| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,266,665 | G→T | 19.0% | D423Y (GAT→TAT) | yjcC → | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,266,665 | 0 | G | T | 19.0% | 844.9 / 134.0 | 289 | D423Y (GAT→TAT) | yjcC | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (107/127); new base T (31/24); total (138/151) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
TAGCGCGAATCAATCAGAAAACAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGAGCTGGCGCACAGCCT > CP009273/4266516‑4266813 | cgAATCAATCAGAAAACAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGAtttt > 1:3645678/1‑150 (MQ=255) gAATCAATCAGAAAACAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTg < 1:4497823/150‑1 (MQ=255) caatcaGAAAACAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTAt < 1:76121/150‑1 (MQ=255) cttaataCAGAGCTATTGGCGGTGCGTCCGCAGCAATTTATATTTGTAGTGTCTGTGCTTGCATTTCTTGATGTTGTCATTATGTCGCCGATTATTGTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCATTTGATGATTTTGGTATTggg < 2:1437836/144‑2 (MQ=255) caGAAAACAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGc > 1:2490609/1‑150 (MQ=255) aGAAAACAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCt > 2:582689/1‑150 (MQ=255) gAAAACAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTa < 2:1836919/150‑1 (MQ=255) aaaCAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTAct < 1:4376796/150‑1 (MQ=255) aaaCAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTAct < 2:2968244/150‑1 (MQ=255) aaCAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTActc < 1:3906482/150‑1 (MQ=255) aCAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTActct < 1:3822967/150‑1 (MQ=255) gCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACtt < 2:419388/150‑1 (MQ=255) gCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACtt < 2:4023394/150‑1 (MQ=255) gCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACtt < 2:1236259/150‑1 (MQ=255) cAATCCGCGGTGCGTCCGCAGAAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGTCAGGTTACGAAGTGGCAATTTATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTg < 1:1024644/150‑1 (MQ=255) gcgGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAAc < 1:1067160/150‑1 (MQ=255) cgGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAAcc > 2:689233/1‑150 (MQ=255) ggTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCt > 1:999686/1‑150 (MQ=255) cGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTaaa > 1:2533071/1‑150 (MQ=255) cGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTaaa < 2:117103/150‑1 (MQ=255) gTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAAt > 2:3438981/1‑150 (MQ=255) tCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATc > 2:4462317/1‑150 (MQ=255) tCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATc < 1:3312010/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCa < 1:3365055/150‑1 (MQ=255) cGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCAt > 1:467550/1‑150 (MQ=255) cGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCAt < 2:2693442/150‑1 (MQ=255) gcagcaAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCAtt < 2:736266/150‑1 (MQ=255) cagcaAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATCTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTg < 1:1946568/150‑1 (MQ=255) caAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAAt > 1:1248523/1‑150 (MQ=255) aaattaaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATg > 2:2364310/1‑150 (MQ=255) aaattaaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATg > 1:357922/1‑150 (MQ=255) aattaaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTCAATCATTGAATGt > 2:4371828/1‑150 (MQ=255) aattaaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGt < 1:428944/150‑1 (MQ=255) attaaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTc > 1:836736/1‑150 (MQ=255) ttaaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCg < 1:2858248/150‑1 (MQ=255) ttaaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCg < 1:546422/150‑1 (MQ=255) taaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGa > 1:2120520/1‑150 (MQ=255) taaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGa > 1:666289/1‑150 (MQ=255) aaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGat > 1:2920418/1‑150 (MQ=255) aaattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGat > 1:2192714/1‑150 (MQ=255) aattTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTAAGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGata > 1:896149/1‑150 (MQ=255) attTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGatat < 1:2354662/150‑1 (MQ=255) tttGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATAtt < 1:4483169/150‑1 (MQ=255) tttGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATAtt < 1:2855294/150‑1 (MQ=255) tttGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATAtt < 2:4258270/150‑1 (MQ=255) tttGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATAtt < 2:4419407/150‑1 (MQ=255) tttGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATAtt < 2:4073/150‑1 (MQ=255) tGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATAtttt < 2:1795406/150‑1 (MQ=255) gAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTg > 2:2501748/1‑150 (MQ=255) aaGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGa > 1:4220018/1‑150 (MQ=255) aaGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGa > 2:2451247/1‑150 (MQ=255) aGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGaa > 1:4151538/1‑150 (MQ=255) aGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACa < 1:3046307/150‑1 (MQ=255) aGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACa < 1:2832933/150‑1 (MQ=255) atgcatTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAAt > 2:4508590/1‑150 (MQ=255) tccatTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATc < 2:2952303/148‑1 (MQ=255) gcatTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCg > 1:2555423/1‑150 (MQ=255) gcatTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCg < 1:2719594/150‑1 (MQ=255) catTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGt > 2:1920224/1‑150 (MQ=255) catTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGt > 2:2998515/1‑150 (MQ=255) catTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGt < 2:3035807/150‑1 (MQ=255) catTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGt > 2:3839392/1‑150 (MQ=255) atTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATATTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGACGATATTTTGAAAATCGACAAATCgat > 1:2435768/1‑148 (MQ=255) tttCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGttt < 1:1132259/150‑1 (MQ=255) ttGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTttgttg < 1:942414/150‑1 (MQ=255) gATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGaa > 2:2594663/1‑150 (MQ=255) aTGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGaaa < 2:2938892/150‑1 (MQ=255) tGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAAc < 2:3758851/150‑1 (MQ=255) tGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCt < 2:3249044/150‑1 (MQ=255) tGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGAccaccc < 1:2004792/150‑1 (MQ=255) cGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCcaca < 1:2996648/150‑1 (MQ=255) cGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCcaca < 2:3960777/150‑1 (MQ=255) gCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACaa > 2:1653295/1‑150 (MQ=255) gCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACaa > 2:4346663/1‑150 (MQ=255) attCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGt > 2:2603709/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTc < 2:4333115/150‑1 (MQ=255) cTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCAt > 2:158333/1‑150 (MQ=255) cTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCAt < 1:4533239/150‑1 (MQ=255) cTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCAt > 1:149684/1‑150 (MQ=255) tGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCAtt > 2:133452/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCAttt < 2:2747674/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCAgtt > 1:157651/1‑150 (MQ=255) tttCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGAt > 1:3977327/1‑150 (MQ=255) tttCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGAt < 2:557661/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGAtt < 2:475449/150‑1 (MQ=255) cGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCg > 1:4168621/1‑150 (MQ=255) cGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCg > 2:2064325/1‑150 (MQ=255) caggcaggTTACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGaa > 2:4129763/1‑150 (MQ=255) ggcaggTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAaca < 1:4445307/150‑1 (MQ=255) gcaggTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAacac < 2:3216074/150‑1 (MQ=255) ggTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACAcatc > 1:959371/1‑150 (MQ=255) ttACGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACAcatcat > 1:139418/1‑150 (MQ=255) ttACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACAcatcat < 2:1341997/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGa > 1:3200622/1‑150 (MQ=255) gAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGAg > 1:1625498/1‑150 (MQ=255) aaGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGAGc > 1:1507095/1‑150 (MQ=255) aGTGGCAATTGATTATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGAGCt > 2:4309078/1‑150 (MQ=255) cAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGAGCTGgcgc > 2:1511391/1‑150 (MQ=255) gatgatTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGAGCTGGCGCACAGc > 2:3771188/1‑150 (MQ=255) tgatTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGAGCTGGCGCACAGCCt < 1:260915/150‑1 (MQ=255) | TAGCGCGAATCAATCAGAAAACAGAGCAATACGCGGTGCGTCCGCAGCAAATTAAATTTGAAGTGACTGAGCATGCATTTCTTGATGTTGACAAAATGACGCCGATTATTCTGGCTTTCCGCCAGGCAGGTTACGAAGTGGCAATTGATGATTTTGGTATTGGCTACTCTAACTTGCATAACCTTAAATCATTGAATGTCGATATTTTGAAAATCGACAAATCGTTTGTTGAAACGCTGACCACCCACAAAACCAGTCATTTGATTGCGGAACACATCATCGAGCTGGCGCACAGCCT > CP009273/4266516‑4266813 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |