Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,219,550 | C→A | 7.8% | R174L (CGT→CTT) | pepE ← | (alpha)‑aspartyl dipeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,219,550 | 0 | C | A | 7.8% | 994.3 / 36.3 | 262 | R174L (CGT→CTT) | pepE | (alpha)‑aspartyl dipeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (113/128); new base A (10/11); total (123/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
CAGCGGAACCGCTTCTTCACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGGCAAGCAAG > CP009273/4219402‑4219698 | cAGCGGAACCGCTTCTTCACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCCGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACg < 2:1235087/150‑1 (MQ=255) aGCGGAACCGCTTCTTCACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACgc > 2:3528190/1‑150 (MQ=255) gCGGAACCGCTTCTTCACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACgct < 2:132435/150‑1 (MQ=255) ggAACCGCTTCTTCACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACgctgc > 2:2032244/1‑150 (MQ=255) gAACCGCTTCTTCACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACgctgct > 1:328754/1‑150 (MQ=255) ttcttcACCATCCTTATACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGTCCTTTACTATGTGTGATCCTGTTACCTTCCGGTATACCAATAATAGTCAGTTCTGGCGCGACTACCAGCTGTTCGCGAATAAGATGCTCACTGGt < 2:744712/150‑1 (MQ=255) tcACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCa > 2:2991386/1‑150 (MQ=255) cACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCTTCAGTTCAGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCAc > 1:272273/1‑150 (MQ=255) aGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCttt > 1:1828116/1‑150 (MQ=255) gCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTa < 1:3828597/150‑1 (MQ=255) ttAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATgg > 1:1377627/1‑150 (MQ=255) ttAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATgg > 1:3485384/1‑150 (MQ=255) ttAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTGTATgg > 2:2136586/1‑150 (MQ=255) tAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGc > 1:1227222/1‑150 (MQ=255) aaCACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATACTCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCt < 2:1886772/150‑1 (MQ=255) aaCACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCt < 2:1674805/150‑1 (MQ=255) aaCACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCt < 2:4145843/150‑1 (MQ=255) aaCACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATAAGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCt < 2:2260548/150‑1 (MQ=255) acacATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCtt > 2:208689/1‑150 (MQ=255) ctcaTAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATACTCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTc < 1:4302211/148‑1 (MQ=255) cacaTAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTc < 1:540399/150‑1 (MQ=255) caTAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCg > 1:2694097/1‑150 (MQ=255) aTAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCgg < 1:57746/150‑1 (MQ=255) aaGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATAAGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCa < 1:2944350/150‑1 (MQ=255) aGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAg < 1:2594846/150‑1 (MQ=255) tggtgTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAgcg < 2:1883473/150‑1 (MQ=255) tggtgTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAgcg > 2:3344726/1‑150 (MQ=255) gtgtTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATAAGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGcgcg < 1:4435077/150‑1 (MQ=255) gtTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGtt < 2:4133713/150‑1 (MQ=255) gtTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGtt < 1:383336/150‑1 (MQ=255) cGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGt < 1:2576811/150‑1 (MQ=255) cGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGt > 1:117602/1‑150 (MQ=255) ggCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGa < 1:2111955/150‑1 (MQ=255) gCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGaa < 2:4606158/150‑1 (MQ=255) cACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTGTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGt > 2:4534757/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTg > 1:414200/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATAAGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTg > 2:4535028/1‑150 (MQ=255) agcgtagcgtGACCTTTACTCACTGTGATCCTGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCggg < 1:1484155/150‑1 (MQ=255) gtagcgtGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCGCGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTg < 1:2021090/150‑1 (MQ=255) tagcgtGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGa < 1:3429692/150‑1 (MQ=255) tagcgtGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGa > 2:2663232/1‑150 (MQ=255) agcgtGACCTTTACTCCCTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGTCGACCAGCAGTTCGCTAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGTCAGCGCGTTGTTGAAGTGCGGGTTGAt < 2:4499670/150‑1 (MQ=255) agcgtGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGAt > 2:3118730/1‑150 (MQ=255) agcgtGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGAt > 2:1086494/1‑150 (MQ=255) gtGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTg < 1:663515/150‑1 (MQ=255) gACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCa < 1:4017900/150‑1 (MQ=255) gACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCa < 2:1002568/150‑1 (MQ=255) aCCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAg > 1:1146069/1‑150 (MQ=255) cTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAAc > 1:498313/1‑150 (MQ=255) cTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATAAGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAAc < 1:3926217/150‑1 (MQ=255) cACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAg < 1:2403352/150‑1 (MQ=255) cACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAg > 1:1650924/1‑150 (MQ=255) cACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATAAGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAg > 2:1265196/1‑150 (MQ=255) tgtgATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGACGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGAtt > 2:479897/1‑150 (MQ=255) tgATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTa < 1:4522882/150‑1 (MQ=255) gATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAg > 2:2858706/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAgc < 1:2979051/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATAAGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAgc > 1:738302/1‑150 (MQ=255) tCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAgcg > 1:3694846/1‑150 (MQ=255) cAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCa > 1:2842470/1‑150 (MQ=255) ttACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATAAGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCg < 2:813540/150‑1 (MQ=255) aCCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGaa < 1:4186450/150‑1 (MQ=255) cTTCCGGTAGACCAATCATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAAc < 1:801974/150‑1 (MQ=255) ttCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAAcc < 2:3851966/150‑1 (MQ=255) ggTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGc > 1:4260328/1‑150 (MQ=255) gTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCg > 1:3182445/1‑150 (MQ=255) gTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCg > 1:2838038/1‑150 (MQ=255) aGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGa > 1:1343504/1‑150 (MQ=255) aCCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATc < 1:1631703/150‑1 (MQ=255) aCCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATc > 2:2280892/1‑150 (MQ=255) ccAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCg < 2:40146/150‑1 (MQ=255) cAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGa > 2:4425000/1‑150 (MQ=255) ataatCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACa < 1:1503350/150‑1 (MQ=255) taatCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACaa < 2:4413711/150‑1 (MQ=255) atCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATc < 1:2564058/150‑1 (MQ=255) tCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCg < 1:2448141/150‑1 (MQ=255) tCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCg < 2:279993/150‑1 (MQ=255) cGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCgg < 1:3743184/150‑1 (MQ=255) cAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCat < 1:2474328/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATc < 2:4239469/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATc < 2:545891/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATc < 1:218418/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATc < 2:1989207/150‑1 (MQ=255) ggCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTtg < 2:1458661/150‑1 (MQ=255) gacgacCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTggtggt > 1:2856581/1‑150 (MQ=255) acgacCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTa < 2:3468335/150‑1 (MQ=255) acgacCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTa < 2:3744683/150‑1 (MQ=255) gacCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACg < 2:3162654/150‑1 (MQ=255) gacCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACg > 1:4320340/1‑150 (MQ=255) gacCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTGTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAATAGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACACATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGAACGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACg > 2:666628/1‑150 (MQ=255) cagcagTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAAt < 2:1489393/150‑1 (MQ=255) cagTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGt > 1:904541/1‑150 (MQ=255) cgcgAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGgc < 1:2616257/150‑1 (MQ=255) cgcgAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGgc > 1:1034277/1‑150 (MQ=255) gAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGAGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGgcaag < 2:3004016/150‑1 (MQ=255) aTACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGgcaagca > 1:850443/1‑150 (MQ=255) aTACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGgcaagca > 1:1291444/1‑150 (MQ=255) tACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGgcaagcaa < 1:83482/150‑1 (MQ=255) tACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGgcaagcaa < 1:3573558/150‑1 (MQ=255) aCGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGGcaagcaag < 1:4549057/150‑1 (MQ=255) | CAGCGGAACCGCTTCTTCACCAGCCTTAAACACATAAGTGGTGTTCGGGCCACCCAGCGTAGCGTGACCTTTACTCACTGTGATCCAGTTACCTTCCGGTAGACCAATAATCGTCAGTTCTGGCGCGACGACCAGCAGTTCGCGAATACGCTGCTCACGGGTTTCACCTTTATGGCCTTCCGGCAGCGCGTTGGTGAAGTGCGGGTTGATTTGCAGCGGGAACAGATTTAGCGCATCGAAACCTTGCGGATCGACAATCGGCATATCGTTGGTGGTACGAATAGTTGGGCAAGCAAG > CP009273/4219402‑4219698 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |