| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,448,742 | C→A | 8.2% | E6* (GAA→TAA) | gspA ← | general secretory pathway component, cryptic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,448,742 | 0 | C | A | 8.2% | 938.4 / 37.4 | 250 | E6* (GAA→TAA) | gspA | general secretory pathway component, cryptic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (105/124); new base A (11/10); total (116/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
AAACAACGAGGCTTAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAA > CP009273/3448595‑3448891 | aaaCAACGAGGCTTAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAActtatc > 2:3769007/1‑150 (MQ=255)aaaCAACGAGGCTTAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCACACACAACCAGGAAAGAATAActtctc < 1:898082/150‑1 (MQ=255) aacaacGAGGCTTAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAActtctct < 2:4477336/150‑1 (MQ=255) aacGAGGCTTAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAActtctcttct > 2:1313161/1‑150 (MQ=255) cGAGGCTTAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCg > 2:2839839/1‑150 (MQ=255) gAGGCTTAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGt > 1:467445/1‑150 (MQ=255) ttAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACa < 2:3548767/150‑1 (MQ=255) aaaGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATa > 1:3815480/1‑150 (MQ=255) aaaGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATa < 2:518354/150‑1 (MQ=255) gTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGATGCGCCAGCCAGGTTTTACCACTTCAATCCTCACCCAACAAATAGCATAGAAGCCAGGTTTGAAGATTCTCACAAAACCAGGAAAGAATAACTTCTATTCTCGTAGAAATAGaa > 2:3304641/1‑150 (MQ=255) tCACACGGCGATGTTTATATTTTTGAAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTc < 2:1764698/150‑1 (MQ=255) cacaCGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTcc < 2:2151268/150‑1 (MQ=255) cacGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTg < 1:148579/150‑1 (MQ=255) cacGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTg < 1:148495/150‑1 (MQ=255) cacGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTg < 2:3507194/150‑1 (MQ=255) acGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGt < 2:4313244/150‑1 (MQ=255) acGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGt > 2:2061300/1‑150 (MQ=255) cGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGtt > 2:259461/1‑150 (MQ=255) cGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTATCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGtt < 2:2652329/150‑1 (MQ=255) cGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTa < 1:2277891/150‑1 (MQ=255) gATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTaa > 2:1894798/1‑150 (MQ=255) aTGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAat < 1:4323164/150‑1 (MQ=255) gTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAatta < 2:3285269/150‑1 (MQ=255) ttATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAattatt < 2:4618401/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGAt < 1:1335545/150‑1 (MQ=255) cTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGAtt > 1:2352146/1‑150 (MQ=255) cTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGAtt > 1:639103/1‑150 (MQ=255) cTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTAACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGAtt > 1:816370/1‑150 (MQ=255) tttttGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTa < 2:1684044/150‑1 (MQ=255) ttttGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTAt < 2:302149/150‑1 (MQ=255) tGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTATCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCt > 1:231206/1‑150 (MQ=255) tGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCAAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACTTTTCTCACACAACCAGTAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCt < 1:30014/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCt < 1:1543969/150‑1 (MQ=255) gCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCtt < 1:4368290/150‑1 (MQ=255) aGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTaa > 1:2781267/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAAt < 2:2378250/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAAt > 2:797978/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAAt < 1:1081063/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATc < 1:4102466/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATc > 1:968506/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCa < 2:4035545/150‑1 (MQ=255) gctgcGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCAt < 1:1004829/150‑1 (MQ=255) gctgcGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCAt < 2:3956825/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATaaaa > 1:2673730/1‑150 (MQ=255) agccagGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAaataa > 2:427097/1‑150 (MQ=255) agccagGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAaataa > 2:3379732/1‑150 (MQ=255) agccagGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAaataa > 2:1061562/1‑150 (MQ=255) agccagGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAaataa > 1:234459/1‑150 (MQ=255) gccagGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAaataat < 1:1910195/150‑1 (MQ=255) ccagGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAatg > 2:498366/1‑150 (MQ=255) ccagGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAatg < 2:493728/150‑1 (MQ=255) cagGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCATGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAatgt > 1:318354/1‑150 (MQ=255) agGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAatgta > 1:1105238/1‑150 (MQ=255) agGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAatgta < 1:1612891/150‑1 (MQ=255) tttCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATgtatgtat < 2:1938969/150‑1 (MQ=255) ttCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtatt < 1:349273/150‑1 (MQ=255) ttCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtatt < 1:3378638/150‑1 (MQ=255) tCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtattt > 2:2535876/1‑150 (MQ=255) ccACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtattta < 2:3155799/150‑1 (MQ=255) cACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtatttat > 2:1508455/1‑150 (MQ=255) cACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtatttat > 1:1845593/1‑150 (MQ=255) aCTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtatttatt > 1:3724431/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTattaa < 1:391841/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTattaatt > 1:2822449/1‑150 (MQ=255) aGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTAttaattaa > 1:2390932/1‑150 (MQ=255) cTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATa > 2:171102/1‑150 (MQ=255) cccAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACata > 1:3299047/1‑150 (MQ=255) caacaaATACCATAGACGCCAGGATTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTACTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCATAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATAtt < 2:4152454/150‑1 (MQ=255) acaaATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTAc > 1:2582592/1‑150 (MQ=255) caaATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACt > 1:821847/1‑150 (MQ=255) caaATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACt < 2:212101/150‑1 (MQ=255) aTAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTATCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAat > 2:4431098/1‑150 (MQ=255) aGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAatat > 1:1150889/1‑150 (MQ=255) aGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATataaata > 2:2872419/1‑150 (MQ=255) aGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATataaata < 2:416241/150‑1 (MQ=255) gACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATataaataa < 1:4566839/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGTAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAAttt < 1:2085046/150‑1 (MQ=255) aGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTg > 2:939039/1‑150 (MQ=255) aGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTATCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTg < 1:4624783/150‑1 (MQ=255) gTTTGACGTTTCTCACACAACCAGTAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCt < 1:4230237/150‑1 (MQ=255) tttGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCtt < 2:596594/150‑1 (MQ=255) tttGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCtt < 1:1660975/150‑1 (MQ=255) aCGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGAtt > 1:141017/1‑150 (MQ=255) aCGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGAAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTAATGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAAGTTTGCTTGAtt > 1:1012481/1‑150 (MQ=255) gTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCa > 2:2211422/1‑150 (MQ=255) gTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCa < 1:2109337/150‑1 (MQ=255) tttCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCAt < 1:4202410/150‑1 (MQ=255) ctcACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCa < 1:253650/150‑1 (MQ=255) acacaACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGc < 1:2918531/150‑1 (MQ=255) cacaACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCg < 2:122865/150‑1 (MQ=255) cacaACCAGGAAAGAATAACTTATCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCg > 1:3383077/1‑150 (MQ=255) cacaACCAGGAAAGAATAACTTATCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCg > 1:3979880/1‑150 (MQ=255) caACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGc > 2:282492/1‑150 (MQ=255) ccAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTGCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCAtt < 2:207446/150‑1 (MQ=255) aGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTaa < 1:1240250/150‑1 (MQ=255) gAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATa > 1:3640057/1‑150 (MQ=255) aaGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACt > 2:629889/1‑150 (MQ=255) tAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTta < 2:464713/150‑1 (MQ=255) aCTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTtata > 2:2937146/1‑150 (MQ=255) tctcttctcGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTa > 2:1106374/1‑150 (MQ=255) | AAACAACGAGGCTTAAAGTAATCACACGGCGATGTTTATCTTTTTGCAGTTGCTGCGCCAGCCAGGTTTTTCCACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAA > CP009273/3448595‑3448891 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |