| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,368,168 | C→T | 19.3% | intergenic (‑320/‑60) | nanR ← / → dcuD | transcriptional repressor of the nan operon, induced by sialic acid/putative transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,368,168 | 0 | C | T | 19.3% | 622.1 / 125.0 | 248 | intergenic (‑320/‑60) | nanR/dcuD | transcriptional repressor of the nan operon, induced by sialic acid/putative transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (111/89); new base T (31/17); total (142/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TTATAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTGCTGGCTGCC > CP009273/3368020‑3368317 | ttatAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCg < 1:1554507/150‑1 (MQ=255) gACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTAACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGttt > 1:1059334/1‑150 (MQ=255) gACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTAACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGttt > 1:2798478/1‑150 (MQ=255) tATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCa < 2:3027359/150‑1 (MQ=255) tCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATc > 2:948642/1‑150 (MQ=255) aCGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTg < 1:1627006/150‑1 (MQ=255) cGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGc > 1:4411836/1‑150 (MQ=255) cGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGc > 2:3826222/1‑150 (MQ=255) aGCATTATGAATATAATGAATGTGTACATCCAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACATACCATTAAAAAAACTACATACGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAAAATAAAAACGTTGTATTCAATCTggag > 2:4564223/1‑147 (MQ=255) gCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGt < 1:3090083/150‑1 (MQ=255) gCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGt < 1:2872919/150‑1 (MQ=255) tatgaatattatgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTAt < 2:4528152/150‑1 (MQ=255) atgaatattatgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATg < 1:3683699/150‑1 (MQ=255) tgaatattatgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATgg < 1:4576819/150‑1 (MQ=255) attatgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTg > 1:2595215/1‑150 (MQ=255) attatgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTg < 2:1595568/150‑1 (MQ=255) ttatgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGa > 1:1234628/1‑150 (MQ=255) atgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGAGCATATTTTTTAATGAAAAATAACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATCTAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGAcc > 2:821951/1‑150 (MQ=255) tgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCg > 1:2180052/1‑150 (MQ=255) tgaatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCg < 2:723454/150‑1 (MQ=255) aatGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGtt < 1:2032957/150‑1 (MQ=255) atGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGttt > 1:383706/1‑150 (MQ=255) gtgtTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTc > 2:502107/1‑150 (MQ=255) gtgtTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTc < 1:477951/150‑1 (MQ=255) gtgtTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTc > 1:809284/1‑150 (MQ=255) ttCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCttt < 1:2817687/150‑1 (MQ=255) tCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCtttt > 2:1436776/1‑150 (MQ=255) cTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTg > 1:3071612/1‑150 (MQ=255) tACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGac > 2:3997485/1‑150 (MQ=255) aCAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGaca > 2:228438/1‑150 (MQ=255) aCAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGaca > 2:1486349/1‑150 (MQ=255) aaaTAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACgg > 2:2026534/1‑150 (MQ=255) aaaTAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACgg > 2:626112/1‑150 (MQ=255) ataatcataatcGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAg < 2:3788339/150‑1 (MQ=255) aatCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGtt > 1:4269280/1‑150 (MQ=255) tAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTcaaca > 2:2463709/1‑150 (MQ=255) tAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTcaaca > 2:2828120/1‑150 (MQ=255) aaGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTcaacaa > 1:75530/1‑150 (MQ=255) cgcgcATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAAt > 2:3297129/2‑150 (MQ=255) aGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAAt > 2:1154892/1‑150 (MQ=255) gcgcATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATg < 1:3180918/150‑1 (MQ=255) cgcATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGt > 1:2023309/1‑150 (MQ=255) cgcATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTGTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGt > 2:4620574/1‑150 (MQ=255) cATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTc > 2:1368315/1‑150 (MQ=255) cATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTc > 2:1368230/1‑150 (MQ=255) atatTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCg < 1:1330211/150‑1 (MQ=255) atTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGc < 1:2263922/150‑1 (MQ=255) ttAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGGTTATGGGATTGACCGTATTCTTTTGACACGGAGGTCAACAATGTTCGTCATAAt > 1:2016132/1‑150 (MQ=255) tAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAAtt > 2:3150974/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATtat < 2:3845661/150‑1 (MQ=255) aTGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATtat > 2:3139365/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATtata < 1:1032907/150‑1 (MQ=255) gAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTatat > 2:4442736/1‑150 (MQ=255) aaaaTCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCt > 1:4072587/1‑150 (MQ=255) aaaTCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTg > 2:3361300/1‑150 (MQ=255) aaTCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGt > 1:844661/1‑150 (MQ=255) aTCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTc > 2:1772275/1‑150 (MQ=255) tcacctcaccTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCa < 1:1775620/150‑1 (MQ=255) cacctcacctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCAt > 2:612959/1‑150 (MQ=255) cacctcacctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCAt < 2:3637975/150‑1 (MQ=255) ctcacctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAAAGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGt > 2:540683/1‑150 (MQ=255) tcacctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTa > 2:683985/1‑150 (MQ=255) tcacctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTa > 2:108725/1‑150 (MQ=255) cctACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTatta > 1:577142/1‑150 (MQ=255) tACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTattaat < 1:955647/150‑1 (MQ=255) tACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTattaat > 1:1138682/1‑150 (MQ=255) tACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCATTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTattaat < 1:3674108/150‑1 (MQ=255) tACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCATTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTattaat < 1:3404960/150‑1 (MQ=255) cAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTattaatta > 2:4238997/1‑150 (MQ=255) aaTTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTAc > 2:95189/1‑150 (MQ=255) aaaaCACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATgg < 1:4259975/150‑1 (MQ=255) aaaCACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATggg < 1:3900806/150‑1 (MQ=255) aaaCACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATggg > 2:1293745/1‑150 (MQ=255) acacGACCTCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCt < 2:2373465/150‑1 (MQ=255) cacGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTa > 1:1955820/1‑150 (MQ=255) cacGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTa > 1:2331954/1‑150 (MQ=255) gACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTAttt < 1:886480/150‑1 (MQ=255) aTCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGAt > 1:4197940/1‑150 (MQ=255) tCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATc < 1:2835361/150‑1 (MQ=255) ccGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATACCTTCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATcc < 1:4541881/150‑1 (MQ=255) aCCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGaa > 1:3244289/1‑150 (MQ=255) ccATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGaaa < 2:172924/150‑1 (MQ=255) aTAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGaaaaa > 1:732750/1‑150 (MQ=255) aTAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGaaaaa > 1:698121/1‑150 (MQ=255) aaaTAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACt > 1:2985877/1‑150 (MQ=255) gCCTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACaaa < 1:3560805/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGGCCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACaaa < 1:2073872/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACaaa < 2:4051409/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAAAAAATATAACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAAc > 2:208136/1‑150 (MQ=255) ccTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAAc < 1:200085/150‑1 (MQ=255) cTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAAcc > 1:3226898/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCt < 2:1942581/150‑1 (MQ=255) gCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAATACTACAAACCTCa > 2:3206433/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCa < 1:4456839/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAggt < 1:4510232/150‑1 (MQ=255) aaTATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAggtggt < 2:3633062/150‑1 (MQ=255) aaTATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAggtggt < 2:1709839/150‑1 (MQ=255) ataACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTgct < 2:3757923/150‑1 (MQ=255) taACATTGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTgctg < 1:3124439/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTgctggctg > 1:3772789/1‑150 (MQ=255) | TTATAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTGCTGGCTGCC > CP009273/3368020‑3368317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |