| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,055,246 | T→A | 8.4% | L241Q (CTG→CAG) | yihM → | putative sugar phosphate isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,055,246 | 0 | T | A | 8.4% | 750.2 / 45.6 | 234 | L241Q (CTG→CAG) | yihM | putative sugar phosphate isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (104/110); new base A (12/8); total (116/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
CGCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCATTTAC > CP009273/4055097‑4055395 | cGCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCt < 1:2781734/150‑1 (MQ=255)cGCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCt > 2:272358/1‑150 (MQ=255)cGCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCt > 2:2620140/1‑150 (MQ=255)cGCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCt > 1:3187542/1‑150 (MQ=255)cGCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCt > 1:1354908/1‑150 (MQ=255)cGCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCt > 2:1591390/1‑150 (MQ=255) gCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTg > 2:1220672/1‑150 (MQ=255) ttAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGt < 2:359903/150‑1 (MQ=255) tAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGtg < 1:2546970/150‑1 (MQ=255) aaaCGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGtgatg < 1:1195999/150‑1 (MQ=255) aaaCGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGtgatg > 2:4065059/1‑150 (MQ=255) aaCGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCAGGGtgatga > 1:1656111/1‑150 (MQ=255) gATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGtgatgatga > 1:1473551/1‑150 (MQ=255) atatTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGa < 1:1322985/150‑1 (MQ=255) atTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCAGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACg > 2:3555550/1‑150 (MQ=255) tACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGc < 1:147169/150‑1 (MQ=255) tACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGc > 1:813742/1‑150 (MQ=255) tACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCAGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGc > 1:2488303/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCata > 2:1434614/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCAGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCata < 2:809987/150‑1 (MQ=255) aGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATg > 1:2665576/1‑150 (MQ=255) ggTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATgg < 2:2831555/150‑1 (MQ=255) gTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGc > 2:2598750/1‑150 (MQ=255) gTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGc > 2:515163/1‑150 (MQ=255) cATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTg > 2:2408860/1‑150 (MQ=255) atCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGgaa > 2:2659429/1‑150 (MQ=255) aaaGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGgaagaa > 1:66175/1‑150 (MQ=255) aaGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGaagaag > 1:1025769/1‑150 (MQ=255) aTGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAgg < 1:1665588/150‑1 (MQ=255) gCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGtt > 1:2367856/1‑150 (MQ=255) gCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGtt < 1:2865826/150‑1 (MQ=255) gCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGtt < 1:2865971/150‑1 (MQ=255) ccTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTg > 1:2046749/1‑150 (MQ=255) cTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGa < 1:1194120/150‑1 (MQ=255) cTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGa > 2:164739/1‑150 (MQ=255) tGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGAtt < 2:742412/150‑1 (MQ=255) tGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGAtt > 2:424113/1‑150 (MQ=255) gATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTa > 1:1075878/1‑150 (MQ=255) aTCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTAc < 1:1885282/150‑1 (MQ=255) cGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTa > 1:3674252/1‑150 (MQ=255) cGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGt > 1:431294/1‑150 (MQ=255) cGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGt < 1:1079636/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTc > 1:180535/1‑150 (MQ=255) gTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTcc < 2:2052870/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCGGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGc > 2:3399251/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCt < 2:1375621/150‑1 (MQ=255) cTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCttt < 2:4034726/150‑1 (MQ=255) cTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCttt > 2:3088886/1‑150 (MQ=255) gggTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGa < 2:1976040/150‑1 (MQ=255) gTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAg < 2:980743/150‑1 (MQ=255) tCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGa < 1:2680327/150‑1 (MQ=255) tAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGa > 1:764033/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGaa < 1:2284723/150‑1 (MQ=255) aaaGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGaa < 1:1889721/150‑1 (MQ=255) ccTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCAGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAgatg > 1:870099/1‑150 (MQ=255) ccTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCAGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAgatg > 1:2708705/1‑150 (MQ=255) tGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAgatgat < 2:3526950/150‑1 (MQ=255) tGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAgatgat < 1:314521/150‑1 (MQ=255) tGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAgatgat > 1:3645344/1‑150 (MQ=255) tcaggtcaggGTGATATGGCGTTCAAAGCGTTATTAAAGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGGCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCg < 2:2194262/150‑1 (MQ=255) taggtcaggGTGATATGACGTTCAAAGAGTTATTAACGCACCTTATCGGCCAGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCTTTCCGCTTTGAATACGATGATGATATTcctt < 2:1235301/149‑3 (MQ=255) ggtcaggGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTgg > 1:2231027/1‑150 (MQ=255) ggtcaggGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTgg < 2:3853239/150‑1 (MQ=255) gtcaggGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGa > 2:2362781/1‑150 (MQ=255) tcaggGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGAt < 2:3289384/150‑1 (MQ=255) ggTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCTCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCt < 2:494033/150‑1 (MQ=255) ggTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCt < 1:3934729/150‑1 (MQ=255) ggTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCt < 1:2946147/150‑1 (MQ=255) gTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCtt > 1:3462656/1‑150 (MQ=255) gTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCAGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCtt < 1:2857969/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGcc < 2:4107309/150‑1 (MQ=255) cGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGa < 2:902234/150‑1 (MQ=255) gTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGAt > 2:2864314/1‑150 (MQ=255) ttCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATg > 1:408210/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGGTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAg > 1:1799807/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGt < 2:1993055/150‑1 (MQ=255) aGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGa > 2:3946269/1‑150 (MQ=255) aGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGa > 1:3021983/1‑150 (MQ=255) aGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGa > 1:3236719/1‑150 (MQ=255) cGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGaaa < 2:1155643/150‑1 (MQ=255) tattaACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAacac > 1:3723632/1‑150 (MQ=255) taACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCAt > 2:3679449/1‑150 (MQ=255) aaCGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCAtt < 1:91521/150‑1 (MQ=255) cGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGc < 2:3321758/150‑1 (MQ=255) cGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGc > 2:1785094/1‑150 (MQ=255) cGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGc > 2:1812644/1‑150 (MQ=255) cACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCa > 2:3201482/1‑150 (MQ=255) aCCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAg > 1:2958843/1‑150 (MQ=255) cTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGaa > 1:893051/1‑150 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAAt > 2:3864973/1‑150 (MQ=255) tCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATc < 2:607374/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCAtt > 1:2263688/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCAtt < 1:591673/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTGATGATTAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTAGATAACTATGCGCCGGCGTACCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATAGCCAGATGAGTGAAACACCATTTCCAGAAAATCAtat > 2:69049/1‑148 (MQ=255) ccTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCAttt < 1:1738232/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCATTTa > 1:1433054/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCATTTa > 1:1433025/1‑150 (MQ=255) tGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCATTTAc > 2:1817164/1‑150 (MQ=255) tGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCATTTAc > 2:3454908/1‑150 (MQ=255) tGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCATTTAc > 2:1030016/1‑150 (MQ=255) | CGCTTTAAAAACGATGGCACCGCATATTACCCAGGTCCATATCAAAGATGCCTTGATCGTTAAAGAACCGGGTGGCCTGGGTCATAAAGCCTGTATTTCAGGTCAGGGTGATATGCCGTTCAAAGCGTTATTAACGCACCTTATCTGCCTGGGTGATGATGAGCCGCAGGTGACGGCATATGGCCTGGAAGAAGAGGTTGATTACTATGCGCCGGCGTTCCGCTTTGAAGACGAAGATGATAATCCGTGGATCCCTTATCGCCAGATGAGTGAAACACCATTGCCAGAAAATCATTTAC > CP009273/4055097‑4055395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |