Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,093,737 | A→C | 31.1% | T117T (ACT→ACG) | ansB ← | periplasmic L‑asparaginase 2 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,093,737 | 0 | A | C | 31.1% | 265.2 / 272.7 | 244 | T117T (ACT→ACG) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (82/86); new base C (36/40); total (118/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGT > CP009273/3093592‑3093882 | ggTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGttt > 2:532642/1‑150 (MQ=255) ttGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTttct < 2:590541/150‑1 (MQ=255) gCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTcc < 2:1360361/150‑1 (MQ=255) 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cTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGt < 2:2579064/150‑1 (MQ=255) tGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTg > 2:2617819/1‑150 (MQ=255) ggTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGt > 2:1531420/1‑150 (MQ=255) gTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGATGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTa < 2:1794326/150‑1 (MQ=255) cACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCCGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAAt < 1:2264554/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |