) taataTTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAAt > 1:2425559/1‑150 (MQ=255) aataTAGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATg < 2:1435816/150‑1 (MQ=255) atatTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGTTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGa < 1:3865185/150‑1 (MQ=255) atatTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGa < 2:4063277/150‑1 (MQ=255) tatTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGaa > 2:1887008/1‑150 (MQ=255) atTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAag > 1:1652744/1‑150 (MQ=255) tGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGGCAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTTACCAAATTTAATGAagag > 1:233538/1‑150 (MQ=255) tGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAagag > 2:3783241/1‑150 (MQ=255) ggCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAt > 1:3275761/1‑150 (MQ=255) gCAATATGACCGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtt < 1:1236154/150‑1 (MQ=255) gCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtt < 1:2676980/150‑1 (MQ=255) cAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAttt > 2:2762893/1‑150 (MQ=255) cAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAttt < 2:3432722/150‑1 (MQ=255) aaTATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttt > 1:2216552/1‑150 (MQ=255) aaTATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttt < 1:794878/150‑1 (MQ=255) atatGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGGCAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTTACCAAATTTAATGAAGAGAAttttt < 1:2941270/150‑1 (MQ=255) atGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAttttttt > 1:1071375/1‑150 (MQ=255) atGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAttttttt > 2:906876/1‑150 (MQ=255) atGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAttttttt < 1:3538659/150‑1 (MQ=255) tGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTa > 1:2995300/1‑150 (MQ=255) aCGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACg < 2:2033067/150‑1 (MQ=255) tttGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACgggg < 1:1547655/150‑1 (MQ=255) ttGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATCCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACggggg < 2:2476706/150‑1 (MQ=255) gTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGt > 2:396139/1‑150 (MQ=255) tCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGTATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGtt < 1:1408370/150‑1 (MQ=255) gATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTcccc < 1:2761147/150‑1 (MQ=255) tGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCg < 2:2222002/150‑1 (MQ=255) tGAGTAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGTATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGTTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTCACGGGGGAGGTTCCCCCGTCa < 1:1739747/150‑1 (MQ=255) tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCa < 2:3626349/150‑1 (MQ=255) gAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg < 2:2918035/150‑1 (MQ=255) aGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTGTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGa > 2:1468170/1‑150 (MQ=255) ggAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGAt < 1:1842423/150‑1 (MQ=255) gAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATc > 2:666669/1‑150 (MQ=255) aaaTATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCAACAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCACCCGTCAGATCa > 1:2782299/1‑150 (MQ=255) aaTATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCAt > 1:816156/1‑150 (MQ=255) atatCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCAtt > 1:1006900/1‑150 (MQ=255) tatCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCAttt > 2:524627/1‑150 (MQ=255) tCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTca > 2:1064607/1‑150 (MQ=255) cACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTcac > 1:312168/1‑150 (MQ=255) gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAAt < 2:2074045/150‑1 (MQ=255) cAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATg > 2:2097877/1‑150 (MQ=255) ggTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGGCAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTTACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGttt > 1:3342601/1‑150 (MQ=255) tAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATATAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTg > 2:2236470/1‑150 (MQ=255) cTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACAcc > 1:1706203/1‑150 (MQ=255) ttGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCg > 1:1283743/1‑150 (MQ=255) tGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGt > 1:575300/1‑150 (MQ=255) tGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGt < 1:1947879/150‑1 (MQ=255) gATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCa < 1:3962630/150‑1 (MQ=255) gAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGgt > 2:559946/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCa > 2:1345239/1‑150 (MQ=255) tGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGGTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAAt > 2:331430/1‑150 (MQ=255) gTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGGCAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTTACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCa > 1:1179805/1‑150 (MQ=255) agagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTGTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAgcgc > 1:4065030/1‑150 (MQ=255) gagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCa > 1:185593/1‑150 (MQ=255) gagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCa > 2:1424530/1‑150 (MQ=255) ggATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAAc > 2:312118/1‑150 (MQ=255) tttatttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTc < 2:3575731/150‑1 (MQ=255) tttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCcgcg < 2:3080254/150‑1 (MQ=255) tttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCcgcg < 1:4113981/150‑1 (MQ=255) tttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCcgcg > 1:3747426/1‑150 (MQ=255) tttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCcgcg < 2:268990/150‑1 (MQ=255) taGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGcc < 1:2920556/150‑1 (MQ=255) taGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGcc > 2:331934/1‑150 (MQ=255) taGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGcc < 1:731781/150‑1 (MQ=255) agagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCa > 2:130833/1‑150 (MQ=255) agCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACg > 1:503437/1‑150 (MQ=255) agCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACg > 1:2978533/1‑150 (MQ=255) agCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACg < 2:2850852/150‑1 (MQ=255) agCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACg < 1:2653573/150‑1 (MQ=255) aaTCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGtt < 1:2190997/150‑1 (MQ=255) aaTCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGtt < 1:4156520/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTTACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTa < 2:2647475/150‑1 (MQ=255) gACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCa > 1:2864958/1‑150 (MQ=255) gACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCa > 2:160399/1‑150 (MQ=255) | GTTGTGTGCGGATTTGCATCCGCCTTTCAACATATCAAAAAATAATATTGCGGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTTGACACCGTCAGGTGTGCCAATCAGCGCAACGTCCGCGCCACGGTTAGCAA > CP009273/3051794‑3052092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |