New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009273 | 3744959 = | 265 (1.010) | 526 (2.010) | 198/278 | NT | 67.6% | coding (270/741 nt) | yiaT | putative outer membrane protein |
? | CP009273 | = 3752673 | 240 (0.910) | coding (549/1845 nt) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
Only 100 of 567 total aligned reads displayed.
ATGAAAATACGAAGGCAATTCCGCTGATTAGTTATGAAGGTGATACTTTTTATGTTCGTCAGACCACGTTAGGTTTTATTCTGTCGCAAAGTGAAAAAAATGAACTTAGCCTGACCGCATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3745107‑3744959 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCAAT < CP009273/3752673‑3752526 ATGAAAATACGAAGGCAATTCCGCTGATTAGTTATGAAGGTGATACTTTTTATGTTCGTCAGACCACGTTAGGTTTTATTCTGTCGCAAAGTGAAAAAAATGAACTTAGCCTGACCGCATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCT < 1:2060329/150‑1 GAAAATACGAAGGCAATTCCGCTGATTAGTTATGAAGGTGATACTTTTTATGTTCGTCAGACCACGTTAGGTTTTATTCTGTCGCAAAGTGAAAAAAATGAACTTAGCCTGACCGCATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTAC > 1:135029/1‑150 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ATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATG > 2:3667892/1‑150 TCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTACATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGC > 1:2452195/1‑150 GGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAA > 2:4239880/1‑150 GGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAA > 1:2539052/1‑150 ATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAA > 1:2307633/1‑150 ATGCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAA > 1:3918282/1‑150 GCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACC < 2:3867673/150‑1 GCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACC < 2:607149/150‑1 GCCGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACC < 1:3253678/150‑1 CGCTGGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAG < 2:1796157/150‑1 GGAATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAA > 2:50090/1‑150 AATTTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACA > 1:1476239/1‑150 TTGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAA < 2:549840/150‑1 TGACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAA > 2:65961/1‑150 ACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACC > 1:2946701/1‑150 ACCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACC < 1:562100/150‑1 CCCTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCG < 2:3547419/150‑1 CTACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCC > 2:3054966/1‑150 TACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCA < 1:3212425/150‑1 ACCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCAA < 2:1993478/150‑1 CCTACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCAAT > 1:914800/1‑150 ATGAAAATACGAAGGCAATTCCGCTGATTAGTTATGAAGGTGATACTTTTTATGTTCGTCAGACCACGTTAGGTTTTATTCTGTCGCAAAGTGAAAAAAATGAACTTAGCCTGACCGCATCCTGGATGCCGCTGGAATTTGACCCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3745107‑3744959 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCGTAAAAGGTGCCGGGCTGGTCGTCACCGGTACGGCGTTAAGCGGGGAAGTGAAGGTAGGCGATTCACTCTGGCTGACTGGTGTAAATAAACCGATGCGTGTACGTGCGCTGCATGCGCAAAACCAGCCAACAGAAACCGCCAAT < CP009273/3752673‑3752526 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |