| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,259,065 | C→A | 25.3% | intergenic (‑125/‑277) | yjbS ← / → aphA | uncharacterized protein/acid phosphatase/phosphotransferase, class B, non‑specific |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,259,065 | 0 | C | A | 25.3% | 598.3 / 162.7 | 256 | intergenic (‑125/‑277) | yjbS/aphA | uncharacterized protein/acid phosphatase/phosphotransferase, class B, non‑specific |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (80/111); new base A (25/40); total (105/151) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TGCTATTCACATATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTGGGTTAAATATAATCAT > CP009273/4258916‑4259214 | tgCTATTCACATATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATc > 2:167302/1‑150 (MQ=255) cTATTCACATATGATATCTTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGt > 2:1748437/1‑150 (MQ=255) tATTCACATATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTa < 1:4343247/150‑1 (MQ=255) tATTCACATATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTa > 2:1512870/1‑150 (MQ=255) aTTCACATATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTAc > 2:1260156/1‑150 (MQ=255) ttCACATATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTAca > 1:1040895/1‑150 (MQ=255) acaTATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTAcagca < 2:1854634/150‑1 (MQ=255) caTATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTAcagcag > 2:4029691/1‑150 (MQ=255) caTATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGGAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTAcagcag > 2:4545660/1‑150 (MQ=255) tatGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGAt < 1:2806788/150‑1 (MQ=255) atGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATa < 2:3728576/150‑1 (MQ=255) gATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATaaa > 2:2026411/1‑150 (MQ=255) atatTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGt > 1:142570/1‑150 (MQ=255) atatTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGt > 1:1042257/1‑150 (MQ=255) tatTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGtt < 1:591513/150‑1 (MQ=255) atTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTc < 1:485544/150‑1 (MQ=255) ttCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCt < 2:4187179/150‑1 (MQ=255) tCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTa > 2:1906480/1‑150 (MQ=255) tCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTa < 1:411609/150‑1 (MQ=255) tcatcatcTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCaaa > 1:342430/1‑150 (MQ=255) catcTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTc < 1:1605841/150‑1 (MQ=255) atcTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCg < 2:697506/150‑1 (MQ=255) tcCATCGCGAGTAATAAAATTAAACACCAATGTAGGTTAGGGGGCTGGTAAATAAGAAATCATCATTAAAAACATCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTAATAAAAACAAACAGAAGATAAATATTCTATCAAAtttatcac > 1:4256817/1‑145 (MQ=255) cATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCAt > 1:3325905/1‑150 (MQ=255) cATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCAt < 2:269594/150‑1 (MQ=255) cgcgAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTg > 1:3055349/1‑150 (MQ=255) gcgAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGc < 2:3207638/150‑1 (MQ=255) cgAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGcc < 1:1757507/150‑1 (MQ=255) cgAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGcc < 2:1604364/150‑1 (MQ=255) cgAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGcc < 1:2811615/150‑1 (MQ=255) cgAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGcc < 2:4435849/150‑1 (MQ=255) aTTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATtcatc < 1:3104420/150‑1 (MQ=255) aTTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATtcatc < 2:2948413/150‑1 (MQ=255) tAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTcatcat < 2:1439901/150‑1 (MQ=255) tAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTcatcat < 2:1574491/150‑1 (MQ=255) tAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTcatcat < 2:521601/150‑1 (MQ=255) aaTCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCata < 2:2784328/150‑1 (MQ=255) aTTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACg < 1:2718382/150‑1 (MQ=255) agggtagggGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTaaaa > 2:1178183/1‑150 (MQ=255) tagggGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTaa > 1:1141332/1‑150 (MQ=255) gggggCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTTCAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATg < 1:2472988/150‑1 (MQ=255) gggggCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATg > 2:443456/1‑150 (MQ=255) ggggCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGt > 2:4234306/1‑150 (MQ=255) cTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATcc < 2:3884990/150‑1 (MQ=255) ggTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCtt < 1:1915728/150‑1 (MQ=255) ggTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCtt > 2:3788825/1‑150 (MQ=255) ggTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTAATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCtt > 2:2076321/1‑150 (MQ=255) cAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACa > 1:1885479/1‑150 (MQ=255) cAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACa < 1:492177/150‑1 (MQ=255) cAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACa > 1:4070300/1‑150 (MQ=255) aaTCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACAt < 1:4586273/150‑1 (MQ=255) aTCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATc > 1:986459/1‑150 (MQ=255) tCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCg > 2:2491430/1‑150 (MQ=255) cAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGa < 2:1142651/150‑1 (MQ=255) cAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGa < 1:3856956/150‑1 (MQ=255) aGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAg > 2:300415/1‑150 (MQ=255) aGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAg < 1:1807336/150‑1 (MQ=255) gAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGt > 1:3583218/1‑150 (MQ=255) gAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGt < 1:3656424/150‑1 (MQ=255) aaaTCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGta < 1:4533444/150‑1 (MQ=255) atcatcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATTCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGtaat < 2:2709754/150‑1 (MQ=255) atcatcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGtaat < 2:4080902/150‑1 (MQ=255) atcatcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGtaat < 1:2350165/150‑1 (MQ=255) atcatcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGtaat < 1:2564577/150‑1 (MQ=255) atcatcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGtaat < 1:2350202/150‑1 (MQ=255) tcatcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGtaata < 2:21964/150‑1 (MQ=255) tcatcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGtaata < 1:4426895/150‑1 (MQ=255) catcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGtaataa > 1:2839152/1‑150 (MQ=255) atcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATaaa > 1:3175888/1‑150 (MQ=255) tcTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTTTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAAc < 1:1745899/150‑1 (MQ=255) tataAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACAttt < 1:1163593/150‑1 (MQ=255) taAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACAttttt < 1:3001183/150‑1 (MQ=255) taAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACAttttt < 1:3046259/150‑1 (MQ=255) aCTTCGATTGTTTTTGTAACGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTtat < 2:3710639/150‑1 (MQ=255) ttCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATAc < 2:3490313/150‑1 (MQ=255) tCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACa < 1:4171123/150‑1 (MQ=255) tCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACa < 2:447405/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACaaaa > 2:850699/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACaaaa > 2:3307173/1‑150 (MQ=255) tttttGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAg < 2:2375337/150‑1 (MQ=255) tGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAg < 2:2956067/150‑1 (MQ=255) gTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAgg < 1:3350636/150‑1 (MQ=255) gTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAgg > 2:3924775/1‑150 (MQ=255) tAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGa < 2:2557882/150‑1 (MQ=255) aaTGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGaa < 1:2669063/150‑1 (MQ=255) aaTGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGaa > 2:3488053/1‑150 (MQ=255) aTGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAAc < 2:3158210/150‑1 (MQ=255) tGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTAt < 2:4281173/150‑1 (MQ=255) aTCATTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTa < 1:3524219/150‑1 (MQ=255) tCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTAc > 1:2030270/1‑150 (MQ=255) cATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACt < 1:958845/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTg < 1:3800807/150‑1 (MQ=255) tAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTggg < 1:2156408/150‑1 (MQ=255) aaGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTGGGt < 2:3465939/150‑1 (MQ=255) aaGTTCATTAAATAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACGGGAACGTATTTACTGGGt < 1:4347691/150‑1 (MQ=255) tCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTGGGTTaaa < 1:1205808/150‑1 (MQ=255) ttAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTGGGTTAAatat > 1:1678129/1‑150 (MQ=255) aaTCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTGGGTTAAATATAat < 1:4201479/150‑1 (MQ=255) aaTAGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTGGGTTAAATATAat < 2:4624067/150‑1 (MQ=255) aTCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTGGGTTAAATATAatc < 2:1788282/150‑1 (MQ=255) | TGCTATTCACATATGATATATTCATATCATCATCTCCATCGCGAGTAATAAAATTAATCACCATTGTAGGGTAGGGGGCTGGTCAATCAGAAATCATCTTTATAAACTTCGATTGTTTTTGTAATGCTGTATCATTAAGTTCATTAAATCGTACAGCAGATAAATGTTCTATCAAATTTCGCTCATTTGCCGAGGATTCATCATAATAAACGTAAAATTAATGTATCCTTACATCGAGTAATAAACATTTTTTATACAAAAAAAGACAGGAACGTATTTACTGGGTTAAATATAATCAT > CP009273/4258916‑4259214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |