| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,607,110 | C→A | 6.0% | I28I (ATC→ATA) | nikA → | nickel‑binding, heme‑binding periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,607,110 | 0 | C | A | 6.0% | 1210.5 / 32.7 | 313 | I28I (ATC→ATA) | nikA | nickel‑binding, heme‑binding periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (167/127); new base A (13/6); total (180/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
GTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGTGGCTGGCAAAAAGCTGGACTCA > CP009273/3606962‑3607259 | tATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATcac > 1:2815970/1‑150 (MQ=255) aTGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATcacc > 2:1766746/1‑150 (MQ=255) tGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATcacca < 2:4385297/150‑1 (MQ=255) gACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATcaccac < 2:4155388/150‑1 (MQ=255) aCGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCaccacc > 2:3048631/1‑150 (MQ=255) aCGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCaccacc < 2:1991589/150‑1 (MQ=255) gAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGc > 1:1344957/1‑150 (MQ=255) gAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGc > 2:2018058/1‑150 (MQ=255) aaTACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGcc < 1:2908970/150‑1 (MQ=255) tACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTg > 1:3617212/1‑150 (MQ=255) aCTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTgg > 2:1278739/1‑150 (MQ=255) cTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGc > 1:3120804/1‑150 (MQ=255) cTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGc > 1:3257820/1‑150 (MQ=255) ttAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGcc > 1:1658753/1‑150 (MQ=255) tAAACTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCg < 2:3364655/150‑1 (MQ=255) tAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCTCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCg > 1:1281765/1‑150 (MQ=255) aaaaTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCgg < 1:1987877/150‑1 (MQ=255) aaaaTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCgg > 2:3669904/1‑150 (MQ=255) aaaTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGt > 1:3220569/1‑150 (MQ=255) aTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGa > 2:561609/1‑150 (MQ=255) gTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATg > 1:4024296/1‑150 (MQ=255) gTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATg < 1:329881/150‑1 (MQ=255) aTACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCg < 1:3930209/150‑1 (MQ=255) aTTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCAc < 1:2808404/150‑1 (MQ=255) tCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTaa > 2:1683307/1‑150 (MQ=255) tCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTaa > 2:938712/1‑150 (MQ=255) ccGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATAACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTaaa > 1:2493772/1‑150 (MQ=255) cGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAAc > 1:2115114/1‑150 (MQ=255) gCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAAcc > 2:2235883/1‑150 (MQ=255) ccATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAAccc < 1:4637395/150‑1 (MQ=255) aTCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGc > 2:2178613/1‑150 (MQ=255) aTCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGc > 2:2061064/1‑150 (MQ=255) tCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCa > 1:3753837/1‑150 (MQ=255) cTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCAc > 2:4592699/1‑150 (MQ=255) ttttAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCtt > 1:3838447/1‑150 (MQ=255) ttttAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTCTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCtt < 2:3254864/150‑1 (MQ=255) ttAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTa < 2:2625691/150‑1 (MQ=255) tAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTac > 2:2918997/1‑150 (MQ=255) aTCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGACATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTacac > 1:3131323/1‑150 (MQ=255) aTCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTacac > 2:1464335/1‑150 (MQ=255) aTCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTacac > 2:1412522/1‑150 (MQ=255) cATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGcc > 1:1436077/1‑150 (MQ=255) aTTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCt < 1:4062401/150‑1 (MQ=255) ggggTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAc > 1:4166363/1‑150 (MQ=255) ggggTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAc > 1:1739780/1‑150 (MQ=255) gggTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAAcc < 1:2243209/150‑1 (MQ=255) gTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAg < 1:2907373/150‑1 (MQ=255) tACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGAt > 2:1661097/1‑150 (MQ=255) tACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGAt > 2:786238/1‑150 (MQ=255) aTGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc < 1:42697/150‑1 (MQ=255) aTGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc > 2:3509819/1‑150 (MQ=255) aTGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc < 2:2381921/150‑1 (MQ=255) aTGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc > 1:3883067/1‑150 (MQ=255) aTGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc < 1:4096968/150‑1 (MQ=255) aTGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTc < 2:1113365/150‑1 (MQ=255) tctcCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGccc > 2:3673224/1‑150 (MQ=255) tcCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCag < 1:873771/150‑1 (MQ=255) cacaCTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCagag < 2:670421/150‑1 (MQ=255) acacTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGc > 1:193802/1‑150 (MQ=255) acTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAt > 1:4478900/1‑150 (MQ=255) acTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAt < 2:4530067/150‑1 (MQ=255) acTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAt < 2:1254345/150‑1 (MQ=255) acTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAt < 1:550751/150‑1 (MQ=255) acTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCAt < 2:2539758/150‑1 (MQ=255) tCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATgg > 1:2698606/1‑150 (MQ=255) cgccgcACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGtt > 1:1242848/1‑150 (MQ=255) cgccgcACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGtt < 2:150742/150‑1 (MQ=255) ccgcACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTa > 2:3892776/1‑150 (MQ=255) cgcACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCCTGGTTTAt > 2:193890/1‑150 (MQ=255) aCTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGaa > 1:3525671/1‑150 (MQ=255) ctctATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAAc < 1:2791854/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTg < 2:4301248/150‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGa > 2:2881903/1‑150 (MQ=255) tgctgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAat > 1:2432377/1‑150 (MQ=255) gctgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGTAata < 2:2300574/150‑1 (MQ=255) gctgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAata > 2:1358712/1‑150 (MQ=255) gctgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAata > 1:2750570/1‑150 (MQ=255) ctgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAatat < 2:836126/150‑1 (MQ=255) tgGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATc > 2:2413863/1‑150 (MQ=255) ggCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCa > 1:1134183/1‑150 (MQ=255) ttGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGc > 2:2785368/1‑150 (MQ=255) gtgCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAg < 1:1509027/150‑1 (MQ=255) gTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACgg < 1:2575863/150‑1 (MQ=255) tttATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCg < 1:2199898/150‑1 (MQ=255) tATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGt < 1:2336543/150‑1 (MQ=255) gTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATc < 2:4019228/150‑1 (MQ=255) gTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATc > 1:2639451/1‑150 (MQ=255) gTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATc > 2:3524356/1‑150 (MQ=255) tCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATcc > 2:158459/1‑150 (MQ=255) cATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCg > 2:2727454/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGtg > 2:4040424/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGtg < 1:779326/150‑1 (MQ=255) gCTGCACCAGATGAAATCACCCCCGCCTGGCCGGTGACTGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGtggctg < 2:3181534/150‑1 (MQ=255) tGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGtggctggc > 1:3923750/1‑150 (MQ=255) aCCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGTGGCTGGCaaa > 2:3753610/1‑150 (MQ=255) cAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGTGGCTGGCaaaaa > 2:1813431/1‑150 (MQ=255) cAGATGAAATAACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGTGGCTGGCaaaaa > 1:3445543/1‑150 (MQ=255) tGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGTGGCTGGCAAAAAGCTg > 2:2897887/1‑150 (MQ=255) aaaTCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGTGGCTGGCAAAAAGCTGGa > 2:1546537/1‑150 (MQ=255) caccacCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGTGGCTGGCAAAAAGCTGGACTCa > 2:2492971/1‑150 (MQ=255) | GTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATGCCGCTGCACCAGATGAAATCACCACCGCCTGGCCGGTGAATGTCGGGCCACTAAACCCGCACCTTTACACGCCTAACCAGATGTTCGCCCAGAGCATGGTTTATGAACCATTGGTGAAATATCAGGCAGACGGTTCGGTGATCCCGTGGCTGGCAAAAAGCTGGACTCA > CP009273/3606962‑3607259 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |