| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,415,551 | C→A | 6.2% | P290T (CCT→ACT) | yhdY → | putative amino‑acid transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,415,551 | 0 | C | A | 6.2% | 915.9 / 11.1 | 263 | P290T (CCT→ACT) | yhdY | putative amino‑acid transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (100/137); new base A (18/7); total (119/144) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.54e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TGTTTCAGTCAGCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATGTTTTCGCCGC > CP009273/3415402‑3415699 | gTTTCAGTCAGCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTcc < 2:4433066/150‑1 (MQ=255) tttCAGTCAGCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCt < 2:4551933/150‑1 (MQ=255) tcagtcagCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTgg < 1:3603423/150‑1 (MQ=255) tcagtcagCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCGGGTTATTCTTCCACAGGCGTTGTAGCTGGTAATTCCTgg > 1:1291288/1‑150 (MQ=255) tcagtcagCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTAAGGGGCTGGTTATTATGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTgg > 1:517104/1‑150 (MQ=255) cagtcagCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGGTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAAATCCTggg > 2:4373222/1‑150 (MQ=255) gtcagCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAATCTGGTAATTACTGGGCt > 2:1818459/1‑150 (MQ=255) tcagCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTg > 2:2259727/1‑150 (MQ=255) gCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTa < 1:4465659/150‑1 (MQ=255) gCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTAATGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCCGGGCTGGTa > 1:2498880/1‑150 (MQ=255) cATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTaa > 1:962277/1‑150 (MQ=255) tatGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAAt > 1:4063074/1‑150 (MQ=255) tGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATAc < 2:1379345/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAAATCAGGGGCTGGTTATTATGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATAcc > 1:2898163/1‑150 (MQ=255) tGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACcat > 1:4146335/1‑150 (MQ=255) tGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACACAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATAAcat > 1:894205/1‑150 (MQ=255) gCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACcatc < 2:3418121/150‑1 (MQ=255) cGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGGTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACcatca > 2:3938962/1‑150 (MQ=255) ggAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGTAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACcatcat > 2:253698/1‑150 (MQ=255) ggAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACcatcat > 2:500855/1‑150 (MQ=255) gAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGGGGTGGGTTACTGGTAAACTCCGGGGCTGGTTATTCTGGCACAGGCGGTGAAGCTGGGGAATGCGGGGCTGGTGAATACcatgcgg > 1:3146431/1‑146 (MQ=255) aGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGTAAAACTCAGGGGCTGGGTATTCTGCCACAGGCGGTGAAGCTTGTAATTCCTGGGCAGGTAAATACCATCATCGc > 2:4045097/1‑150 (MQ=255) gTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCActc > 1:3007808/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTTGGTTACGGGAAAAAACAGGGGCTGGTTATTCAGCCACACGCGTTGAAACTGGTAATTCCTTGGCTGGTAAAAACCAAAATCGCAcact > 1:1606684/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCActct < 1:696012/150‑1 (MQ=255) tGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCActct > 1:1027830/1‑150 (MQ=255) cGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTc < 1:641465/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTc < 1:94869/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTc < 1:4216132/150‑1 (MQ=255) aGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTGTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACGCTTCaa > 1:1495113/1‑150 (MQ=255) aGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCaa < 2:4208074/150‑1 (MQ=255) ggTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGGTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCaaa > 1:3466034/1‑150 (MQ=255) tGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGa > 2:2110003/1‑150 (MQ=255) tGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCGGGGCTGGTAAATAACATCATCGCACGCGTCCAAGa > 1:825324/1‑150 (MQ=255) gATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATa > 2:849842/1‑150 (MQ=255) gATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGGTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATa > 2:931643/1‑150 (MQ=255) aTTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTTGGTTACAGGAAAAATCAGGGGCTGGTTATTCTTCCACAGGCGTTTAAGCATGTAATTACTGGGATGGTAAATACCATCCACGCACACATCAAAAATAc > 1:4098526/1‑150 (MQ=255) aTTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATAc > 2:3588133/1‑150 (MQ=255) ttACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACGGGAAAAATCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACACGCGGTGAAGCAGGTAAATCCGGGGCTGGGAAATACCATCAAACCACACTAAAAAGATAcc > 1:1401213/1‑150 (MQ=255) ttACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGGTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATAcc > 2:3687921/1‑150 (MQ=255) tACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCa < 1:2213581/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGcc > 2:2289001/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCt < 2:1443772/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTgg > 2:219526/1‑150 (MQ=255) cTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTg < 2:16480/150‑1 (MQ=255) tGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGTGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGa < 2:3241800/150‑1 (MQ=255) tGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGa < 1:4599761/150‑1 (MQ=255) cTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCa > 2:648451/1‑150 (MQ=255) cTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCa < 1:4003258/150‑1 (MQ=255) aaaGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAtt > 1:2791417/1‑150 (MQ=255) gggCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATc < 1:3639264/150‑1 (MQ=255) ggCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCg < 1:2084455/150‑1 (MQ=255) atatGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGgtt < 2:3968106/150‑1 (MQ=255) atatGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGgtt > 2:2495508/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGGTGGGTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCg > 1:4497384/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCg > 2:4613784/1‑150 (MQ=255) aGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGa < 1:3333082/150‑1 (MQ=255) cGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATc < 2:3768518/150‑1 (MQ=255) ggCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCATCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCt > 2:1041319/1‑150 (MQ=255) gCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCtt < 2:3831074/150‑1 (MQ=255) agagTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCtttt < 1:1127485/150‑1 (MQ=255) gagTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTc < 2:3014473/150‑1 (MQ=255) agTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCa > 1:438033/1‑150 (MQ=255) 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tACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCa > 1:310763/1‑150 (MQ=255) aCTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCaa > 1:2385052/1‑150 (MQ=255) tGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAAcc < 1:3687566/150‑1 (MQ=255) tGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAAcc < 1:2647165/150‑1 (MQ=255) gAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGt < 1:2182051/150‑1 (MQ=255) cTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATc < 2:2720669/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCt < 2:241719/150‑1 (MQ=255) cTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTgg < 2:4313435/150‑1 (MQ=255) tCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTAt < 1:3981289/150‑1 (MQ=255) tCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTAt < 1:1335724/150‑1 (MQ=255) cTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATg < 1:2433222/150‑1 (MQ=255) cTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATg > 2:4348531/1‑150 (MQ=255) cTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATg > 1:18818/1‑150 (MQ=255) cacaGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGa > 2:3065108/1‑150 (MQ=255) cacaGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGa < 1:3908604/150‑1 (MQ=255) caGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACg > 1:480770/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGa < 1:736211/150‑1 (MQ=255) cGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTCTGTCGACGGAAg > 1:2846546/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAgg > 1:3518351/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAgg < 1:2681692/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGt < 2:1179254/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATg > 1:3372927/1‑150 (MQ=255) tGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATGttt < 1:2064443/150‑1 (MQ=255) tGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATGttt < 2:1570663/150‑1 (MQ=255) tGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATGttt < 2:1991018/150‑1 (MQ=255) ggTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATGtttt > 1:3168424/1‑150 (MQ=255) aaTTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATGTTTTcgc > 2:3787904/1‑150 (MQ=255) | TGTTTCAGTCAGCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATGTTTTCGCCGC > CP009273/3415402‑3415699 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |