| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,397,316 | C→A | 7.6% | G158G (GGC→GGA) | acuI → | putative acryloyl‑CoA reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,397,316 | 0 | C | A | 7.6% | 1270.7 / 49.2 | 330 | G158G (GGC→GGA) | acuI | putative acryloyl‑CoA reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (115/190); new base A (14/11); total (129/201) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.82e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 335 total aligned reads displayed.
CTGGTTGCCATGCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATCCCGTCCTCTGGA > CP009273/3397167‑3397465 | ctggTTGCCATGCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGc < 2:1656153/150‑1 (MQ=255) ttGCCATGCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCg < 1:3086343/150‑1 (MQ=255) ttGCCATGCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCg < 1:1574248/150‑1 (MQ=255) ccATGCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAAGGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCa < 2:2540476/150‑1 (MQ=255) aTGCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGt > 2:1509036/1‑150 (MQ=255) tGCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTa < 2:3311488/150‑1 (MQ=255) gCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAAATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTAc < 2:2663563/150‑1 (MQ=255) gCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTAccgc > 2:3034184/1‑150 (MQ=255) cAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTAccgcc < 1:3672484/150‑1 (MQ=255) cAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTAccgcc > 1:3887162/1‑150 (MQ=255) aaGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTAccgccg > 1:2638565/1‑150 (MQ=255) aaGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTAccgccg > 2:3222736/1‑150 (MQ=255) aGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGt > 2:611430/1‑150 (MQ=255) aGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGt > 2:191374/1‑150 (MQ=255) gggCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTg < 1:210261/150‑1 (MQ=255) gCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGgc < 2:3499417/150‑1 (MQ=255) ggACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCgct > 1:4155972/1‑150 (MQ=255) gcgcgTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGAGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGctgctg < 1:1028774/150‑1 (MQ=255) cgTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCAt < 1:733497/150‑1 (MQ=255) gTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATa > 1:3953858/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATa < 1:1905896/150‑1 (MQ=255) gTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATa > 2:1135216/1‑150 (MQ=255) aaaGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAg > 2:2212697/1‑150 (MQ=255) aaaGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAg > 1:33095/1‑150 (MQ=255) aaaGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAg > 1:1063591/1‑150 (MQ=255) aaGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGt > 2:3606277/1‑150 (MQ=255) aaGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGAGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGt > 2:2766437/1‑150 (MQ=255) aGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGAGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGtt > 1:2547545/1‑150 (MQ=255) gCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTg < 1:1556120/150‑1 (MQ=255) gCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGAC‑GGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTgg > 1:2805963/1‑150 (MQ=255) aaTGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGTAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTggg < 2:3976192/150‑1 (MQ=255) tGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCCGCTGCATAAGTTGGGtt < 1:1486946/150‑1 (MQ=255) ttATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATc < 2:1897494/150‑1 (MQ=255) ttATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATc < 2:3082075/150‑1 (MQ=255) aTCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAg > 1:2340382/1‑150 (MQ=255) tCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAgg > 1:1597959/1‑150 (MQ=255) ggTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTc < 2:2561770/150‑1 (MQ=255) ggTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTc < 1:2050299/150‑1 (MQ=255) gTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCg < 2:1784351/150‑1 (MQ=255) gTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCg > 1:334810/1‑150 (MQ=255) tACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGt > 1:3704095/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGc < 1:2784923/150‑1 (MQ=255) cGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGt < 1:3258437/150‑1 (MQ=255) cGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGt > 1:2837767/1‑150 (MQ=255) cGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGt < 1:1934970/150‑1 (MQ=255) gTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGttt < 1:3105502/150‑1 (MQ=255) gTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGttt > 1:436010/1‑150 (MQ=255) tttACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTcc < 2:1810048/150‑1 (MQ=255) ccGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTc > 1:572353/1‑150 (MQ=255) cGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTcg < 2:1277560/150‑1 (MQ=255) ccATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTcgcg < 1:2082958/150‑1 (MQ=255) aTGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGaa > 1:3777516/1‑150 (MQ=255) aTGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGAGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGaa > 2:4150461/1‑150 (MQ=255) gCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAg < 2:2628757/150‑1 (MQ=255) tgtgtgtgATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGAGTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTa < 2:3880828/150‑1 (MQ=255) tgtgATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCa > 2:291997/1‑150 (MQ=255) gtgATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCAt < 1:3418416/150‑1 (MQ=255) gATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGa < 2:809940/150‑1 (MQ=255) gATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGa < 1:2446771/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCTTTGCGCTGCTGCATAAGTTTTGTTATCAGGTAGTTTCCTTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCTTTAat < 2:694054/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAatat < 1:2895330/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGAGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAatat < 1:678883/150‑1 (MQ=255) gcTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGTAGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGTTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCt < 1:2937329/150‑1 (MQ=255) tGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGa < 1:4050018/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGtt < 1:1725580/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGtt < 2:2516522/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAgg < 2:2866720/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAgg < 2:3125339/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTg < 2:1348745/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTg < 1:1844449/150‑1 (MQ=255) tgtTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGAAGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCGGCTGCATCAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATCTCTGAAATGGTTAGGTGc > 2:3340587/1‑150 (MQ=255) gtTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCt < 2:1086368/150‑1 (MQ=255) tCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAg < 2:2384903/150‑1 (MQ=255) tCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGAGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAg < 2:3909962/150‑1 (MQ=255) cGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGc < 2:2730350/150‑1 (MQ=255) gCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGcc < 1:1346468/150‑1 (MQ=255) cccGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCg > 2:1267887/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCg > 2:2797561/1‑150 (MQ=255) aGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTtc < 1:316799/150‑1 (MQ=255) ggACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTtct < 1:3523921/150‑1 (MQ=255) gACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTtctc > 2:34680/1‑150 (MQ=255) aCGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTcc < 1:3509074/150‑1 (MQ=255) ggggAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAACGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCt < 2:2120454/150‑1 (MQ=255) gggAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTc > 2:3527345/1‑150 (MQ=255) aTTGTCGTGTCGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGtgat < 2:3789504/150‑1 (MQ=255) tGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGtgatga < 1:602583/150‑1 (MQ=255) cGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGtt < 2:3777516/150‑1 (MQ=255) gTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGttt > 2:2352137/1‑150 (MQ=255) gTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGttt < 1:2708139/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGcc < 2:2535003/150‑1 (MQ=255) cGGGTGCCAGTGGTGGAGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCg > 1:565702/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAAt < 1:166104/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATcc > 1:2157190/1‑150 (MQ=255) ccAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATccc < 1:838938/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATCCCg > 2:2032514/1‑150 (MQ=255) aGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATCCCGt > 2:491402/1‑150 (MQ=255) gtggCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATCCCGTCctc < 1:597476/150‑1 (MQ=255) tggCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATCCCGTCctct < 1:181738/150‑1 (MQ=255) tggAGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATCCCGTCctct > 1:1167040/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATCCCGTCCTCTGGa < 1:1485515/150‑1 (MQ=255) | CTGGTTGCCATGCCGCAAGGGCTGGACGCGCGTAAAGCAATGATTATCGGTACTGCCGGTTTTACCGCCATGCTGTGTGTGATGGCGCTGGAAGATGCCGGTGTTCGCCCGCAGGACGGGGAGATTGTCGTGACGGGTGCCAGTGGTGGCGTCGGCAGTACCGCCGTGGCGCTGCTGCATAAGTTGGGTTATCAGGTCGTTGCCGTTTCCGGTCGCGAAAGTACCCATGAATATCTGAAAAGTTTAGGTGCTAGCCGTGTTCTCCCTCGTGATGAGTTTGCCGAATCCCGTCCTCTGGA > CP009273/3397167‑3397465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |