Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 738,124 | 1 | . | T | 46.0% | inf / inf | 226 | intergenic (‑112/‑159) | dtpD/ybgI | dipeptide and tripeptide permease D/NIF3 family metal‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (58/64); new base T (49/55); total (107/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
AGTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGA‑T‑TGCATAAATATACATTAGCTGAAGCGTGATGATATAAACAATTTGCGTCTTTTGGCGTCGGGTTTGTTTCTTAATATGTCAAAAGATTGGCTATCGACGAACTGGCGAGGTAACGCTATGTTAACGGTGTAGCTATCAGAATACGGA > CP009273/737976‑738272 | aGTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGA‑t < 1:1005785/150‑1 (MQ=255) aGTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGA‑t > 2:932801/1‑150 (MQ=255) aGTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGA‑t > 2:4359120/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |