| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,577,849 | 0 | G | A | 11.3% | 852.9 / 72.8 | 266 | intergenic (+180/‑270) | yrhA/yrhB | pseudogene, interrupted by IS1E/stable heat shock chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (114/122); new base A (4/26); total (118/148) | |||||||||||
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Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
CCATGCCATCTTTTTAGAGATTACCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACTTATTTCGTGACTATATCTTATC > CP009273/3577700‑3577998 | cATGCCATCTTTTTAGAGATTACCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGc > 2:2269001/1‑150 (MQ=255) cATGCCATCTTTTTAGAGATTACCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGc > 1:139007/1‑150 (MQ=255) cATGCCATCTTTTTAGAGATTACCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGc < 1:3108462/150‑1 (MQ=255) 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ttttAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACtt < 2:3772567/150‑1 (MQ=255) aGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACTTAttt < 2:865345/150‑1 (MQ=255) gCCGAAATAGCTAATGACTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACTTATTTc < 2:2462174/150‑1 (MQ=255) ccGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACTTATTTCg < 2:2652444/150‑1 (MQ=255) ccGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACTTATTTCg < 2:2559609/150‑1 (MQ=255) 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tGGCTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACTTATTTCGTGACTATATCTTa < 1:2128321/150‑1 (MQ=255) tGGCTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACTTATTTCGTGACTATATCTTa > 1:1315400/1‑150 (MQ=255) | CCATGCCATCTTTTTAGAGATTACCAGCAGAAAATTCCTTGTTCGAAATTTAGCAGTGCAAGCTATGGAAAAACTTACAACGGAACTACACTCCTTAAGTGAGATGGACCGAAGACATGTAGTCTCTATTTTAGCCGAAATAGCTAATGGCTATGATGATTTTAATGACATGTTGATTTATTTAGAATTTTACCCGAATCATAAGATTCTGATATCTTAAATAAGAAAATCCCGTTCGACGTTCTGAAAAAGAAATCATAAAATATTAGCAGATACTTATTTCGTGACTATATCTTATC > CP009273/3577700‑3577998 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |