| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,838,587 | T→A | 19.4% | S422T (TCC→ACC) | ade → | cryptic adenine deaminase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,838,587 | 0 | T | A | 19.4% | 726.6 / 164.5 | 293 | S422T (TCC→ACC) | ade | cryptic adenine deaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (95/141); new base A (30/27); total (125/168) | |||||||||||
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Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
AAGAGTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGCACTCCCACTCCAGCGTCTACAGCGAAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTC > CP009273/3838438‑3838736 | agagTCGGCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGcactc > 1:2849766/1‑150 (MQ=255) ggCGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGcactcccactc < 2:3130313/150‑1 (MQ=255) cGAGACTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGCACTCCCACTCCa > 1:4626529/1‑150 (MQ=255) 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gaCTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGCACTCCCACTCCAGCg < 1:3339621/150‑1 (MQ=255) gaCTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGCACTCCCACTCCAGCg < 1:1485374/150‑1 (MQ=255) gaCTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGCACTCCCACTCCAGCg < 1:1733567/150‑1 (MQ=255) cTGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGCACTCCCACTCCAGCGTc > 2:3008772/1‑150 (MQ=255) tGGCACAATCCGCTCCGCCATATGGCAACACCATTGCCCGCCAGCCAGTTTCCGCCAGCGACTTTGCCCTGCAATTTACGCCCGGAAAACGCTATCGGGTCATTGACGTCATCCATAACGAATTGATTACGCACTCCCACTCCAGCGTCt > 1:3949082/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |