| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,933,204 | C→T | 5.3% | D257N (GAT→AAT) | hsrA ← | putative multidrug or homocysteine efflux system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,933,204 | 0 | C | T | 5.3% | 955.6 / 25.3 | 263 | D257N (GAT→AAT) | hsrA | putative multidrug or homocysteine efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (129/120); new base T (6/8); total (135/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
CGGTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACAAGG > CP009273/3933055‑3933352 | cGGTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATc < 2:3347907/150‑1 (MQ=255) ggTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCt > 1:4654/1‑150 (MQ=255) ggTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCt > 1:1372621/1‑150 (MQ=255) ggTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCt > 1:23732/1‑150 (MQ=255) gCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAAt < 2:1492994/150‑1 (MQ=255) tcatACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGaaa < 2:3410542/150‑1 (MQ=255) aCAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTaa > 2:3213469/1‑150 (MQ=255) aCAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTaa > 2:2266717/1‑150 (MQ=255) cagccatcAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAAt < 2:1556651/150‑1 (MQ=255) cagccagcAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAAt < 2:1805132/150‑1 (MQ=255) agccagcAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATg < 1:2586733/150‑1 (MQ=255) cagcAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGt < 1:2004372/150‑1 (MQ=255) agcAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGtt < 2:1889273/150‑1 (MQ=255) gcAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGttt < 1:573429/150‑1 (MQ=255) cAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTg < 1:4017262/150‑1 (MQ=255) aaTAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTgg < 1:3424243/150‑1 (MQ=255) tAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcg < 1:1440456/150‑1 (MQ=255) aaaCGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcgt < 1:1267515/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcgtg > 1:947675/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcgtgc < 1:2031815/150‑1 (MQ=255) gCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcgtgcgt < 2:4039878/150‑1 (MQ=255) tGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGcgtcgt > 1:877753/1‑150 (MQ=255) tGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGcgtcgt > 2:3676208/1‑150 (MQ=255) tGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGcgtcgt > 1:2494600/1‑150 (MQ=255) gATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTg > 1:791884/1‑150 (MQ=255) aaCCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCAt < 2:2412100/150‑1 (MQ=255) cAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGga < 1:1032088/150‑1 (MQ=255) aaaTCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGgag > 1:3554014/1‑150 (MQ=255) aaTCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGgaga > 1:4364477/1‑150 (MQ=255) cTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATagag < 1:2124912/150‑1 (MQ=255) tGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAgaga > 1:964648/1‑150 (MQ=255) tGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAgaga < 1:2965736/150‑1 (MQ=255) aCATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCTTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCa < 1:4286836/150‑1 (MQ=255) aCATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCTTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCa < 1:4286954/150‑1 (MQ=255) aCATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCa > 2:700079/1‑150 (MQ=255) aaTGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAAc > 1:1483485/1‑150 (MQ=255) gCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGa < 2:3877065/150‑1 (MQ=255) tAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGc < 1:812725/150‑1 (MQ=255) aaGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCt > 1:1118094/1‑150 (MQ=255) aaGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCt < 2:2940180/150‑1 (MQ=255) aaGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATAGTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCt < 2:1632290/150‑1 (MQ=255) aGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTg > 1:4486040/1‑150 (MQ=255) ggAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTgg < 2:351345/150‑1 (MQ=255) gAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGTGAAGCAGTAACCCGATGCTGGt > 2:2716245/1‑150 (MQ=255) gAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGt > 2:4023203/1‑150 (MQ=255) aaCGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCCTGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTg > 2:2328713/1‑150 (MQ=255) aaCGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTg > 2:20978/1‑150 (MQ=255) ggTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACa > 2:3173945/1‑150 (MQ=255) acaGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTAc > 1:4011173/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCg > 1:4112610/1‑150 (MQ=255) cGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCa > 1:829397/1‑150 (MQ=255) gTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAg < 1:1146732/150‑1 (MQ=255) tCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAgg < 1:3117130/150‑1 (MQ=255) ccccAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGc > 2:2541177/1‑150 (MQ=255) aGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATc < 2:4337206/150‑1 (MQ=255) gACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATcc > 1:1687973/1‑150 (MQ=255) aCGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCa < 1:3246130/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAg > 1:1597847/1‑150 (MQ=255) cGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGACAATCCAg < 1:626858/150‑1 (MQ=255) cttGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTATAAATAAATCTAATGACATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAAGTACCGTCAAGGCAATCCAGCTg > 2:28163/2‑150 (MQ=255) ttGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTgg > 2:787416/1‑150 (MQ=255) tGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGc > 2:2661308/1‑150 (MQ=255) tGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGc > 1:3698147/1‑150 (MQ=255) gCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCg < 2:3804551/150‑1 (MQ=255) atTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAAt < 2:4401815/150‑1 (MQ=255) tACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTc > 1:4443255/1‑150 (MQ=255) aCGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTcc < 2:2049826/150‑1 (MQ=255) gATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTcccc > 2:2500995/1‑150 (MQ=255) gATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTcccc > 2:3006608/1‑150 (MQ=255) aTACCGATCGAGAAAGTGCGGTTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCg < 1:1409911/150‑1 (MQ=255) tACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGa > 1:741767/1‑150 (MQ=255) aCCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGaa < 2:1707470/150‑1 (MQ=255) gATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAg > 2:3583118/1‑150 (MQ=255) aTCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGc < 2:4132944/150‑1 (MQ=255) aTCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGc > 2:216980/1‑150 (MQ=255) tCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGct > 2:3639546/1‑150 (MQ=255) cGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGctc < 2:672289/150‑1 (MQ=255) gagaAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCATCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGctct > 2:334421/1‑150 (MQ=255) agaAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTa < 2:1423145/150‑1 (MQ=255) agaAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTa < 1:224944/150‑1 (MQ=255) gaAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTAt > 2:273689/1‑150 (MQ=255) aaaGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTAtt > 2:116718/1‑150 (MQ=255) aaaGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTATTCCCCGAATAGCTCTAtt > 2:1312843/1‑150 (MQ=255) aaaGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTAtt < 2:1767726/150‑1 (MQ=255) aaaGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTAtt > 2:3856086/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGc > 1:1484518/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGc < 2:589287/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCtt > 2:144263/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCtt > 2:4611751/1‑150 (MQ=255) ggTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTga < 2:924138/150‑1 (MQ=255) ttAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTgagaag < 1:974052/150‑1 (MQ=255) taaataaaTCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTgagaaga > 2:1410590/1‑150 (MQ=255) aaataaatCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTgagaagag > 2:3256482/1‑150 (MQ=255) aataaatCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTgagaagaga < 1:2072418/150‑1 (MQ=255) ataaatCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTgagaagagaa > 2:4187977/1‑150 (MQ=255) taaatCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAAc < 1:2735006/150‑1 (MQ=255) aaatCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACa > 1:100741/1‑150 (MQ=255) aaatCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACa > 2:3102377/1‑150 (MQ=255) aaatCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGAAGTAACCCGATGATGGTGACAATTACCGTCAAGGCAAACCAGCTGGCGACAATCTTTTCCACGAATAGCTCTATACCGCTTGAGAAGAGAACa > 2:400642/1‑150 (MQ=255) tCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCTATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACAAgg > 1:1858547/1‑150 (MQ=255) | CGGTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACAAGG > CP009273/3933055‑3933352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |