| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,285,476 | C→A | 10.5% | I259I (ATC→ATA) | yraK → | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,285,476 | 0 | C | A | 10.5% | 848.1 / 51.6 | 238 | I259I (ATC→ATA) | yraK | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (94/119); new base A (12/13); total (106/132) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 | |||||||||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
TTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTCGTATTGAAAATCT > CP009273/3285327‑3285625 | ttATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATc > 2:2785071/1‑150 (MQ=255) tCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACt < 1:2315539/150‑1 (MQ=255) cGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACtt < 1:4028692/150‑1 (MQ=255) cGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACtt < 1:1517871/150‑1 (MQ=255) cGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACtt > 2:3401735/1‑150 (MQ=255) gATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTa < 2:472473/150‑1 (MQ=255) gATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTa > 1:981035/1‑150 (MQ=255) ttCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATg < 2:1380409/150‑1 (MQ=255) tCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTAGTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGa > 1:2881719/1‑150 (MQ=255) cAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGAc > 2:3865961/1‑150 (MQ=255) cAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGAc > 1:88828/1‑150 (MQ=255) aGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACt < 1:3779529/150‑1 (MQ=255) aGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACt < 1:1680554/150‑1 (MQ=255) ggAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACtgt < 1:1975405/150‑1 (MQ=255) gAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACtgtg < 2:3449522/150‑1 (MQ=255) aaaTCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTgtgg > 2:174278/1‑150 (MQ=255) aaTCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTgtggt < 1:862605/150‑1 (MQ=255) ctcACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTAACACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGAt > 1:85440/1‑150 (MQ=255) tcACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATa > 1:3447118/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACt > 1:2113166/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACt < 1:1838555/150‑1 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACt > 2:1062310/1‑150 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACt > 2:4091969/1‑150 (MQ=255) cGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTc < 1:2944622/150‑1 (MQ=255) cGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTc > 2:3172210/1‑150 (MQ=255) aGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTa > 2:847794/1‑150 (MQ=255) gTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGATGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTaa < 2:3557033/150‑1 (MQ=255) cGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTaaaa < 2:2691024/150‑1 (MQ=255) gTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTaaaaa > 1:2979844/1‑150 (MQ=255) gTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTaaaaa > 1:1743182/1‑150 (MQ=255) tGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAAc < 2:2649706/150‑1 (MQ=255) aaaTTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGt < 2:740308/150‑1 (MQ=255) aaaTTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGt > 1:2716869/1‑150 (MQ=255) aTTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTg < 2:1401466/150‑1 (MQ=255) aTTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTg > 2:1512699/1‑150 (MQ=255) ttAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCAAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAAATCGTTGc > 2:2108813/1‑150 (MQ=255) ttAATCAGGGAGATTTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGc < 2:1390522/150‑1 (MQ=255) taTCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCaa < 2:200095/149‑1 (MQ=255) aaTCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCaa < 2:1762983/150‑1 (MQ=255) tCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAAt > 2:3522652/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAAt > 2:1869151/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGATGTTATTTAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCTCCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATg < 1:3532553/150‑1 (MQ=255) aGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATgc < 2:3121024/150‑1 (MQ=255) gggCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATgcg < 2:4141064/150‑1 (MQ=255) ggCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATgcgc > 2:2159986/1‑150 (MQ=255) gCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCa < 2:72888/150‑1 (MQ=255) aaGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACa < 2:3189656/150‑1 (MQ=255) aaGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACa > 2:3284625/1‑150 (MQ=255) ggTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAAc < 2:2525898/150‑1 (MQ=255) gTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACt < 2:3548917/150‑1 (MQ=255) ttGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGgtag > 1:1276958/1‑150 (MQ=255) tGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGgtagt > 1:650903/1‑150 (MQ=255) catcaATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCa > 2:2377201/1‑150 (MQ=255) aaTGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTAc > 1:1190392/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACaa < 1:3042209/150‑1 (MQ=255) gTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAAcc < 1:544674/150‑1 (MQ=255) cAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTg < 1:1403652/150‑1 (MQ=255) aGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTgg > 2:2397733/1‑150 (MQ=255) aGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTgg > 2:3958452/1‑150 (MQ=255) gAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGt > 1:3065455/1‑150 (MQ=255) aaGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTc < 2:942282/150‑1 (MQ=255) aaGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTc > 1:3304307/1‑150 (MQ=255) tttACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGcc < 2:1273957/150‑1 (MQ=255) ttACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCa < 1:1811017/150‑1 (MQ=255) tACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAg < 1:4157818/150‑1 (MQ=255) tACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAg < 1:2231075/150‑1 (MQ=255) ccaccCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGc > 1:3961711/1‑150 (MQ=255) caccCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCg > 2:308619/1‑150 (MQ=255) caccCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCg > 2:1151699/1‑150 (MQ=255) caccCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCg < 2:2625349/150‑1 (MQ=255) accCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCga < 2:1369790/150‑1 (MQ=255) cccGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCgaa > 2:1379393/1‑150 (MQ=255) ccGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCgaag < 2:1461419/150‑1 (MQ=255) ccGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCgaag < 1:218948/150‑1 (MQ=255) ccGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCgaag < 1:912805/150‑1 (MQ=255) gCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCgaagaa > 2:3048425/1‑150 (MQ=255) cAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTTATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGaagaag > 1:2393027/1‑150 (MQ=255) cAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGaagaag < 1:454292/150‑1 (MQ=255) aaTGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGt > 1:2616446/1‑150 (MQ=255) aaTGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGt < 2:3652730/150‑1 (MQ=255) aaTGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCACATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGt < 1:3868480/150‑1 (MQ=255) tgccatgccaGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTc < 1:2370381/150‑1 (MQ=255) tgccatgccaGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTc < 1:3765701/150‑1 (MQ=255) caGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAAtg > 1:1900556/1‑150 (MQ=255) aGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAGGAAGTTCAGACAAtgt > 2:605865/1‑150 (MQ=255) aGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAAtgt > 2:2457136/1‑150 (MQ=255) ggTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGccc < 2:1213068/150‑1 (MQ=255) ggTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGccc > 2:1704634/1‑150 (MQ=255) ttttACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGa < 2:254970/150‑1 (MQ=255) aCTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTc < 2:4016059/150‑1 (MQ=255) cAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTa > 1:3280772/1‑150 (MQ=255) aGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTAt < 2:390872/150‑1 (MQ=255) gTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTAtt < 2:591960/150‑1 (MQ=255) tAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGGAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTc > 2:2740169/1‑150 (MQ=255) gACTTTGATATAACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTCGt > 1:1162493/1‑150 (MQ=255) cTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTCGTAt > 2:2852340/1‑150 (MQ=255) tGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTCGTATTGa < 1:3142604/150‑1 (MQ=255) gATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTCGTATTGaa > 1:1000039/1‑150 (MQ=255) tatCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTCGTATTGaaaa > 1:3208856/1‑150 (MQ=255) cACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTCGTATTGAAAAtct > 1:1434313/1‑150 (MQ=255) | TTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAAAAACTCGTTGCAAATGCGCATCGACGGTACAACTGGGGTAGTAGACCAGTACAACCTGGTCGCCAGGCGAAGAAGTTCAGACAATGTGCCCGATGTCGGTATTCGTATTGAAAATCT > CP009273/3285327‑3285625 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |