Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,640,170 | C→A | 14.5% | A171E (GCG→GAG) | gor → | glutathione oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,640,170 | 0 | C | A | 14.5% | 1014.5 / 100.9 | 309 | A171E (GCG→GAG) | gor | glutathione oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (143/121); new base A (27/18); total (170/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
AACGCTGGAGGTAAACGGCGAAACCATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCGAAGTGATGAACGCCG > CP009273/3640021‑3640319 | cTGGAGGTAAACGGCGAAACCATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGgtt > 2:2186151/1‑150 (MQ=255) gTAAACGGCGAAACCATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGgc < 1:1002945/150‑1 (MQ=255) aaaCGGCGAAACCATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGgcgc > 2:404135/1‑150 (MQ=255) aCGGCGAAACCATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCgg > 2:1799173/1‑150 (MQ=255) ggCGAAACCATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGt < 1:1913971/150‑1 (MQ=255) gCGAAACCATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGtt > 1:2646440/1‑150 (MQ=255) gCGAAACCATCACGGCCGATCAGATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGtt < 1:3120444/150‑1 (MQ=255) ccATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCg < 2:2679806/150‑1 (MQ=255) cATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGc < 1:4022069/150‑1 (MQ=255) tCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCg > 2:1671161/1‑150 (MQ=255) tCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCg > 1:1129282/1‑150 (MQ=255) ggCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGAGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGa > 1:4599529/1‑150 (MQ=255) gCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAg > 1:1341802/1‑150 (MQ=255) cGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTTATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCt < 2:340365/150‑1 (MQ=255) cGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCt > 1:2508565/1‑150 (MQ=255) aTCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTgg > 2:1249054/1‑150 (MQ=255) tCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTggc > 1:4191007/1‑150 (MQ=255) cATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTggcg > 1:2758289/1‑150 (MQ=255) atTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTggcgggc > 1:230209/1‑150 (MQ=255) tCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGt > 1:2875834/1‑150 (MQ=255) tCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATAGTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGGGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGt < 2:4475145/150‑1 (MQ=255) gATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGAt > 2:2183602/1‑150 (MQ=255) aTCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGAtt > 1:1203970/1‑150 (MQ=255) aTCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGAtt < 1:2062487/150‑1 (MQ=255) aTCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGAtt > 1:2207397/1‑150 (MQ=255) tCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTa > 2:512014/1‑150 (MQ=255) aGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCt > 2:3697930/1‑150 (MQ=255) ggCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTc < 2:1064445/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCg < 1:3501790/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCg < 1:1151974/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCg < 2:3244335/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGATTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCg < 1:483174/150‑1 (MQ=255) cGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCgg < 2:4357537/150‑1 (MQ=255) ggTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGgc < 2:3293235/150‑1 (MQ=255) cgtcCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGcgcg < 2:1515039/150‑1 (MQ=255) cgtcCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGcgcg > 2:2827020/1‑150 (MQ=255) tcCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGaa < 1:1421998/150‑1 (MQ=255) cACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCAt > 2:1572648/1‑150 (MQ=255) cACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCAt > 1:3129987/1‑150 (MQ=255) cACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCAt < 1:595182/150‑1 (MQ=255) cACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCAt < 2:3255256/150‑1 (MQ=255) aCCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATc > 2:379421/1‑150 (MQ=255) ggATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGtt > 1:2595286/1‑150 (MQ=255) atatTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTtg > 2:4161568/1‑150 (MQ=255) tatTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTtgt < 1:3661239/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCg < 2:919239/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCg < 2:3552279/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGt > 2:2123558/1‑150 (MQ=255) cGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACa > 1:632676/1‑150 (MQ=255) cGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACa > 1:3576027/1‑150 (MQ=255) tGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATg < 2:3657182/150‑1 (MQ=255) tGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATg > 1:346696/1‑150 (MQ=255) ggAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATgc > 2:2847370/1‑150 (MQ=255) gAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATgcg > 1:4456674/1‑150 (MQ=255) aTACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGcgcc > 2:945794/1‑150 (MQ=255) aTACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGcgcc > 2:3342525/1‑150 (MQ=255) aTACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGcgcc < 2:3394495/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCt < 1:3715237/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCt > 1:3803023/1‑150 (MQ=255) cGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCt < 2:2280340/150‑1 (MQ=255) ggTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTg > 2:3820927/1‑150 (MQ=255) gTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTgc > 2:3084667/1‑150 (MQ=255) tATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTgcg < 1:3737476/150‑1 (MQ=255) tATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTgcg > 1:1958085/1‑150 (MQ=255) tGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAg > 1:3786693/1‑150 (MQ=255) gATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGc > 2:1141752/1‑150 (MQ=255) aTTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCt > 2:78512/1‑150 (MQ=255) aTTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCt > 2:3147125/1‑150 (MQ=255) tCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTc < 2:1375982/150‑1 (MQ=255) tCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTc < 2:2544880/150‑1 (MQ=255) tCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTc > 1:4130813/1‑150 (MQ=255) cTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCg < 1:2694323/150‑1 (MQ=255) tGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGa < 2:3023165/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGAcc < 2:4523153/150‑1 (MQ=255) ggCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCg > 2:1743867/1‑150 (MQ=255) ggCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGGTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCg > 2:2065764/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCgatg > 2:3676240/1‑150 (MQ=255) cttcGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCgatgat > 2:1300693/1‑150 (MQ=255) tcGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGAttt < 2:4215648/150‑1 (MQ=255) tcGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGAttt < 1:4204406/150‑1 (MQ=255) tcGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGAttt < 2:2395452/150‑1 (MQ=255) gCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTcc < 1:3960193/150‑1 (MQ=255) gCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTcc < 2:3858025/150‑1 (MQ=255) gCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTcc > 1:1123989/1‑150 (MQ=255) gCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTcc < 2:4498873/150‑1 (MQ=255) cccTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCg > 1:3909674/1‑150 (MQ=255) ccTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGa > 1:970659/1‑150 (MQ=255) ccTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGa > 1:761984/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGaa > 1:3309851/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGaaa > 2:2888636/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTTATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAAc < 1:1249054/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTgg < 1:1647686/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTgg < 2:1661212/150‑1 (MQ=255) tGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCg < 2:2460019/150‑1 (MQ=255) ccAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCGaa > 2:716943/1‑150 (MQ=255) agagCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCGAAGt < 1:4243704/150‑1 (MQ=255) agagCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCGAAGt < 1:147167/150‑1 (MQ=255) gagCGCGTGGAGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCGAAGtg < 1:1871447/150‑1 (MQ=255) agCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCGAAGtga < 2:2020686/150‑1 (MQ=255) cGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCGAAGTGATGAACGCCg < 1:3400761/150‑1 (MQ=255) | AACGCTGGAGGTAAACGGCGAAACCATCACGGCCGATCATATTCTGATCGCCACAGGCGGTCGTCCGAGCCACCCGGATATTCCGGGCGTGGAATACGGTATTGATTCTGATGGCTTCTTCGCCCTTCCTGCTTTGCCAGAGCGCGTGGCGGTTGTTGGCGCGGGTTACATCGCCGTTGAGCTGGCGGGCGTGATTAACGGCCTCGGCGCGAAAACGCATCTGTTTGTGCGTAAACATGCGCCGCTGCGCAGCTTCGACCCGATGATTTCCGAAACGCTGGTCGAAGTGATGAACGCCG > CP009273/3640021‑3640319 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |