Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 399,531 | G→T | 9.0% | A125S (GCG→TCG) | yaiC → | diguanylate cyclase, cellulose regualtor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 399,531 | 0 | G | T | 9.0% | 952.1 / 43.7 | 255 | A125S (GCG→TCG) | yaiC | diguanylate cyclase, cellulose regualtor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (112/119); new base T (10/14); total (122/133) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
TGGGCGTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTGCGCCGCTGGAATG > CP009273/399384‑399679 | tGGGCGTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACcgcg > 2:909922/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTTCGTCTGGCCGCATTGAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACcgcg < 2:177099/150‑1 (MQ=255) gggCGTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGa < 1:2724488/150‑1 (MQ=255) cGTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGt > 1:3389730/1‑150 (MQ=255) cGTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGt < 1:3312374/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACATCTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCGTCCACCGCGATGtt < 2:689380/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGtt > 2:2913987/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGtt < 2:3192428/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGtt < 2:127557/150‑1 (MQ=255) tCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTtga < 1:896981/150‑1 (MQ=255) tCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTtga < 2:2324893/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTtgat > 2:2661920/1‑150 (MQ=255) cGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTtgat < 1:2643538/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGAtt > 1:2837214/1‑150 (MQ=255) ggCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTa < 2:834528/150‑1 (MQ=255) gCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTAt > 1:2051138/1‑150 (MQ=255) gCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTAtgtg < 2:3371403/150‑1 (MQ=255) cATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATgtgt < 1:643142/150‑1 (MQ=255) aTTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTc > 1:2389257/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGAAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGaa > 2:3428144/1‑150 (MQ=255) ccTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAAtt < 1:1261479/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAAttt < 2:3335069/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAAttt > 2:17783/1‑150 (MQ=255) gCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGAt < 1:2037620/150‑1 (MQ=255) cAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATg < 2:3279405/150‑1 (MQ=255) aGATAGCGTGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATgg > 2:3034173/1‑150 (MQ=255) aTAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAATCACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGTTAGGCGTAATTGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATgggg < 1:2143204/150‑1 (MQ=255) tAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATggggg < 2:3391318/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTACACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGAtggtgga > 2:2626585/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACCACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAg < 1:2445544/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAg < 2:3064538/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGAGGGTAGGCGTAATGGTCGTAAACGTGATGCCTTCCACCGCGATGTTGATTATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAgg > 2:1988209/1‑150 (MQ=255) gggCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTAGGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGcc > 1:1414257/1‑150 (MQ=255) gggCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGACTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGcc < 1:2221796/150‑1 (MQ=255) ggCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGccc > 1:3289368/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGccc < 2:1002888/150‑1 (MQ=255) cGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCg < 1:3166849/150‑1 (MQ=255) cGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCg > 2:3210102/1‑150 (MQ=255) aTCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGt > 1:1163855/1‑150 (MQ=255) tCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGtt > 1:753574/1‑150 (MQ=255) ccGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCGTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGttt < 2:2175446/150‑1 (MQ=255) gCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGt > 1:1476502/1‑150 (MQ=255) gCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGt > 2:3557391/1‑150 (MQ=255) cTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTc < 2:3630351/150‑1 (MQ=255) cTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTc < 1:4174567/150‑1 (MQ=255) ccGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCggg < 1:3667515/150‑1 (MQ=255) gggAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTc < 1:1601328/150‑1 (MQ=255) ggAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCt < 1:2098646/150‑1 (MQ=255) ggAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCt < 1:1865562/150‑1 (MQ=255) ggAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCt < 1:1381449/150‑1 (MQ=255) gAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGGTTGTCGCGGGTCTg > 2:779328/1‑150 (MQ=255) aaTTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGgt < 2:2074268/150‑1 (MQ=255) aTTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGgtg > 1:2596621/1‑150 (MQ=255) tttACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGgtgt < 2:3238093/150‑1 (MQ=255) ttACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGtt > 2:4143734/1‑150 (MQ=255) tACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTg > 1:1815867/1‑150 (MQ=255) aCAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGa < 2:2124071/150‑1 (MQ=255) cAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGAt > 1:1754810/1‑150 (MQ=255) cTTAAAAACCGATGCAGTATTATCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCATCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCTGGTCTGGTGTTGAtggt > 2:2909323/1‑150 (MQ=255) cTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGAtggt < 1:2497731/150‑1 (MQ=255) tAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGAtggtgg > 1:5896/1‑150 (MQ=255) taaaCAGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGAGTAATGGTCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGtt < 2:3963463/149‑1 (MQ=255) aaaCCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGttt > 2:2581087/1‑150 (MQ=255) aaCCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGGGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTc < 2:2855546/150‑1 (MQ=255) aCCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTcc < 2:1867495/150‑1 (MQ=255) ccGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTcca < 2:3529940/150‑2 (MQ=255) cGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTg < 1:3959227/150‑1 (MQ=255) aGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGt > 1:2092611/1‑150 (MQ=255) gTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTc > 1:3132621/1‑150 (MQ=255) ttAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCAcc < 2:1690278/150‑1 (MQ=255) aGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCt > 1:3779685/1‑150 (MQ=255) cGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCg > 1:2923072/1‑150 (MQ=255) cGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCg < 2:2454491/150‑1 (MQ=255) gggAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGa > 2:3476367/1‑150 (MQ=255) gggAATGTGGGTAGGCGGAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGa > 1:3967137/1‑150 (MQ=255) ggAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAg < 2:988219/150‑1 (MQ=255) ggAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCGTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTTAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAg < 1:3047812/150‑1 (MQ=255) aTGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTg < 2:2539428/150‑1 (MQ=255) aGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCAt > 2:4084619/1‑150 (MQ=255) ggCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGGGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCAtt > 2:3126400/1‑150 (MQ=255) gTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGGTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTAcc > 2:1221470/1‑150 (MQ=255) aaTGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCgt > 1:2581416/1‑150 (MQ=255) aaTGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGAGGGTGGGTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCgt > 2:3689942/1‑150 (MQ=255) gggCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTc < 1:1399462/150‑1 (MQ=255) ggCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCTCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCg > 1:1038840/1‑150 (MQ=255) ggCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCg < 1:1980801/150‑1 (MQ=255) ggCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCg < 2:2552680/150‑1 (MQ=255) gTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTc < 1:3246048/150‑1 (MQ=255) tAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCa < 1:909922/150‑1 (MQ=255) aaaCGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCaa > 1:2989507/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAg > 2:2535939/1‑150 (MQ=255) tgctgcCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTg > 1:548896/1‑150 (MQ=255) tgctgcCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTg < 2:3875548/150‑1 (MQ=255) tgcCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTgcgc > 1:3524420/1‑150 (MQ=255) ccTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTGcgccg < 1:3493703/150‑1 (MQ=255) cTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTGcgccgc > 2:1430823/1‑150 (MQ=255) ttCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTGCGCCGCt < 2:1478563/150‑1 (MQ=255) ccACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTGCGCCGCTgg > 2:2683839/1‑150 (MQ=255) cACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTGCGCCGCTGGa > 2:1535173/1‑150 (MQ=255) ccGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTGCGCCGCTGGAAt < 1:4141468/150‑1 (MQ=255) | TGGGCGTTCGTCTGGCCGCATTTAGCCTGGCAGATAGCGAGCAGGGCCGTCGATCCGCTTAGCCGGGAAATTTACAACTTAAAAACCGATGCAGTATTAGCGGGAATGTGGGTAGGCGTAATGGGCGTAAACGTGCTGCCTTCCACCGCGATGTTGATGATTATGTGTCTGAATTTGATGGGGGCAGGCGGCCCCCGTCTGTTTGTCGCGGGTCTGGTGTTGATGGTGGTTTCCTGCCTTGTCACCCTCGAGCTGACGGGCATTACCGTGTCGTTCAATAGTGCGCCGCTGGAATG > CP009273/399384‑399679 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |