| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,377,958 | G→T | 10.0% | intergenic (‑331/‑104) | mdh ← / → argR | malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding/l‑arginine‑responsive arginine metabolism regulon transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,377,958 | 0 | G | T | 10.0% | 950.1 / 53.8 | 260 | intergenic (‑331/‑104) | mdh/argR | malate dehydrogenase, NAD(P)‑binding/l‑arginine‑responsive arginine metabolism regulon transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (124/110); new base T (13/13); total (137/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 | |||||||||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
ATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGTTAAAGCATTTAAAG > CP009273/3377809‑3378107 | aTTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCg > 1:985114/1‑150 (MQ=255) ttAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGc > 1:1838576/1‑150 (MQ=255) aGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGctc < 1:4271174/150‑1 (MQ=255) gcgcAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCctctct < 2:4517682/150‑1 (MQ=255) gcgcAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGctct < 1:4004167/150‑1 (MQ=255) aaCATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCa > 1:1620409/1‑150 (MQ=255) cATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATa < 2:3826993/150‑1 (MQ=255) cATTCCAACAGGTGGTGACAATATACACTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATa > 2:2340837/1‑150 (MQ=255) aTTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATaa > 2:1653386/1‑150 (MQ=255) aCAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACattat < 2:4390674/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACattatt > 1:2423832/1‑150 (MQ=255) gtggtgACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCa < 1:4131288/150‑1 (MQ=255) gtggtgACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCa < 1:844696/150‑1 (MQ=255) tggtgACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAg < 1:3916656/150‑1 (MQ=255) tggtgACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAg > 1:1931464/1‑150 (MQ=255) tggtgACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAg < 2:1780567/150‑1 (MQ=255) ggtgACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGc > 2:2948915/1‑150 (MQ=255) gtgACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTGTCATAACATTATTTCAGcc > 2:730724/1‑150 (MQ=255) gACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCctt > 1:3615972/1‑150 (MQ=255) aCAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCcttc < 1:2668413/150‑1 (MQ=255) cAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCcttct < 2:3225035/150‑1 (MQ=255) aaTATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCcttctt < 1:1131523/150‑1 (MQ=255) atatACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCttcttc < 1:324924/150‑1 (MQ=255) atatACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCttcttc > 1:4241365/1‑150 (MQ=255) taCCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAgg < 1:1386827/150‑1 (MQ=255) taCCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAgg > 1:4544375/1‑150 (MQ=255) taCCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAgg > 1:1696913/1‑150 (MQ=255) aCCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAggg < 2:966932/150‑1 (MQ=255) aCCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAggg < 1:2209310/150‑1 (MQ=255) ccgaCCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCt < 1:1644881/147‑1 (MQ=255) tACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGa > 1:3652745/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGt > 2:3938458/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGt > 1:749385/1‑150 (MQ=255) ttCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGtt < 2:4184468/150‑1 (MQ=255) cAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTg > 2:1362400/1‑150 (MQ=255) aGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGc > 2:201516/1‑150 (MQ=255) gCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCa > 2:2113888/1‑150 (MQ=255) gCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCa < 1:1000258/150‑1 (MQ=255) ccAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAGTTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCAt > 2:218387/1‑150 (MQ=255) cAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATa < 1:2705859/150‑1 (MQ=255) aaaaCAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATaa < 1:1302830/150‑1 (MQ=255) aaaCAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATaaa > 2:3783845/1‑150 (MQ=255) aacaacATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATaaaa > 2:3313734/1‑150 (MQ=255) acaTCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTc < 1:1290399/150‑1 (MQ=255) acaTCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTc > 2:1400325/1‑150 (MQ=255) aTCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCAt < 1:3696908/150‑1 (MQ=255) tCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATc < 1:3085611/150‑1 (MQ=255) cAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCt < 1:2049463/150‑1 (MQ=255) aaTTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCAAGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTg > 1:4082886/1‑150 (MQ=255) ttGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTAt < 2:3034795/150‑1 (MQ=255) ttGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTAt < 2:3003027/150‑1 (MQ=255) tGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATg < 2:325110/150‑1 (MQ=255) gATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGc > 2:746980/1‑150 (MQ=255) gATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGc > 1:1580698/1‑150 (MQ=255) aattaattTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACaata > 2:3294154/1‑150 (MQ=255) aattaattTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACaata < 2:2753693/150‑1 (MQ=255) attaattTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACaataa > 1:2613279/1‑150 (MQ=255) ttaattTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACaataat < 2:2242299/150‑1 (MQ=255) taattTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAAtg > 2:530545/1‑150 (MQ=255) attTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAAtgtt < 1:2838089/150‑1 (MQ=255) agttACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACACTAAtgtt > 1:3962437/3‑150 (MQ=255) tttAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCaa > 1:2185552/1‑150 (MQ=255) tAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAacc > 2:1716560/1‑150 (MQ=255) aGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAaccac > 2:2154187/1‑150 (MQ=255) cAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAAccacca < 1:650772/150‑1 (MQ=255) aGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCat > 1:528243/1‑150 (MQ=255) aGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATAATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCat < 1:912902/150‑1 (MQ=255) aaTTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCatat > 2:1142680/1‑150 (MQ=255) aTTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATc < 2:2927505/150‑1 (MQ=255) tGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCggg > 1:528629/1‑150 (MQ=255) tGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCggg > 1:2556951/1‑150 (MQ=255) gCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGt < 1:276534/150‑1 (MQ=255) cATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTg < 2:4331964/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGa > 1:4159166/1‑150 (MQ=255) gTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTAt > 1:2497593/1‑150 (MQ=255) gTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTAt < 1:1135600/150‑1 (MQ=255) gTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTAt < 1:4428110/150‑1 (MQ=255) gACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGc > 1:3753821/1‑150 (MQ=255) gCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGaa > 2:2419348/1‑150 (MQ=255) gCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCTCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGaa < 2:2669701/150‑1 (MQ=255) gCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGaa > 1:2785442/1‑150 (MQ=255) gCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTc < 2:2480060/150‑1 (MQ=255) gTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCt < 1:2394594/150‑1 (MQ=255) ttCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTaa < 1:1051781/150‑1 (MQ=255) tctcAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAg < 2:4570091/150‑1 (MQ=255) tctcAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCANATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAg < 1:4279866/150‑1 (MQ=255) tcAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCa < 2:1349582/150‑1 (MQ=255) tcAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCa < 1:2877021/150‑1 (MQ=255) cAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCaa < 2:3443037/150‑1 (MQ=255) cAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCaa > 2:1810806/1‑150 (MQ=255) aaTAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCaag < 2:3683910/150‑1 (MQ=255) tAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCaagaa < 2:4591547/150‑1 (MQ=255) aCGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAagaaga < 1:4177445/150‑1 (MQ=255) cGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAgaagaa > 2:3564018/1‑150 (MQ=255) cGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAgaagaa > 2:1245054/1‑150 (MQ=255) aaaTTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACt < 1:3312500/150‑1 (MQ=255) gATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGttaa > 1:615801/1‑150 (MQ=255) aaaTCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGttaaagca > 2:4037427/1‑150 (MQ=255) aaTCCCGCTCTTACATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTTCATAAAAATTCATCTGTATGCAAAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGttaaagcat > 1:30342/1‑150 (MQ=255) aTCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGttaaagcatt > 1:2985245/1‑150 (MQ=255) | ATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGATAACAATTAATTTACTTTTAAGCAGAATTTGCATGCCGTGACGCAGGCATGTTTCTCAATAACGAAATTTGATAAAATCCCGCTCTTTCATAACATTATTTCAGCCTTCTTCAGGGCTGACTGTTTGCATAAAAATTCATCTGTATGCACAATAATGTTGTATCAACCACCATATCGGGTGACTTATGCGAAGCTCGGCTAAGCAAGAAGAACTAGTTAAAGCATTTAAAG > CP009273/3377809‑3378107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |