| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,701,561 | G→A | 34.7% | intergenic (‑496/+415) | dppA ← / ← proK | dipeptide transporter/tRNA‑Pro |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,701,561 | 0 | G | A | 34.7% | 370.8 / 292.0 | 280 | intergenic (‑496/+415) | dppA/proK | dipeptide transporter/tRNA‑Pro |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (89/93); new base A (61/36); total (151/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.19e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
AAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCA > CP009273/3701412‑3701710 | gTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGt < 1:2407919/150‑1 (MQ=255) ttttATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAATACAATGGtt > 1:3510179/1‑150 (MQ=255) ttATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACATCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTc > 2:2020612/1‑150 (MQ=255) ttATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTc > 1:4076898/1‑150 (MQ=255) ttGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTg > 1:575415/2‑150 (MQ=255) tGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAAGGGTTTCTGt > 2:2088486/1‑150 (MQ=255) cATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTca < 2:3823298/150‑1 (MQ=255) aTTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTACCGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTcac > 1:2217304/1‑150 (MQ=255) tAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACaaa > 2:2517595/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGtt > 1:3793991/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTa < 1:3873656/150‑1 (MQ=255) aaaaaTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTa > 1:1617373/1‑150 (MQ=255) aaaaTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTaa > 1:1778565/1‑150 (MQ=255) aaaaTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTaa > 1:3503967/1‑150 (MQ=255) aaaTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAAt < 1:103684/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAAt < 1:2175547/150‑1 (MQ=255) aaTCTGAGTAATAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAATATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATg < 1:2596655/150‑1 (MQ=255) aTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTCATgg > 1:3480474/1‑150 (MQ=255) aTCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATgg > 2:1703187/1‑150 (MQ=255) tCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACACTGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGa > 2:710817/1‑150 (MQ=255) cTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGAt > 2:2992510/1‑150 (MQ=255) cTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGAt > 2:1781411/1‑150 (MQ=255) tGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCACATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATa > 2:211398/1‑150 (MQ=255) tGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATa > 1:1034863/1‑150 (MQ=255) tGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATa < 1:2101831/150‑1 (MQ=255) tGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATa > 1:2797987/1‑150 (MQ=255) tGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATa > 1:3115117/1‑150 (MQ=255) gAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAg > 2:1383798/1‑150 (MQ=255) aGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGt < 1:3602891/150‑1 (MQ=255) ggAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTg < 1:447338/150‑1 (MQ=255) gAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACACTAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTga > 2:2727909/1‑150 (MQ=255) gAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTga > 1:775408/1‑150 (MQ=255) gAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTga > 1:1082683/1‑150 (MQ=255) aGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGata < 2:2601825/150‑1 (MQ=255) ggTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGatat < 1:3083845/150‑1 (MQ=255) ggTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGatat > 2:622917/1‑150 (MQ=255) gTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATg > 1:1845941/1‑150 (MQ=255) ggATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATCGGGAGATATggg > 2:3055965/1‑150 (MQ=255) ggATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATggg > 1:658748/1‑150 (MQ=255) ggATATCTGAGCGATTAATACCAGGAACGCTAAAACTCACTGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCTTAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACATATCCGTTAATGGATAGTGAGATATggg < 2:4117001/150‑1 (MQ=255) acatCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGgc > 1:59683/3‑150 (MQ=255) tatCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGgcg > 1:1672436/1‑150 (MQ=255) cGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTg < 2:1188968/150‑1 (MQ=255) gATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTCACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTgg > 2:1564298/1‑150 (MQ=255) gATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTgg < 1:1158652/150‑1 (MQ=255) ttAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCCAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCa > 2:2845498/1‑150 (MQ=255) tAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAg > 1:4097068/1‑150 (MQ=255) aCCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGaa > 1:202338/1‑150 (MQ=255) aTGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAAtg < 2:1089239/150‑1 (MQ=255) aTGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAAtg < 1:3734067/150‑1 (MQ=255) aTGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCAAGGGCCAGCCATAAGTAACGAAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAAtc < 1:27414/150‑2 (MQ=255) gAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAAGCCGTTAATGGATAGTGAGAGATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAAtgtg > 1:3194368/1‑150 (MQ=255) gAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAAtgtg > 1:1822378/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCgtg < 2:1805804/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCgtg < 2:3419690/150‑1 (MQ=255) aaaCGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCgtgt < 1:1528646/150‑1 (MQ=255) aaaCGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCgtgt > 2:3484563/1‑150 (MQ=255) acaGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCg > 1:899153/1‑150 (MQ=255) aaTGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATTAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCg < 2:1524085/150‑1 (MQ=255) tGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGt < 2:1230221/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACACTGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTcg < 1:1969867/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTcg > 2:3666493/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTcg < 1:229247/150‑1 (MQ=255) aGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTcgcg < 1:3994371/150‑1 (MQ=255) aGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTcgcg < 1:2274132/150‑1 (MQ=255) gccagccaTAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGcgccg < 1:4152167/150‑1 (MQ=255) ccaTAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATcc > 2:324720/1‑150 (MQ=255) ccaTAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATcc < 1:1460469/150‑1 (MQ=255) aTAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGa < 2:1503622/150‑1 (MQ=255) tAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGAc < 2:1004339/150‑1 (MQ=255) aaGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACa < 2:1449558/150‑1 (MQ=255) aGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACaa > 1:3308054/1‑150 (MQ=255) tAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATg < 1:2666066/150‑1 (MQ=255) aaCGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATgg > 1:1892484/1‑150 (MQ=255) aaCGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATgg > 2:3991326/1‑150 (MQ=255) cGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGcc < 2:1346331/150‑1 (MQ=255) cGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGcc > 1:626000/1‑150 (MQ=255) cAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAANACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCgg > 1:3854159/1‑150 (MQ=255) aaaaaaGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGca > 2:3876232/1‑150 (MQ=255) aaaaGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGcaca < 2:770780/150‑1 (MQ=255) aaaGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATACGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGAATGGAAATGTGAGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACAt > 1:2920475/1‑150 (MQ=255) aaGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACAtt > 1:711162/1‑150 (MQ=255) aGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACAttt > 1:3160707/1‑150 (MQ=255) gacttAAGCAAATATAAAAAAAGACACTAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTg < 1:3866789/147‑1 (MQ=255) gATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTg < 1:1224296/150‑1 (MQ=255) aTTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGc > 1:2143421/1‑150 (MQ=255) tttAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGcc > 2:2238671/1‑150 (MQ=255) tAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTg < 2:3349507/150‑1 (MQ=255) aaGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATTGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGa > 1:1552620/1‑150 (MQ=255) aGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGAt < 2:921674/150‑1 (MQ=255) aGCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGAt < 1:1193094/150‑1 (MQ=255) gCAAATATAAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATg < 1:1496326/150‑1 (MQ=255) aaaaTATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGc < 2:198718/149‑1 (MQ=255) aaaTATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCg < 2:1407676/150‑1 (MQ=255) ataAAAAAAGACAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGc > 1:2719211/1‑150 (MQ=255) aaaaGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGAcg > 2:1904773/1‑150 (MQ=255) gACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTc > 2:3154351/1‑150 (MQ=255) aCAATAGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGCTAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCt < 2:2201459/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCa < 2:235282/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCa < 2:1845955/150‑1 (MQ=255) | AAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCA > CP009273/3701412‑3701710 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |