| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,258,871 | G→T | 7.7% | L173I (CTC→ATC) | tdcB ← | L‑threonine dehydratase, catabolic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,258,871 | 0 | G | T | 7.7% | 1018.7 / 35.9 | 271 | L173I (CTC→ATC) | tdcB | L‑threonine dehydratase, catabolic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (116/133); new base T (8/14); total (124/147) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
GGAGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT > CP009273/3258722‑3259020 | aGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACACTCACGTTATCGACATCATAGAGAt > 2:3253641/1‑150 (MQ=255) gTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATc < 1:414689/150‑1 (MQ=255) tGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCt > 1:1303658/1‑150 (MQ=255) tGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCt > 2:1392272/1‑150 (MQ=255) tGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCt < 2:3775509/150‑1 (MQ=255) gAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTc > 1:908789/1‑150 (MQ=255) agCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAAt < 1:2793778/150‑1 (MQ=255) ccgccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAAttt < 1:1261136/150‑1 (MQ=255) cgccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTc > 1:2974969/1‑150 (MQ=255) ccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCa < 1:2594532/150‑1 (MQ=255) ccGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCa < 1:4318119/150‑1 (MQ=255) cGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCaa > 1:2010495/1‑150 (MQ=255) gTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAAt < 1:3823929/150‑1 (MQ=255) gAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCg > 2:3457628/1‑150 (MQ=255) gAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCg > 1:1054787/1‑150 (MQ=255) gTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTcc < 2:1565969/150‑1 (MQ=255) gTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTcc > 2:3258439/1‑150 (MQ=255) ttttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTccc < 2:3139371/150‑1 (MQ=255) tttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCt < 2:1950402/150‑1 (MQ=255) tttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCt < 1:1935736/150‑1 (MQ=255) tttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCt < 2:2582003/150‑1 (MQ=255) ttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTg < 1:42049/150‑1 (MQ=255) cAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGc > 1:4494575/1‑150 (MQ=255) aGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATCATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGcc < 1:3671481/150‑1 (MQ=255) gACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCa < 1:1757793/150‑1 (MQ=255) aCTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAg > 1:3653051/1‑150 (MQ=255) tACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAAt > 2:2988954/1‑150 (MQ=255) ccAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACt < 2:3246106/150‑1 (MQ=255) ccAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACt < 1:3134742/150‑1 (MQ=255) aTAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTc < 1:2868892/150‑1 (MQ=255) tAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCg > 1:3090457/1‑150 (MQ=255) tAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCg > 1:584269/1‑150 (MQ=255) cacTAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGat > 2:2770419/1‑150 (MQ=255) cacGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGat < 2:3942129/150‑1 (MQ=255) cacGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGat > 1:2139147/1‑150 (MQ=255) cacGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGat > 2:17651/1‑150 (MQ=255) gAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatcat < 1:3417822/150‑1 (MQ=255) gAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatcat > 2:4619124/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGt > 2:4591275/1‑150 (MQ=255) ggTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTa < 2:4308878/150‑1 (MQ=255) tCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAg < 1:4628997/150‑1 (MQ=255) tCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAg < 2:1466338/150‑1 (MQ=255) tCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAg > 1:4574793/1‑150 (MQ=255) ggTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTg < 1:2914143/150‑1 (MQ=255) ggTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTg > 2:3364051/1‑150 (MQ=255) tAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGa < 1:3935536/150‑1 (MQ=255) tAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGa < 2:2886412/150‑1 (MQ=255) aaTAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAt > 1:1099142/1‑150 (MQ=255) aaTAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAt > 1:2150688/1‑150 (MQ=255) aaTAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAt > 2:2633668/1‑150 (MQ=255) tAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATaa > 1:3056772/1‑150 (MQ=255) gATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATaaaa < 1:3524433/150‑1 (MQ=255) gATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATaaaa > 1:3850816/1‑150 (MQ=255) aTTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATaaaaa > 2:650162/1‑150 (MQ=255) aTTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATAAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCAATAATTTACAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGAAAGTTGGGATaaaaa > 2:2633271/1‑150 (MQ=255) tttAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAt < 2:2732600/150‑1 (MQ=255) tttAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAt < 1:1495106/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACg < 1:4374649/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACg < 2:2179376/150‑1 (MQ=255) aTTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACgg > 2:1371623/1‑150 (MQ=255) ccACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCtt < 2:352525/150‑1 (MQ=255) aCCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTcc > 1:2676435/1‑150 (MQ=255) ccGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCa > 2:882926/1‑150 (MQ=255) ccGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCa < 2:1864362/150‑1 (MQ=255) cAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCAttt > 1:1810223/1‑150 (MQ=255) aaTACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTc < 1:4114812/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGAc > 2:4269602/1‑150 (MQ=255) cAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAttt < 2:2436659/150‑1 (MQ=255) cAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAttt < 1:2305595/150‑1 (MQ=255) aaTTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTc > 2:4476247/1‑150 (MQ=255) aTTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCg < 2:2966648/150‑1 (MQ=255) tAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCt < 1:1721625/150‑1 (MQ=255) ccGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCTCTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACt < 1:519797/150‑1 (MQ=255) ccGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACt < 1:2471112/150‑1 (MQ=255) cGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACtt < 2:732416/150‑1 (MQ=255) cGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCAGTTCGACAATTTCGCTCACtt > 2:333035/1‑150 (MQ=255) gCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACttt > 1:3147393/1‑150 (MQ=255) ccaccaccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTa > 1:4584088/1‑150 (MQ=255) ccaccaccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTa > 1:2264930/1‑150 (MQ=255) caccaccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTTGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTACGACAATTTCGCTCACTTTAg > 2:1988757/1‑150 (MQ=255) caccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGa > 1:3543423/1‑150 (MQ=255) accaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGAt > 2:4164609/1‑150 (MQ=255) accaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGAt > 2:283264/1‑150 (MQ=255) accaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGAt > 2:539957/1‑150 (MQ=255) caATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAg < 1:2005744/150‑1 (MQ=255) aaTTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAgt < 1:4316248/150‑1 (MQ=255) tGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTc < 1:669165/150‑1 (MQ=255) cacaATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGtt < 1:4438583/150‑1 (MQ=255) acaATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTg < 1:1889657/150‑1 (MQ=255) acaATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTg < 1:377658/150‑1 (MQ=255) aaTCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGaa > 1:4072023/1‑150 (MQ=255) aTCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAg > 1:2356663/1‑150 (MQ=255) aCGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTa > 2:2326653/1‑150 (MQ=255) cggtATCGACATCATATAGATCTTCCATAATTTCCAGTCCAATCGGTCACTGGCCTGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTAt < 2:1936121/147‑1 (MQ=255) aTCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCAcc > 2:3472645/1‑150 (MQ=255) aTCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCAcc > 2:3015504/1‑150 (MQ=255) cGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCAt < 1:4114271/150‑1 (MQ=255) tAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACg > 2:1202188/1‑150 (MQ=255) agaTCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTTGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGagt > 2:2082509/1‑148 (MQ=255) gaTCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACtt > 2:4173736/1‑150 (MQ=255) | GGAGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT > CP009273/3258722‑3259020 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |