Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,257,593 | C→T | 11.8% | N184N (AAC→AAT) | tyrB → | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,257,593 | 0 | C | T | 11.8% | 746.2 / 65.5 | 238 | N184N (AAC→AAT) | tyrB | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (108/102); new base T (14/14); total (122/116) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
AGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAG > CP009273/4257446‑4257742 | aGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAAccc < 2:3292420/150‑1 (MQ=255) gCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCa < 1:1082533/150‑1 (MQ=255) gCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCa < 1:693271/150‑1 (MQ=255) cAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCaa > 1:3820098/1‑150 (MQ=255) atatTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACg < 1:1111501/150‑1 (MQ=255) atatTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACg > 1:1662826/1‑150 (MQ=255) cGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGc < 1:2549638/150‑1 (MQ=255) ggggCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGAt > 2:128019/1‑150 (MQ=255) gCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGAtctc < 1:2931469/150‑1 (MQ=255) cTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCa < 2:1994720/150‑1 (MQ=255) cTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCa < 2:292178/150‑1 (MQ=255) ttCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAAt > 2:4485186/1‑150 (MQ=255) cGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGa < 2:3649846/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGa < 1:616494/150‑1 (MQ=255) aaGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATc > 1:4351971/1‑150 (MQ=255) aaGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATc > 1:2839247/1‑150 (MQ=255) aGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCa > 1:1788802/1‑150 (MQ=255) gTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAg > 1:2155268/1‑150 (MQ=255) gAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTg < 2:4042782/150‑1 (MQ=255) aGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTgg > 1:1562498/1‑150 (MQ=255) ttACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGc > 1:4221018/1‑150 (MQ=255) tACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCg < 2:538444/150‑1 (MQ=255) tACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCg < 1:4569167/150‑1 (MQ=255) ccccTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGt > 2:1558111/1‑150 (MQ=255) tGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGAtt > 1:3168583/1‑150 (MQ=255) ggTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGAGCTGTTGGCGGCGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTg > 2:1193097/1‑150 (MQ=255) ggTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTg < 1:4018301/150‑1 (MQ=255) gACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAAtt < 2:4209084/150‑1 (MQ=255) gACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAAtt < 1:990138/150‑1 (MQ=255) gACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAAtt < 1:3632251/150‑1 (MQ=255) aCGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtc > 2:3514400/1‑150 (MQ=255) aCGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtc > 2:4554802/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtct > 2:178151/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtct < 2:1935310/150‑1 (MQ=255) cGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtct > 1:1252571/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtct < 2:1508641/150‑1 (MQ=255) gAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtctc > 1:3499768/1‑150 (MQ=255) gAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATtctc > 1:1422348/1‑150 (MQ=255) aaGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCa > 2:591833/1‑150 (MQ=255) gCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCaaa < 1:2094918/150‑1 (MQ=255) cGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAg > 1:693441/1‑150 (MQ=255) gACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGc < 2:2873284/150‑1 (MQ=255) gACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGc > 1:1377062/1‑150 (MQ=255) gACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGc < 2:3042676/150‑1 (MQ=255) tAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCcg > 2:2034852/1‑150 (MQ=255) tAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCcg > 2:4159660/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTCATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAg < 2:3768289/150‑1 (MQ=255) cGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCt < 1:3968606/150‑1 (MQ=255) cGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCt < 1:1644457/150‑1 (MQ=255) cGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCt < 2:1931351/150‑1 (MQ=255) gTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCtt > 1:3345495/1‑150 (MQ=255) tGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTa > 1:915821/1‑150 (MQ=255) tttAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattcca < 2:1625855/150‑1 (MQ=255) ttaaaTGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTCATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattcca > 1:1423342/4‑150 (MQ=255) ttAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattccat < 1:4186710/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattccattcc < 2:1120085/150‑1 (MQ=255) tGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCt > 1:2283022/1‑150 (MQ=255) tGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCt > 1:2463271/1‑150 (MQ=255) tGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCt > 1:4420343/1‑150 (MQ=255) gACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTc < 2:3154535/150‑1 (MQ=255) cTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGat < 1:3997760/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGatat < 1:267839/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGatat < 2:1730764/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGACGCTGAAAACAGTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGatat < 1:2061608/150‑1 (MQ=255) ttGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATAtt > 1:989530/1‑150 (MQ=255) ttGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATAtt > 2:2272722/1‑150 (MQ=255) gACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTa < 2:70993/150‑1 (MQ=255) gACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTa > 1:3200960/1‑150 (MQ=255) aaaaCATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGa > 1:3945402/1‑150 (MQ=255) aaaCATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGAt > 2:4288569/1‑150 (MQ=255) aCATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGAttt < 1:2213973/150‑1 (MQ=255) aCATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGAttt < 2:4432895/150‑1 (MQ=255) ttACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGt > 2:1258688/1‑150 (MQ=255) 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cATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCt > 2:1228048/1‑150 (MQ=255) ccATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTAtt < 1:1864836/150‑1 (MQ=255) cATGTTGCCACAATCCAACGGGTTCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTc < 2:3820098/150‑1 (MQ=255) cATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTc > 2:908192/1‑150 (MQ=255) cATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTc < 1:130767/150‑1 (MQ=255) aTGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTcg < 1:4464409/150‑1 (MQ=255) ccACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCAt < 2:513771/150‑1 (MQ=255) cacaACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCAtt > 2:2123559/1‑150 (MQ=255) acaATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTg > 1:2022408/1‑150 (MQ=255) aaCCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGcc > 1:764088/1‑150 (MQ=255) aCCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCa < 1:3655817/150‑1 (MQ=255) cccAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAg < 1:3571821/150‑1 (MQ=255) | AGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAG > CP009273/4257446‑4257742 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |