Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,128,613 | G→T | 11.0% | I117I (ATC→ATA) | gldA ← | glycerol dehydrogenase, NAD+ dependent; 1,2‑propanediol:NAD+ oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,128,613 | 0 | G | T | 11.0% | 1072.5 / 69.1 | 298 | I117I (ATC→ATA) | gldA | glycerol dehydrogenase, NAD+ dependent; 1,2‑propanediol:NAD+ oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (140/125); new base T (22/11); total (162/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
GCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAAC > CP009273/4128464‑4128761 | gccgcTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCg < 1:4266466/150‑1 (MQ=255) ccgcTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGa < 1:1710459/150‑1 (MQ=255) cgcTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGAt < 1:1141271/150‑1 (MQ=255) cTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCTGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAg < 2:2759583/150‑1 (MQ=255) cTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAg > 1:3914062/1‑150 (MQ=255) tAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGt < 1:825882/150‑1 (MQ=255) aaCAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTc > 1:2837043/1‑150 (MQ=255) aaCAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTc > 1:7001/1‑150 (MQ=255) cAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCgg > 2:3066472/1‑150 (MQ=255) gACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTg < 1:4202509/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGAt < 1:3216930/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAGTGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATc < 2:1478741/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATc < 2:681438/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCg < 1:2776527/150‑1 (MQ=255) aGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGc > 1:2949255/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCt < 2:2046255/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTa > 1:3400173/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTAc < 1:4479724/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTAcc < 1:4292156/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCg > 1:1669306/1‑150 (MQ=255) cgcCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCg < 1:4111468/150‑1 (MQ=255) gcCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCgg > 2:3619955/1‑150 (MQ=255) ccAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGa > 1:3425666/1‑150 (MQ=255) cgacgaTTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAacac > 1:2392099/1‑150 (MQ=255) cgacgaTTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAacac > 2:169341/1‑150 (MQ=255) cgaTTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCa > 2:2102465/1‑150 (MQ=255) gaTTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCAt > 1:1182868/1‑150 (MQ=255) aTTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGTTAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATg < 2:2742683/150‑1 (MQ=255) ttttGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGa > 2:2642918/1‑150 (MQ=255) tttGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGaa < 2:2566915/150‑1 (MQ=255) gtgtCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAAtgt > 1:1050296/1‑150 (MQ=255) tCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGcc < 1:3242864/150‑1 (MQ=255) cGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCa < 2:3841312/150‑1 (MQ=255) cAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTg < 1:3579785/150‑1 (MQ=255) aaTGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGc > 1:6243/1‑150 (MQ=255) gACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCttt < 2:2666796/150‑1 (MQ=255) gACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCttt > 1:1814652/1‑150 (MQ=255) gACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCttt > 1:106065/1‑150 (MQ=255) atTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGt > 1:3698396/1‑150 (MQ=255) cGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATc < 1:3827431/150‑1 (MQ=255) gggTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCg > 2:4098738/1‑150 (MQ=255) gggTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCg > 2:3405800/1‑150 (MQ=255) ggTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGa > 2:3722009/1‑150 (MQ=255) gTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAg > 2:3178362/1‑150 (MQ=255) ttATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAgg > 1:4008369/1‑150 (MQ=255) tGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGtttt < 1:1388085/150‑1 (MQ=255) cAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTcc < 1:3288441/150‑1 (MQ=255) cAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTcc > 2:4402668/1‑150 (MQ=255) cAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTcc < 2:1738134/150‑1 (MQ=255) cAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTcc > 2:2305305/1‑150 (MQ=255) cAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTcc > 2:1844362/1‑150 (MQ=255) aaCAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTCTCGAGGGTTTTTCCg > 2:4573877/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGACATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGc > 2:770615/1‑150 (MQ=255) agcagATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCa > 2:2018197/1‑150 (MQ=255) cagATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCAcc < 2:3330249/150‑1 (MQ=255) agATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCg > 1:799296/1‑150 (MQ=255) agATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCg > 2:4462080/1‑150 (MQ=255) agATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCg > 1:2367581/1‑150 (MQ=255) agATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCg > 1:482610/1‑150 (MQ=255) gATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGa < 2:1109807/150‑1 (MQ=255) tAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATa < 1:1036477/150‑1 (MQ=255) gCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATAcc < 2:326587/150‑1 (MQ=255) gCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCACCACCGATAcc < 1:3615170/150‑1 (MQ=255) cGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCg < 1:2467509/150‑1 (MQ=255) cAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGaa < 2:2405979/150‑1 (MQ=255) aaaCTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACCATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAAt > 2:897898/1‑150 (MQ=255) aaCTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAAtt > 2:613123/1‑150 (MQ=255) aaCTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAAtt < 2:852190/150‑1 (MQ=255) aCCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGcc > 1:1255880/1‑150 (MQ=255) ccTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcac < 1:3723999/150‑1 (MQ=255) ccTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATAGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcac > 2:541979/1‑150 (MQ=255) cTCATCGGTGTAGATAACAGACACTGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcaca < 2:2228677/150‑1 (MQ=255) cTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcaca > 2:3599267/1‑150 (MQ=255) tCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCacac > 2:1294970/1‑150 (MQ=255) aTCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTg < 1:3728392/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTg < 1:2803540/150‑1 (MQ=255) tAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGtc < 1:4536042/150‑1 (MQ=255) tAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGtc < 1:1483567/150‑1 (MQ=255) aGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGtct > 2:158067/1‑150 (MQ=255) aCAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCcgcg < 2:2984571/150‑1 (MQ=255) aGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGAt > 2:2234102/1‑150 (MQ=255) aaTGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCa > 2:4323141/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCAc > 2:4612280/1‑150 (MQ=255) tGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACg > 1:3325533/1‑150 (MQ=255) cgcTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCa < 1:2548171/150‑1 (MQ=255) cGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTc < 1:1901671/150‑1 (MQ=255) ggTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCg > 2:1436120/1‑150 (MQ=255) ggTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCg < 1:1927967/150‑1 (MQ=255) ggTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCg > 2:2150237/1‑150 (MQ=255) ggTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCg > 1:355766/1‑150 (MQ=255) ggTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCg > 1:3593555/1‑150 (MQ=255) gTGCATCGGTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGa < 1:742297/150‑1 (MQ=255) gCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGAtc > 1:2599967/1‑150 (MQ=255) cATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTTCCGGAACACCCATGAAATGTGACAGTGATTTGGCAGTATCGAGTGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGAtct < 1:4427130/150‑1 (MQ=255) ggTAGAGGCTATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAtt < 1:2237715/150‑1 (MQ=255) ggTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAtt < 2:1624287/150‑1 (MQ=255) ggTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAtt > 2:153753/1‑150 (MQ=255) ggTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAtt < 2:1009545/150‑1 (MQ=255) gTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAttt < 1:3125872/150‑1 (MQ=255) ggCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGa < 2:3954790/150‑1 (MQ=255) | GCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAAC > CP009273/4128464‑4128761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |