Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,890,865 | T→A | 8.7% | intergenic (+66/‑1) | yieH → / → cbrB | phosphoenolpyruvate and 6‑phosphogluconate phosphatase/PRK09823 family inner membrane protein, creBC regulon |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,890,865 | 0 | T | A | 8.7% | 813.2 / 51.6 | 248 | intergenic (+66/‑1) | yieH/cbrB | phosphoenolpyruvate and 6‑phosphogluconate phosphatase/PRK09823 family inner membrane protein, creBC regulon |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (95/131); new base A (12/10); total (107/141) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TTCACCCGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATT > CP009273/3890717‑3891014 | ttCACCCGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTACAGGGAGTTTGata > 2:2453275/1‑150 (MQ=255) ttCACCCGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGata > 1:498934/1‑150 (MQ=255) tCACCCGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGatat < 2:2446957/150‑1 (MQ=255) tCACCCGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCATTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGatat > 1:4030211/1‑150 (MQ=255) cccGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTc < 2:4097206/150‑1 (MQ=255) ccGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCt < 1:2388421/150‑1 (MQ=255) cGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTg < 2:1319329/150‑1 (MQ=255) aaGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGttt < 1:2890940/150‑1 (MQ=255) aaGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGttt > 1:2703285/1‑150 (MQ=255) aaGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGAAATGTCTGttt > 1:14923/1‑150 (MQ=255) aGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTc < 1:2166340/150‑1 (MQ=255) gTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCa < 1:4023313/150‑1 (MQ=255) tCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCAc > 1:816235/1‑150 (MQ=255) ccaccTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTc > 1:3416787/1‑150 (MQ=255) accTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCgg > 1:3846846/1‑150 (MQ=255) accTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCgg < 1:1627019/150‑1 (MQ=255) ccTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCggg < 1:591186/150‑1 (MQ=255) ccTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCggg < 1:1931072/150‑1 (MQ=255) tACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAAt > 2:1871001/1‑150 (MQ=255) tACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAAt > 1:461377/1‑150 (MQ=255) ccATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACa > 2:2203430/1‑150 (MQ=255) aTCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATc < 2:2534186/150‑1 (MQ=255) gCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACt < 2:2217530/150‑1 (MQ=255) aGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACttt > 1:1697649/1‑150 (MQ=255) gTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTa > 2:4053953/1‑150 (MQ=255) ccTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTAtttt > 1:1599427/1‑150 (MQ=255) cTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTg < 1:1813841/150‑1 (MQ=255) cTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTg < 1:318637/150‑1 (MQ=255) aaCTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAg < 2:1478441/150‑1 (MQ=255) tgtgGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGttt < 2:2411221/150‑1 (MQ=255) tgGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTa < 2:133308/150‑1 (MQ=255) tgGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTa < 2:164645/150‑1 (MQ=255) tgGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTa < 2:640095/150‑1 (MQ=255) ggAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAg < 1:1646246/150‑1 (MQ=255) gAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAgg < 1:611141/150‑1 (MQ=255) aaaGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGa > 1:3185973/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGa < 2:124500/150‑1 (MQ=255) aaaGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGa < 2:2417641/150‑1 (MQ=255) aaGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGAc > 1:1917677/1‑150 (MQ=255) aaGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGAc > 2:786784/1‑150 (MQ=255) aGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGAcc < 2:3711612/150‑1 (MQ=255) aGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGAcc < 1:1145866/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCg < 2:919391/150‑1 (MQ=255) cgcgTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGt < 2:3958514/150‑1 (MQ=255) tGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAAt < 1:3926209/150‑1 (MQ=255) tGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCAAACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAAt > 2:352267/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAAtt < 1:1985936/150‑1 (MQ=255) tGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGgt < 1:3060666/150‑1 (MQ=255) gggATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGgtg > 1:1424601/1‑150 (MQ=255) gATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCACGATTAAATTGGCGCTCATAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGtt < 1:889602/150‑1 (MQ=255) ttcgtcATAGTTCTTCACTCTACCTTCACTTACGCCGCTTAAATTTGCGCTCAAAGGTAAGTATAGGGAGTTTGATTTTTCTGTTTCACGTCTGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGTTGTTCTGtt < 2:1002546/145‑1 (MQ=255) tACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGtt > 2:1030441/1‑150 (MQ=255) ggCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCt < 1:1835263/150‑1 (MQ=255) ggCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCt > 2:3619712/1‑150 (MQ=255) cATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTg < 2:3983327/150‑1 (MQ=255) aGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTcc < 2:3214118/150‑1 (MQ=255) tcttcACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCctct < 2:2880342/150‑1 (MQ=255) tcttcACACTCCCTTCACTTACCCCGATTAATTTGGCGCTCAACGGTATGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCctct < 2:3026019/150‑1 (MQ=255) cacaCTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACat > 1:3751209/1‑150 (MQ=255) cacaCTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACat < 2:750438/150‑1 (MQ=255) acacTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACata > 2:3070902/1‑150 (MQ=255) acTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATAtt > 2:2616974/1‑150 (MQ=255) tCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATAttct < 2:3315393/150‑1 (MQ=255) tCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATGTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATAttct > 2:3399844/1‑150 (MQ=255) tCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATAttct < 1:896195/150‑1 (MQ=255) tCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATAttct < 1:2211190/150‑1 (MQ=255) cccTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATAttctt > 1:2350355/1‑150 (MQ=255) cccTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATAttctt < 1:413654/150‑1 (MQ=255) ccTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATAttcttc < 1:701728/150‑1 (MQ=255) cTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCg < 2:1179784/150‑1 (MQ=255) cTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACACATTCTTCg > 2:2335681/1‑150 (MQ=255) cACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCaa > 2:1696246/1‑150 (MQ=255) aCTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCaaa > 1:2399029/1‑150 (MQ=255) ttACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAg > 1:2080998/1‑150 (MQ=255) cccGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAAcc > 2:2034410/1‑150 (MQ=255) ccGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCg > 1:2106349/1‑150 (MQ=255) cGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGc > 1:2687442/1‑150 (MQ=255) ttAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTgg > 2:1773383/1‑150 (MQ=255) aaaTTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGtt < 2:263620/150‑1 (MQ=255) aaTTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTc > 2:3989301/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCt < 1:2824778/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCtt < 1:3467509/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCttt < 2:1805805/150‑1 (MQ=255) cgcTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTggg > 1:791399/1‑150 (MQ=255) cgcTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTggg > 1:2599327/1‑150 (MQ=255) cgcTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTATGATATGTCTGTTTCACGTCGGGAAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGATAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCAACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTGCTTTggg > 1:996573/1‑150 (MQ=255) cTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTg < 2:731866/150‑1 (MQ=255) cAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGat > 1:1570132/1‑150 (MQ=255) aaaGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGata < 2:3097481/150‑1 (MQ=255) aaGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGataa < 2:2095684/150‑1 (MQ=255) aaGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATACTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGataa > 1:1003095/1‑150 (MQ=255) aGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGataat < 1:313898/150‑1 (MQ=255) taagtaaAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACa < 1:35766/150‑1 (MQ=255) gtaaAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATcc > 1:2968223/1‑150 (MQ=255) aGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTtc > 1:3268963/1‑150 (MQ=255) aGTTTGAAATGTCTGTTTCACGTAGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCTCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTtc > 2:3688463/1‑150 (MQ=255) tGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCtt < 1:3220557/150‑1 (MQ=255) tGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCtt < 1:1273531/150‑1 (MQ=255) gATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTa < 2:2760715/150‑1 (MQ=255) tatGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTAtt > 2:466782/1‑150 (MQ=255) | TTCACCCGAAAGTCACCACCTTTACCCATCTTTCGCAGTTACCTGAACTGTGGAAAGCGCGTGGTTGGGATATTACGGCATAGTTCTTCACACTCCCTTCACTTACCCCGCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATT > CP009273/3890717‑3891014 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |