| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,360,045 | G→T | 33.1% | F11L (TTC→TTA) | insH1 ← | IS5 transposase and trans‑activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,360,045 | 0 | G | T | 33.1% | 217.5 / 112.3 | 127 | F11L (TTC→TTA) | insH1 | IS5 transposase and trans‑activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/51); new base T (17/25); total (51/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCA > CP009273/3359966‑3360193 | aCAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTa < 2:855617/150‑1 (MQ=11) cAAGAAAATCTCTTTTCTTGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTAGTCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTAc < 2:2303289/150‑1 (MQ=9) aaGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACt < 1:2684742/150‑1 (MQ=32) aaGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACt > 1:2574082/1‑150 (MQ=32) aaGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGACTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACt < 1:3457441/150‑1 (MQ=17) aGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACtt > 2:3468791/1‑150 (MQ=17) aaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTccc < 1:3601209/150‑1 (MQ=35) aTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTccccc < 1:1179442/150‑1 (MQ=37) aTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTccccc < 2:4117010/150‑1 (MQ=37) tctcTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCTGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCATGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCa > 2:195615/1‑150 (MQ=255) tctcTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCa > 1:3748374/1‑150 (MQ=38) tctcTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCa < 1:4518137/150‑1 (MQ=38) tctcTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCa > 2:1156351/1‑150 (MQ=38) tctcTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCa < 1:2710332/150‑1 (MQ=38) tctcTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCa < 1:399600/150‑1 (MQ=38) ctTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCaata > 1:4298048/1‑150 (MQ=40) tttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCTGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCaataat > 2:1752536/1‑150 (MQ=255) tttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCaataat > 2:1485533/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTg < 2:3098140/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTg < 1:1987516/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTg < 1:1288475/150‑1 (MQ=255) ggTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCt < 1:1249636/150‑1 (MQ=255) ggTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCt < 1:4466976/150‑1 (MQ=255) ggTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCt < 1:3228549/150‑1 (MQ=255) gTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTg < 1:894297/150‑1 (MQ=255) tCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTgg < 1:3280954/150‑1 (MQ=255) tCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTgg > 2:2067985/1‑150 (MQ=255) tCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTgg < 1:835039/150‑1 (MQ=255) tCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTgg < 1:835050/150‑1 (MQ=255) tCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTgg > 1:2430637/1‑150 (MQ=255) cTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGgt > 1:784925/1‑150 (MQ=255) cTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGgt < 1:3337164/150‑1 (MQ=255) cTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGgt > 1:2342245/1‑150 (MQ=255) aCGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGtt > 1:2997423/1‑150 (MQ=255) aCGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGtt > 1:2997299/1‑150 (MQ=255) ggCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTa < 2:2080515/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTa < 2:645189/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGtttt < 2:340872/150‑2 (MQ=255) ggCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTa < 2:544384/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCGTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTa < 2:1945292/150‑1 (MQ=255) gcgcTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCTGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTAt < 2:3732995/150‑1 (MQ=255) gcgcTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTAt < 1:3913889/150‑1 (MQ=255) gcTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGc < 1:2920497/150‑1 (MQ=255) gcTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGc < 1:297928/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCaaaa > 2:751951/1‑150 (MQ=255) ctgctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAAt > 2:1478331/1‑150 (MQ=255) tgctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATg < 2:1539825/150‑1 (MQ=255) tgctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTAGGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATg < 2:3629300/150‑1 (MQ=255) ctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGt > 1:2365414/1‑150 (MQ=255) ctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGt > 1:316221/1‑150 (MQ=255) tgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTc > 1:3354805/1‑150 (MQ=255) tgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTc > 2:2258300/1‑150 (MQ=255) aaTTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaa > 1:2703434/1‑150 (MQ=255) aTTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaag < 1:4391285/150‑1 (MQ=255) ttCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaaga > 1:1553152/1‑150 (MQ=255) ttCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaaga > 2:1196336/1‑150 (MQ=255) tCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaagaa < 1:98723/150‑1 (MQ=255) tGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTgg < 2:3185239/150‑1 (MQ=255) tCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTa < 1:297593/150‑1 (MQ=255) tCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTa < 1:2989702/150‑1 (MQ=255) tCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTa < 1:3401165/150‑1 (MQ=255) cGGCGAAGGTAAGTGGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTaa < 2:2609755/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAAt > 1:209934/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAAt > 1:1042904/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAAt > 1:1042864/1‑150 (MQ=255) gCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAAtt < 2:4003640/150‑1 (MQ=255) gCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAAtt < 1:3729718/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTg < 1:1752217/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTg < 1:1911196/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTg < 1:3606899/150‑1 (MQ=255) gAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGa < 2:1311188/150‑1 (MQ=255) ggTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAg < 1:741946/150‑1 (MQ=255) gTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGc > 1:1812605/1‑150 (MQ=255) aaGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCgg > 2:1364952/1‑150 (MQ=255) aGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGt > 1:3549778/1‑150 (MQ=255) aGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGt > 1:4377002/1‑150 (MQ=255) aGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGt < 2:2399050/150‑1 (MQ=255) aGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGt > 1:2158970/1‑150 (MQ=255) aGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGt < 2:2399356/150‑1 (MQ=255) aGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGt > 2:1579068/1‑150 (MQ=255) ttGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTaa > 2:464385/1‑150 (MQ=255) gatgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTaaaa < 2:1585222/150‑1 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAg > 2:2296326/1‑150 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAg > 2:1191181/1‑150 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAg > 2:4352998/1‑150 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAg > 1:730441/1‑150 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAg > 2:2296306/1‑150 (MQ=255) tgaCTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGc > 1:661759/1‑150 (MQ=255) tgaCTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGc < 2:4123244/150‑1 (MQ=255) gaCTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCg > 2:1346223/1‑150 (MQ=255) cTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGtt > 1:3199404/1‑150 (MQ=255) cTCATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGtt < 1:52121/150‑1 (MQ=255) cTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGtt < 1:3364870/150‑1 (MQ=255) cTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGtt < 2:1344067/150‑1 (MQ=255) cATGATTAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAACCATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAg < 1:2298647/150‑1 (MQ=255) atgattAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGc > 1:1098502/1‑150 (MQ=255) atgattAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGc > 1:1098324/1‑150 (MQ=255) tgatgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGcc > 1:573313/1‑150 (MQ=255) tgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTca > 2:1171700/1‑150 (MQ=255) tgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTca > 2:2123539/1‑150 (MQ=255) | ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCA > CP009273/3359966‑3360193 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |