| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,144,163 | C→A | 11.9% | A205S (GCT→TCT) | argE ← | acetylornithine deacetylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,144,163 | 0 | C | A | 11.9% | 1153.6 / 84.2 | 332 | A205S (GCT→TCT) | argE | acetylornithine deacetylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (151/141); new base A (19/21); total (170/162) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
CAAATACGGTTAGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGTAGTTT > CP009273/4144015‑4144309 | cAAATACGGTTAGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCg > 2:4363932/1‑150 (MQ=255) aaaTACGGTTAGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGt > 2:2148898/1‑150 (MQ=255) aaTACGGTTAGAATCGTCGCCACAGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCAATGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTAAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATTGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGtt < 2:152929/150‑1 (MQ=255) aaTACGGTTAGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGtt < 1:158337/150‑1 (MQ=255) tACGGTTAGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTaa < 1:1737060/150‑1 (MQ=255) ggTTAGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTc > 2:3588393/1‑150 (MQ=255) gTTAGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTcc < 2:1816879/150‑1 (MQ=255) aGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGTTAACTCcgcg > 1:277092/1‑150 (MQ=255) cGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTg > 1:1202991/1‑150 (MQ=255) gTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTgg < 2:2623179/150‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGa < 1:1492330/150‑1 (MQ=255) cGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGAt > 1:3099870/1‑150 (MQ=255) gCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATc > 2:1301112/1‑150 (MQ=255) gCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATc > 1:2257550/1‑150 (MQ=255) cACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGc > 1:2659302/1‑150 (MQ=255) aCCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCt < 1:600902/150‑1 (MQ=255) gAATATGCCCGAGGGTGAGCGTAGGGGATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGt < 2:2517692/150‑1 (MQ=255) atatGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGc < 2:3728998/150‑1 (MQ=255) tatGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGcc < 1:4316220/150‑1 (MQ=255) atGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGccc < 2:2098556/150‑1 (MQ=255) tGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGcccc < 2:688587/150‑1 (MQ=255) tGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGcccc < 2:1651703/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGAc > 2:1219219/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTg > 1:3362566/1‑150 (MQ=255) gTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGcc > 1:4029740/1‑150 (MQ=255) gTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGcc < 2:2261028/150‑1 (MQ=255) ttGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGccc < 1:625340/150‑1 (MQ=255) ttGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGccc > 2:881708/1‑150 (MQ=255) tGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCt < 1:1761819/150‑1 (MQ=255) gAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTg < 2:2002258/150‑1 (MQ=255) aGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGa < 1:4632950/150‑1 (MQ=255) gTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATa < 2:2563952/150‑1 (MQ=255) tAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATAc < 2:3808191/150‑1 (MQ=255) tAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATAc > 1:107924/1‑150 (MQ=255) tAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATAc > 2:2330140/1‑150 (MQ=255) tATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATg < 2:3262682/150‑1 (MQ=255) aCGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTa < 1:3591212/150‑1 (MQ=255) aCGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTa > 2:93835/1‑150 (MQ=255) aCGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTa > 2:3012024/1‑150 (MQ=255) gTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTagag < 2:1791496/150‑1 (MQ=255) aaaCGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGat < 2:73500/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGatat < 2:3973674/150‑1 (MQ=255) cGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATg < 1:384755/150‑1 (MQ=255) cGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATg < 1:2846260/150‑1 (MQ=255) gCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGa > 2:544458/1‑150 (MQ=255) gCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGa > 2:1726091/1‑150 (MQ=255) cGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCtt < 2:3853404/150‑1 (MQ=255) tAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTa < 1:3284523/150‑1 (MQ=255) aGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTAt > 1:4401693/1‑150 (MQ=255) aGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTAt > 1:190276/1‑150 (MQ=255) aGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCGTTAt > 1:4084902/1‑150 (MQ=255) tAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTgcg < 2:3544821/150‑1 (MQ=255) gTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTa > 2:2125804/1‑150 (MQ=255) ttCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTAc < 1:994639/150‑1 (MQ=255) tCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTAcc < 2:495482/150‑1 (MQ=255) tttCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCgg > 1:3456228/1‑150 (MQ=255) cAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTg < 2:3143412/150‑1 (MQ=255) aGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGt > 2:2439082/1‑150 (MQ=255) ggTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTa < 1:421436/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGa > 1:3689176/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCAATTGCAAAATAGGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTGCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGACCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGa < 2:2802351/150‑1 (MQ=255) cgcAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTc < 1:2976025/150‑1 (MQ=255) cgcAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTc > 1:3199213/1‑150 (MQ=255) cAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCgg > 1:1970467/1‑150 (MQ=255) aaTTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGt > 2:4158253/1‑150 (MQ=255) atggCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGtt < 1:764885/147‑1 (MQ=255) ttGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTc < 2:2919946/150‑1 (MQ=255) ttGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTc < 2:1124317/150‑1 (MQ=255) tGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCg < 2:2953015/150‑1 (MQ=255) aaaaTATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCa < 1:134055/150‑1 (MQ=255) aaaTATGCCCGCTGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTATCTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCaa < 2:4559115/150‑1 (MQ=255) aaaTATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCaa > 2:149557/1‑150 (MQ=255) ctatGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAatg < 1:4468312/149‑1 (MQ=255) tGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAatgatg > 1:2209731/1‑150 (MQ=255) cccGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGgc > 1:1007015/1‑150 (MQ=255) gATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCa > 1:2896065/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATc > 2:3906103/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATc > 1:2518448/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATc > 2:3444208/1‑150 (MQ=255) gCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATcc < 2:54984/150‑1 (MQ=255) gCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATcc < 2:759150/150‑1 (MQ=255) gtcgtGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCgg > 2:1351219/1‑150 (MQ=255) cgtGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGgc > 2:4195512/1‑150 (MQ=255) cATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAg < 2:1409242/150‑1 (MQ=255) aTTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAgg > 2:1285877/1‑150 (MQ=255) tAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCACTCCGGGCGCAGGGc > 2:4445484/1‑150 (MQ=255) tAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGc < 1:3548117/150‑1 (MQ=255) aGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCg > 1:2350587/1‑150 (MQ=255) aGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCg > 1:3800632/1‑150 (MQ=255) aGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCg < 1:2493052/150‑1 (MQ=255) aGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCg < 2:2673824/150‑1 (MQ=255) aGTTCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCg < 1:3426229/150‑1 (MQ=255) ttCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGt > 2:1876442/1‑150 (MQ=255) ttCGATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGt < 2:277092/150‑1 (MQ=255) tCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGGAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGTa < 1:617547/150‑1 (MQ=255) gATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGTAGt > 1:1667049/1‑150 (MQ=255) gATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGTAGt > 2:866212/1‑150 (MQ=255) gATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGTAGt > 1:3965576/1‑150 (MQ=255) gATAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTAGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGTAGt > 1:2077623/1‑150 (MQ=255) tAGAGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGTAGttt < 1:1650205/150‑1 (MQ=255) | CAAATACGGTTAGAAGCGTCGCCACCGTGAATATGCCCGAGGTTGAGCGTAGGGTATGGCACGGTAAACGCTTCGTAGTGATAACGTTCTTTCAGGTTATCGCGCAATTGCAAAATATGCCCGATGGCGTCGTGCATTAGTTCGATAGCGTTAACTCCGCGTGCTGGATCGCTGGAGTGCCCCGACTGGCCCTGAATACGGATGGCGTTAGAGATATGACCTTTATGTGCGCGTACCGGTTGTAGTGACGTCGGTTCGCCAATGATGGCGCAATCCGGGCGCAGGGCGGTAGTTT > CP009273/4144015‑4144309 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |